| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | = 106360 | 70 (1.420) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 5.7% | coding (227/1518 nt) | PP_0101 | sulfate transporter |
| ? | NC_002947 | = 106389 | 67 (1.440) | coding (256/1518 nt) | PP_0101 | sulfate transporter | |||||
CGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGTTGATCGTGCT > NC_002947/106213‑106507 | cGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCAc > 8:56033/1‑149 (MQ=255) gATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACg > 1:120307/1‑149 (MQ=255) aTCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACgg > 6:205431/1‑149 (MQ=255) gCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCAt > 5:110074/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATgg > 5:81/1‑149 (MQ=255) ttCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATgg > 4:119406/1‑149 (MQ=255) tGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCa > 1:290822/1‑149 (MQ=255) cAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGGCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATc < 5:322312/149‑1 (MQ=255) aaaGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCt < 4:30195/149‑1 (MQ=255) gCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTtg < 4:233933‑M2/149‑3 (MQ=255) aTTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTtgctggc > 6:110074‑M2/1‑142 (MQ=255) aTTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTtgctggc > 1:292822‑M2/1‑142 (MQ=255) cTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGt < 2:120307/149‑1 (MQ=255) tGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCAacaggattggcccgagcatggccatgccgtgctgg > 1:155500‑M1/1‑108 (MQ=255) tGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCAacaggattggcccgagcatggccatgccgtgctgg < 2:155500‑M1/143‑36 (MQ=255) tGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTc > 2:250615/1‑149 (MQ=255) gggATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCt > 1:21874/1‑149 (MQ=255) ggATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTg < 1:59429/149‑1 (MQ=255) ttATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTg < 2:21874/149‑1 (MQ=255) tCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACgg < 5:77381/103‑1 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gTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGtt > 4:236771/1‑149 (MQ=255) cGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTtgctggcgtaccagctcgaacaccagtaccgccagaccggcagcagggccgctgacctgtagcgg > 7:52926‑M2/1‑37 (MQ=255) cGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTtgctggcgtaccagctcgaacaccagtaccgccagaccggcagcagggccgctgacctgtagcgg < 8:52926‑M2/102‑66 (MQ=255) gCCAGCAacaggattggcccgagcatggccatgccgtgctggcgtaccagctcgaacaccagtaccgccagaccggcagcagggccgctgacctgtagcggcgatccagcaaggaaaccgacgacaatgccgccgataatcccagtaat > 1:292822‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCAGCAacaggattggcccgagcatggccatgccgtgctggcgtaccagctcgaacaccagtaccgccagaccggcagcagggccgctgacctgtagcggcgatccagcaaggaaaccgacgacaatgccgccgataatcccagtaat > 6:110074‑M1/1‑7 (MQ=255) gCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGTTGATc < 3:233933/149‑1 (MQ=255) ccAGCAacaggattggcccgagcatggccatgccgtgctggcgtaccagctcgaa > 6:28695‑M1/1‑6 (MQ=255) ccAGCAacaggattggcccgagcatggccatgccgtgctggcgtaccagctcgaa < 5:28695‑M1/55‑50 (MQ=255) ccAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTtgctggcgtaccagctcgaacaccagtaccgccagaccggcagcagggccgctgacctgtagcggcgatccagcaaggaaaccgacgacaatgccgccgataatccca < 2:155500‑M2/143‑109 (MQ=255) ccAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTtgctggcgtaccagctcgaacaccagtaccgccagaccggcagcagggccgctgacctgtagcggcgatccagcaaggaaaccgacgacaatgccgccgataatccca > 1:155500‑M2/1‑35 (MQ=255) ccAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGTGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGTTGATc < 6:270317/148‑1 (MQ=255) ccAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGTTGATCg > 6:56404/1‑149 (MQ=255) aGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGtt > 3:155868/1‑113 (MQ=255) aGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGtt < 4:155868/113‑1 (MQ=255) aGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGTTGATCGTg > 6:96936/1‑149 (MQ=255) aGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGTTGATCGTg > 2:182649/1‑149 (MQ=255) cAacaggattggcccgagcatggccatgccgtgctggcgtaccagctcgaacaccagtaccgccagaccggcagcagggccgctgacctgtagcggcgatccagcaaggaaaccgacgacaatgccgccgataatcccagtaatcaggc < 4:233933‑M1/149‑148 (MQ=255) | CGATCGCTTCTGGCATGCCGCCGGCAAAAGGCCTGATTACTGGGATTATCGGCGGCATTGTCGTCGGTTTCCTTGCTGGATCGCCGCTACAGGTCAGCGGCCCTGCTGCCGGTCTGGCGGTACTGGTGTTCGAGCTGGTACGCCAGCACGGCATGGCCATGCTCGGGCCAATCCTGTTGCTGGCCGGTCTGTTGCAGTTGCTGGCCGGTCGCTTGCGCCTGGGCTGCTGGTTCCGCGTGACCGCGCCGGCGGTGGTTTACGGCATGCTCGCCGGGATTGGCGTGTTGATCGTGCT > NC_002947/106213‑106507 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |