Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 508,778:1 | +G | 7.7% | coding (233/1890 nt) | estP ← | esterase EstP |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 508,778 | 1 | . | G | 7.7% | 247.2 / 16.3 | 65 | coding (233/1890 nt) | estP | esterase EstP |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (31/29); new base G (2/3); total (33/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.72e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.91e-01 |
GGGTTTCCTGGGGGGATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTCGCCAAACACGATCAGGGTTGA > NC_002947/508634‑508926 | gggTTTCCTGGGGGGATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAg < 2:54381/149‑1 (MQ=255) gggTTTCCTGGGGGGATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACC‑ACGGATGTCGACGGGTTAAGCTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAg < 1:51078/148‑1 (MQ=255) ccTGGGGGGCTGACGGTCTCGGACGTTCTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAggcggc < 5:73043/148‑1 (MQ=255) cTGGGGGGATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGG‑GCGTCGCGCCAGGCGAcc < 3:79476/148‑1 (MQ=255) tGGGGGGATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGcc > 5:78429/1‑147 (MQ=255) gggggATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGcc < 6:78429/145‑1 (MQ=255) ggggATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGCCGCCTGG‑GCGTCGCGCCAggcga > 8:72200/1‑141 (MQ=255) ggggATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGCCGCCTGG‑GCGTCGCGCCAggcga < 7:279023/142‑2 (MQ=255) ggggATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGCCGCCTGG‑GCGTCGCGCCAggcga < 7:72200/142‑2 (MQ=255) ggggATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGCCGCCTGG‑GCGTCGCGCCAggcga > 8:279023/1‑141 (MQ=255) gACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGc‑c < 5:34921/129‑1 (MQ=255) gACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGc‑c > 6:34921/1‑129 (MQ=255) gACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAgg > 5:17706/1‑145 (MQ=255) gACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAgg < 6:17706/145‑1 (MQ=255) ggTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGa < 5:258161/140‑1 (MQ=255) ggTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGa > 6:258161/1‑140 (MQ=255) ctcGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGatcatc > 7:228408/1‑145 (MQ=255) ctcGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGatcatc < 8:228408/145‑1 (MQ=255) ggACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGaca > 5:80720/1‑149 (MQ=255) aCGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACAcc > 3:52149/1‑149 (MQ=255) gATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACCAAGCGGGCTGGAAACCTACGCATTTCGACGGTTTAAGTACCCATGGCGCGCCGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGAACATCGCCGCCACCGGGGCGaat > 1:86449/1‑148 (MQ=255) aTCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGtt < 6:80720/149‑1 (MQ=255) tCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAgg < 8:133776/117‑1 (MQ=255) tCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAgg > 7:133776/1‑117 (MQ=255) tCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAg < 3:31268/116‑1 (MQ=255) tCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAg > 4:31268/1‑116 (MQ=255) ccAGGATCTGCTGGGTGCAGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATAACC‑ATCGGGCTGCATACCTACGCATGTCGACGGCTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGAGAAGTTGCAGTCg > 8:241117/1‑149 (MQ=255) aGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGaa < 6:273412/137‑1 (MQ=255) aGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGaa > 5:273412/1‑137 (MQ=255) gATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGt > 5:49275/1‑149 (MQ=255) ctgGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGt > 2:309802/1‑149 (MQ=255) gggTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTg < 1:309802/149‑1 (MQ=255) tggtgTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATGCCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTg < 2:78913/149‑1 (MQ=255) gtgtACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGa > 3:5832/1‑148 (MQ=255) aCCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAAcgc > 2:34765/1‑149 (MQ=255) cccGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTc < 1:47164/126‑1 (MQ=255) cccGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTc > 2:47164/1‑126 (MQ=255) cTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTgg < 6:49275/148‑1 (MQ=255) ccAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACg > 1:51757/1‑123 (MQ=255) ccAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACg < 2:51757/123‑1 (MQ=255) ttaCC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCcaac < 1:34765/149‑1 (MQ=255) cc‑ATCGGGCTGGATAACTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGAGAAGTTGCCGTAGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCcaac > 7:168999/1‑146 (MQ=255) aTCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTg > 5:112715/1‑115 (MQ=255) aTCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTg < 6:112715/115‑1 (MQ=255) aTCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCcaac > 3:57491/1‑144 (MQ=255) tCGTGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATc < 2:86449/149‑1 (MQ=255) ggCTGTATAGCTAAGGATGTCGACTGGTTATGGTCGCATGTGGCGACGC‑GCAGGCGGCCTCCGAGGATCATCGGCGACAGCGGTGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCTCCAACAAGAtggtg < 8:168999/149‑5 (MQ=255) ggCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGACTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCgg > 8:182679/1‑148 (MQ=255) cTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCggg > 7:9437/1‑74 (MQ=255) cTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCggg < 8:9437/74‑1 (MQ=255) cTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCg > 7:169675/1‑149 (MQ=255) cTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCg < 4:57491/149‑1 (MQ=255) tACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCgg > 7:16938/1‑149 (MQ=255) tACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCT‑GGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGcc < 5:287684/145‑1 (MQ=255) tACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCT‑GGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGcc > 6:287684/1‑145 (MQ=255) gTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGCCGAAGTTCCCGTCGGAGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACAGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGc > 6:278762/1‑149 (MQ=255) cGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCg > 2:230287/1‑139 (MQ=255) cGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCg < 1:230287/139‑1 (MQ=255) gACGGGTTAAGGTCGCCTGGATTGATGC‑CCAGTCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACAACGGGGCTAAGTTGCCGTCTGCGTCACGGTTTGTGAAACGCGCGCGTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGTTACTGCCGGGCTTCGGCGa < 4:5832/148‑1 (MQ=255) gTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGt < 8:169675/149‑1 (MQ=255) gTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGGCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCTAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAg < 4:41045/144‑1 (MQ=255) gTTAAGGTAGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCGAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGcgat > 3:41045/1‑146 (MQ=255) ttAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACTCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTc < 7:241117/149‑1 (MQ=255) ttAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTc > 5:122427/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTCGCCAAaca > 6:104452/1‑149 (MQ=255) gcgACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTCGCCAAACACGATCAg > 3:110010/1‑149 (MQ=255) cgACGC‑CCAGGCGGACACCGAGGATCATCGTCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTCGCCAAACACGATCAgg < 7:182679/149‑1 (MQ=255) c‑ccAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTCGCCAAACACGATCAGGGTTGa < 4:52149/149‑1 (MQ=255) | GGGTTTCCTGGGGGGATGACGGTCTCGGACGTTGTCGTGATCGAGTCCAGGATCTGCTGGGTGGTGTACCCGCCGACTGCCCAGTTATTACC‑ATCGGGCTGGATACCTACGGATGTCGACGGGTTAAGGTCGCCTGGCGCGACGC‑CCAGGCGGCCACCGAGGATCATCGGCGACACCGGGGCGAAGTTGCCGTCGGCGTCACGGTTGGTGAAACGCGCGCCTGGGGTACCGCCAACAAGATCGGGAAACTGCCCGGCATCGGCGAGGCTGTCGCCAAACACGATCAGGGTTGA > NC_002947/508634‑508926 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |