Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,355,050:1 | +C | 9.0% | coding (250/681 nt) | modB → | molybdate ABC transporter permease ModB |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,355,050 | 1 | . | C | 9.0% | 252.1 / 17.6 | 67 | coding (250/681 nt) | modB | molybdate ABC transporter permease ModB |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (33/28); new base C (2/4); total (35/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.14e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.53e-01 |
TCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGAGCCAG > NC_002947/4354907‑4355195 | tCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTg > 4:182259/1‑149 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTgg < 7:288610/148‑1 (MQ=255) gcgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTggg < 4:273639/149‑1 (MQ=255) ctcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCTCTGGTACTGCCACCGACGGTTATCGGTTTTTACCTGTTGATCGACCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggt < 7:213731/147‑2 (MQ=255) cgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggt < 2:160403/149‑2 (MQ=255) cgcgcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGGCAGGCCACCCAGGC‑CTAGCGCCTgggt < 1:231513/149‑2 (MQ=255) gcACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgt > 7:160882/1‑149 (MQ=255) aCGCGCTCTTGGCTGAGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAgtgt > 7:54530/1‑149 (MQ=255) gcTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTgtggtg > 5:139411/1‑149 (MQ=255) gcgGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGtgtg > 2:100436/1‑134 (MQ=255) gcgGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCCGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGtgtg < 1:100436/134‑1 (MQ=255) ccGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑t > 5:66994/1‑149 (MQ=255) gtgggtgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGt > 3:199600/1‑149 (MQ=255) gggtgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGa < 8:160882/149‑1 (MQ=255) ggtgCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGAt < 6:91333/149‑1 (MQ=255) cccgatctggtggCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGt < 7:72300/139‑1 (MQ=255) ggtggtGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCt < 3:182259/149‑1 (MQ=255) gtggCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGt > 8:72300/1‑137 (MQ=255) tggCACTGCCTCTGGTACTGCGTCCGTCGGTGATGGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCTCAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACg < 4:199600/149‑1 (MQ=255) tggCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTgtggt > 8:109704/1‑115 (MQ=255) tggCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTgtggt < 7:109704/115‑1 (MQ=255) ggCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACgg > 7:117095/1‑149 (MQ=255) gCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGgt < 6:139411/149‑1 (MQ=255) cACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGgtg < 5:190308/149‑1 (MQ=255) aCTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGgtg > 1:15034/1‑148 (MQ=255) ccGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTc < 8:117095/149‑1 (MQ=255) cACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtg < 2:15034/149‑1 (MQ=255) cACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtg > 8:246115/1‑149 (MQ=255) ccGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtggt > 6:163944/1‑149 (MQ=255) cGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCgtggtg < 7:246115/149‑1 (MQ=255) gACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGc < 6:66994/149‑1 (MQ=255) aTCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCt > 6:230992/1‑149 (MQ=255) tCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTg > 4:44484/1‑149 (MQ=255) gTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCaa < 6:26846/140‑1 (MQ=255) gTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCaa > 5:26846/1‑140 (MQ=255) gTTTTTACCTGTTGATAGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGc < 5:98948/95‑1 (MQ=255) gTTTTTACCTGTTGATAGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGc > 6:98948/1‑95 (MQ=255) cTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCtt > 3:203006/1‑149 (MQ=255) cTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACACAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACACCTGCAGAATGCCtt > 5:240869/1‑149 (MQ=255) ttGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTgg > 7:264707/1‑149 (MQ=255) aTCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGgcg < 3:44484/148‑1 (MQ=255) gCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGAGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGACGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGTCTTTGGCgaga > 6:10715/1‑148 (MQ=255) ccTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCACCCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCg > 5:260055/1‑149 (MQ=255) tGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGcc < 1:276990/133‑1 (MQ=255) tGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGcc > 2:276990/1‑133 (MQ=255) ggCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCa > 4:74338/1‑149 (MQ=255) cccGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAgc < 5:230992/149‑1 (MQ=255) ccGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAgcg > 7:93440/1‑149 (MQ=255) gctggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTg > 3:252766/1‑149 (MQ=255) ctggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAT‑GCCTGGGGAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGTTGATTGGCTCGAGGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAAGCCCTGCAGAATGTCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTgg < 5:10715/149‑1 (MQ=255) tggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt > 7:35744/1‑123 (MQ=255) tggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt < 8:35744/123‑1 (MQ=255) ggctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGaa < 5:88979/149‑1 (MQ=255) gctTGGTCAGGCCAGCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAg < 8:54530/149‑1 (MQ=255) gctTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGaa < 5:163944/148‑1 (MQ=255) ttGGTCAGTCCACCCATGCGCTAG‑GCCTGGGCATTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACTGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt < 2:212562/119‑1 (MQ=255) ttGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCttt > 1:212562/1‑119 (MQ=255) gTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgcc < 3:74338/149‑1 (MQ=255) gTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcg > 8:263799/1‑147 (MQ=255) tCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccg > 1:142051/1‑149 (MQ=255) cAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTcgccgc < 8:264707/149‑1 (MQ=255) gCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGCCGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCG‑CCCCTGGAAGTCGCCGCTAct > 7:237246/1‑149 (MQ=255) actgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTAc > 2:10435/5‑149 (MQ=255) tgcccAGGC‑CTAGCGCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑AGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGACTGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTActc > 1:214159/3‑149 (MQ=255) ggCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGc > 6:216872/1‑146 (MQ=255) ggCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGc < 5:216872/146‑1 (MQ=255) tAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCCTTGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGagccag > 1:216115/1‑149 (MQ=255) | TCGCGCGCACGCGCTCTTGGCTGCGCGGGCCGGTGGGTGCGGTGGTGGCACTGCCGCTGGTACTGCCACCGACGGTGATCGGTTTTTACCTGTTGATCGCCCTTGGCCCGCACGGCTGGCTTGGTCAGGCCACCCAGGCGCTAG‑GCCTGGGCAGTGTGGTGTTCAGCTTCACAGGCC‑TGGTGATTGGCTCGACGGTGTACTCCATGCCGTTCGTGGTGCAACCCCTGCAGAATGCCTTTGGCGCGATCGGCCAGCGCCCCCTGGAAGTCGCCGCTACTCTGCGAGCCAG > NC_002947/4354907‑4355195 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |