| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,385,477 | Δ1 bp | 7.9% | coding (401/576 nt) | PP_2093 ← | two‑component system response regulator NasT |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,385,477 | 0 | T | . | 7.9% | 197.6 / 11.2 | 63 | coding (401/576 nt) | PP_2093 | two‑component system response regulator NasT |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/29); new base . (3/2); total (32/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.85e-01 | |||||||||||
TTCGGCAACCTGGATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGCATCATCCCGGG > NC_002947/2385335‑2385625 | ttCGGCAACCTGGATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTcgcgcg > 8:126369/1‑149 (MQ=255)ttCGGCAACCTGGATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTc < 6:2235/144‑1 (MQ=255) ggCAACCTGGATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCgcgcg‑c > 3:220449/1‑147 (MQ=255) cTGGATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCt < 1:9379/149‑1 (MQ=255) gATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGG‑CGCGCGACcagcaat > 6:95812/1‑143 (MQ=255) gATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGG‑CGCGCGACcagcaat < 5:95812/145‑3 (MQ=255) aTCAGCTTCTGCTGCCGGCTCCTGGCCTGGCGTCGGCTCAGGCGGTAGGCCGGCTCGTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCACCAAGCCCTTGGCCTGCCCGTTGCGGTTGCGTTCGGCCAAATTCCGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGc < 7:198918/149‑1 (MQ=255) gCTTCTGCTGCTGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTc > 2:50528/1‑149 (MQ=255) cTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCa < 2:174419/149‑1 (MQ=255) ctgcCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGcc < 6:248246/148‑1 (MQ=255) ctgcCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGcc < 7:126369/148‑1 (MQ=255) cATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCttt > 7:180236/1‑149 (MQ=255) aTGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTc > 7:160294/1‑149 (MQ=255) tGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCtt > 1:270158/1‑146 (MQ=255) gCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGaa > 8:70818/1‑149 (MQ=255) ccTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAg < 4:220449/149‑1 (MQ=255) cTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGc < 8:160294/149‑1 (MQ=255) gCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCgg < 6:114358/148‑1 (MQ=255) gCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCgg < 4:166350/148‑1 (MQ=255) cGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGc < 2:270158/149‑1 (MQ=255) aCGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCtt < 3:44962/120‑1 (MQ=255) aCGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCtt > 4:44962/1‑120 (MQ=255) aTCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATgg < 8:15624/148‑1 (MQ=255) aTCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATgg > 7:15624/1‑148 (MQ=255) aGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCAc < 8:58307/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGAt > 6:134597/1‑149 (MQ=255) gCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCAGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCggg < 4:172110/130‑1 (MQ=255) gCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCAGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCggg > 3:172110/1‑130 (MQ=255) ccTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGaa < 1:10646/124‑1 (MQ=255) ccTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGaa > 2:10646/1‑124 (MQ=255) ccTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATc < 7:70818/149‑1 (MQ=255) ctTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCtgt > 7:91510/1‑92 (MQ=255) ctTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCtgt < 8:91510/92‑1 (MQ=255) gTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGcc > 4:102728/1‑149 (MQ=255) cAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCcgcg > 8:227399/1‑148 (MQ=255) aGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCcgcg > 7:76782/1‑147 (MQ=255) cTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCAt < 1:50528/149‑1 (MQ=255) ttCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATg > 3:199571/1‑149 (MQ=255) ttCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATg > 4:264180/1‑149 (MQ=255) cATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATgg < 8:180236/148‑1 (MQ=255) tcaGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTTCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTc > 1:225740/1‑148 (MQ=255) gCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTcgac > 6:319955/1‑148 (MQ=255) gCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTcgac > 4:206865/1‑148 (MQ=255) aGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGata < 5:319955/149‑1 (MQ=255) gCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCg < 6:19755/90‑1 (MQ=255) gCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCg > 5:19755/1‑90 (MQ=255) gCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGata > 7:89906/1‑148 (MQ=255) ccTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAg < 7:227399/149‑1 (MQ=255) gCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCAc < 4:199571/148‑1 (MQ=255) tGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAg > 7:167365/1‑141 (MQ=255) tGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAg < 8:167365/141‑1 (MQ=255) gATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCcctg > 2:57538/1‑149 (MQ=255) gTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGAcc < 4:272682/134‑1 (MQ=255) gTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGAcc > 3:272682/1‑134 (MQ=255) ccAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTcg < 4:232915/110‑1 (MQ=255) ccAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTcg > 3:232915/1‑110 (MQ=255) ccAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGgcgc < 3:264180/149‑1 (MQ=255) acagctGCTGG‑CGCGCGACCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGa > 6:95456/6‑126 (MQ=255) acagctGCTGG‑CGCGCGACCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGa < 5:95456/121‑1 (MQ=255) aaTTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGcat > 7:89828/1‑149 (MQ=255) ctGCTGG‑CGCGCGACCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGcatca > 5:304883/2‑149 (MQ=255) tGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGCATCATccc > 8:43550/1‑149 (MQ=255) gTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGCATCATCCCg < 2:225740/148‑1 (MQ=255) tCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGCATCATCCCggg < 7:43550/149‑1 (MQ=255) tCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGACACGTCCAGGATCGGCTGCAGACGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGAACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGCATCATccagat > 3:75334/1‑145 (MQ=255) | TTCGGCAACCTGGATCAGCTTCTGCTGCCGGCTCATGGCCTGGCGACGCATCAGGGTGTAGGCCTGCTCTTCGTTGCAGTCCTTCATTTTCATCAGCAAGCCCTTGGCCTGCTCGATGCGCTTGCGTTCGGCCAATTGCTGGTCGCGCG‑CCAGCAGCTGTGCCTTCAGTGCCTGGTCGCTTTCGAAGCGGGCCATGGCCACGTCCAGGATCGGCTGCAGCCGCGCAGCATGGATACCTTCGACGATATAGGCACTGACCCCTGCCTGGATCGCCTGGCGCATCATCCCGGG > NC_002947/2385335‑2385625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |