New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 522020 = | 46 (0.930) | 5 (0.110) | 4/244 | NT | 8.7% | coding (707/1428 nt) | PP_0435 | M23/M37 family peptidase |
? | NC_002947 | 522075 = | 61 (1.300) | coding (652/1428 nt) | PP_0435 | M23/M37 family peptidase |
CACGGCAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTGGC > NC_002947/521872‑522168 | cACGGCAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAAc > 4:142588/1‑149 (MQ=255) acagcaaagtcagcaatctcgaaaccattcgcctgaccaaaaccgccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgCCCAGCAcgcg < 4:80528‑M1/11‑1 (MQ=255) gCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACAACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCTAAGTCGATGTCGTAACCAAGCACGCGGGCCATGt > 3:231340/1‑149 (MQ=255) cgcgGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTc > 4:36893/1‑148 (MQ=255) tGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATg < 5:16025/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCt > 3:310171/1‑149 (MQ=255) cgcgcAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCtgtg < 7:158261/149‑1 (MQ=255) agagagGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGa > 3:234189/1‑147 (MQ=255) gATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGc > 6:231744/1‑146 (MQ=255) gATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGc < 5:231744/146‑1 (MQ=255) gATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCATAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCgg > 2:101766/1‑149 (MQ=255) tGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGATTATCCTGTGCGAAGTCGATCTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGgcg > 6:32307/1‑149 (MQ=255) caaaaccgccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgCCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGgcg < 2:30645‑M1/48‑1 (MQ=255) gTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGgcgc > 3:75924/1‑149 (MQ=255) cgccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgCCCAGCGCGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTgg > 8:116437‑M1/96‑149 (MQ=255) cgccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgCCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTgg > 1:30645‑M1/96‑149 (MQ=255) gccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgCCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTggg > 6:52671‑M1/95‑149 (MQ=255) gTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGc < 3:142588/149‑1 (MQ=255) ccaagggctacaccttcaaccgtgaaatcagcaagccggtgatacgcaccgcctatgcccacggggtgatcaagagctcgctgtctgcttccgCCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGc > 3:80528‑M1/94‑149 (MQ=255) gacgacCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCATCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAg > 2:187032/1‑149 (MQ=255) atcACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCtt > 8:212488/1‑149 (MQ=255) tCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCAcc > 2:43221/1‑149 (MQ=255) ttCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGt > 2:161516/1‑149 (MQ=255) gTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTggg > 7:278546/1‑149 (MQ=255) gTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTggg < 4:310171/149‑1 (MQ=255) gTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTgg < 3:136812/148‑1 (MQ=255) gTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTgg < 7:212488/148‑1 (MQ=255) gTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTgg < 2:83333/148‑1 (MQ=255) gTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCCTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTgg > 1:83333/1‑148 (MQ=255) aCCACGTCGAACTCATCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATa < 1:187032/149‑1 (MQ=255) cACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAgg > 8:217572/1‑149 (MQ=255) gTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCgg > 7:137471/1‑149 (MQ=255) tCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGctc > 2:220139/1‑123 (MQ=255) aCTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGt < 7:217572/149‑1 (MQ=255) ccAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGt < 4:50517/141‑1 (MQ=255) ccAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGt > 3:50517/1‑141 (MQ=255) ccAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCgg > 3:197136/1‑149 (MQ=255) gAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCt > 1:129005/1‑148 (MQ=255) aaTATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGa > 4:250413/1‑149 (MQ=255) tatCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGAtt < 8:137471/149‑1 (MQ=255) tatCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGAtt > 7:60466/1‑149 (MQ=255) tCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGAttt < 8:297132/148‑1 (MQ=255) tCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGAttt < 3:250413/148‑1 (MQ=255) tgtgCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCAGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTccct > 3:90655/1‑146 (MQ=255) gCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGtt > 2:59259/1‑149 (MQ=255) gAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTg > 7:129476/1‑148 (MQ=255) aaGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGaa < 1:251885/149‑1 (MQ=255) aGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAg < 8:60466/149‑1 (MQ=255) aGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAg < 3:36893/149‑1 (MQ=255) aGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAg < 4:234189/149‑1 (MQ=255) gATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCt < 5:199849/129‑1 (MQ=255) gATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCt > 6:199849/1‑129 (MQ=255) gATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGgtg < 8:278546/148‑1 (MQ=255) gTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCt > 7:127595/1‑149 (MQ=255) aCCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTg < 4:231340/148‑1 (MQ=255) CCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTGGc < 8:194243‑M1/149‑1 (MQ=255) CCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTGGc < 7:121854‑M1/149‑1 (MQ=255) | CACGGCAGTGTAGGTTTTGCCGCGGTTGGTGAAGCGCGCAGAGAGGATGTTACCGGTGCCGACGACCTTGCCATCCATCACCTTCTGTTCGTAGACCACGTCGAACTCGTCCCCAGGGCGAATATCCTGTGCGAAGTCGATGTCGTAACCCAGCACGCGGGCCATGTCCATGGTCATGCTGTGGGACAGGCCGGCGCGCTGGGCGGAAGCAGACAGCGAGCTCTTGATCACCCCGTGGGCATAGGCGGTGCGTATCACCGGCTTGCTGATTTCACGGTTGAAGGTGTAGCCCTTGGC > NC_002947/521872‑522168 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |