| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 362,372 | G→C | 5.9% | D45E (GAC→GAG) ‡ | PP_0301 ← | betainyl‑CoA thiolase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 362,372 | 0 | G | C | 5.9% | 219.0 / 3.0 | 68 | D45E (GAC→GAG) ‡ | PP_0301 | betainyl‑CoA thiolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (32/32); new base C (2/2); total (34/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.55e-01 | |||||||||||
GGCTGTGATACACGTGAAGACGCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTGGTCTCCTTAA > NC_002947/362224‑362520 | ggCTGTGATACACGTGAAGACGCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCg < 8:37614/149‑1 (MQ=255)ggCTGTGATACACGTGAAGACGCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCg > 8:129697/1‑149 (MQ=255) acacGTGAAGACGCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGcc > 3:216417/1‑148 (MQ=255) gTGAAGACGCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGc > 4:233266/1‑149 (MQ=255) aaGACGCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGt < 3:233266/149‑1 (MQ=255) gCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGCAAAATGAGATTAATATGCCCAACCAGCTTAAAAACCAATTAACCGATTTCCCCCCGGATAAGGGGGACCAGCCCGATGCggac > 1:218787/1‑146 (MQ=255) ttGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCAAt > 6:38856/1‑146 (MQ=255) gATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCCTGGACGCCGAtag < 8:240671/135‑3 (MQ=255) gATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCCTGGACGCCGAtag > 7:240671/1‑133 (MQ=255) aTCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCAt < 7:129697/149‑1 (MQ=255) aaaGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCCTGGACGCCGAtagc < 1:197145/132‑4 (MQ=255) aaaGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCCTGGACGCCGAtagc > 2:197145/1‑129 (MQ=255) aaGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGt > 1:247325/1‑149 (MQ=255) gCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTgg > 3:212543/1‑149 (MQ=255) gAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCg > 3:126615/1‑148 (MQ=255) gAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGt < 5:15981/149‑1 (MQ=255) ggATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTa < 4:33287/148‑1 (MQ=255) gATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGc < 4:260963/149‑1 (MQ=255) cACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATcag < 4:98544/147‑1 (MQ=255) cACCCACACCTCCGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTCAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATcag < 4:94756/147‑1 (MQ=255) ccACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCaga < 1:7271/118‑1 (MQ=255) ccACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCaga > 2:7271/1‑118 (MQ=255) ccACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATcagc < 4:247225/145‑1 (MQ=255) ccACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATcagc > 3:247225/1‑145 (MQ=255) ccACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAgg > 6:7874/1‑148 (MQ=255) ccACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGCTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAgg > 2:20665/1‑148 (MQ=255) ccACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATAGGTTGCGTAGCTGAAGATCAGCAgg > 4:169572/1‑148 (MQ=255) ccTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAg > 1:81873/1‑149 (MQ=255) cTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCgg > 6:244088/1‑103 (MQ=255) cTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAgg > 5:189061/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCACCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCa < 5:232293/148‑1 (MQ=255) cccAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCACCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATcgcg > 2:21854/1‑149 (MQ=255) ccAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGTCCGATGCCGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATagcg > 2:50742/1‑148 (MQ=255) ccAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTa > 1:253827/1‑136 (MQ=255) ccAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTa < 2:253827/136‑1 (MQ=255) aGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAg < 4:212543/149‑1 (MQ=255) cTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGt < 2:24964/149‑1 (MQ=255) tCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTATGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGtt > 1:202182/1‑149 (MQ=255) tGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGt > 6:4929/1‑148 (MQ=255) gC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGa < 3:48658/108‑1 (MQ=255) gC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGa > 4:48658/1‑108 (MQ=255) c‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTaa < 4:126615/148‑1 (MQ=255) aaaT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATc < 6:189061/149‑1 (MQ=255) aaaT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATc < 6:151740/149‑1 (MQ=255) t‑a‑atTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAg > 4:215506/1‑120 (MQ=255) t‑a‑atTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAg < 3:215506/120‑1 (MQ=255) atTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCaga > 7:189209/1‑82 (MQ=255) atTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCaga < 8:189209/82‑1 (MQ=255) atTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGAcc < 2:218787/148‑1 (MQ=255) gCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCgtg < 4:216417/149‑1 (MQ=255) cGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCgtgg > 2:110743/1‑149 (MQ=255) gAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGc > 6:147045/1‑149 (MQ=255) gTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGa > 3:4977/1‑149 (MQ=255) ttACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGGGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGAt < 3:169572/149‑1 (MQ=255) ttGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCACGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCgg < 2:247325/149‑1 (MQ=255) tGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGTATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCgg < 2:81873/148‑1 (MQ=255) tGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCgg < 5:147045/148‑1 (MQ=255) ccggcgGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGTAGATCAGCAGGTTGAAGGGATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGTCGCTGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCa < 1:50742/146‑1 (MQ=255) cccGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCa > 5:215577/1‑149 (MQ=255) ccGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCgg > 2:226182/1‑129 (MQ=255) ccGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCgg < 1:226182/129‑1 (MQ=255) ccGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCAt > 1:267342/1‑149 (MQ=255) cgGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCtt < 5:7874/149‑1 (MQ=255) tgCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATATGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCGTTTGTAATCTACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTTCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTg < 1:20665/148‑1 (MQ=255) tATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTGGtc > 3:133549/1‑149 (MQ=255) cGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTg < 6:205705/143‑1 (MQ=255) cGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTg > 5:205705/1‑143 (MQ=255) cGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTGGTCTcc > 1:31587/1‑149 (MQ=255) ggCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTGGTCTcc < 5:4929/148‑1 (MQ=255) ggCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTGGTCTcc < 1:110743/148‑1 (MQ=255) gTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTGGTCTCCTTaa < 2:202182/149‑1 (MQ=255) | GGCTGTGATACACGTGAAGACGCTTGCGATCAAAGCCGAGGATCTGTGTCTGCACCCACACCTCGGTGCCCAGCTTCACCTCGTGC‑AAAT‑A‑ATTGATATGCGCCTCCAGCGTGAACAGCGAGTTACCGCTTTGCCCGCGGCTATCGGCGTCCAGGCCGATGCGGTCCATCAGAGCATCGGTGGCGTAGCTGAAGATCAGCAGGTAGAAGGCATCGCGCAGGTGGCCGTTGTAATCGACCCAGTCCTCCTGGACCGTGGTGCGGTAGGTGATCAGAGCGGGCATCTTGGTCTCCTTAA > NC_002947/362224‑362520 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |