New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 632192 = | 49 (0.990) | 3 (0.060) | 3/246 | NT | 6.1% | coding (1249/1521 nt) | aldB‑I | aldehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | 632233 = | 45 (0.950) | coding (1208/1521 nt) | aldB‑I | aldehyde dehydrogenase |
ATGCGCCGGGTACAGGTGGTAGCAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAACCTTCCAGCTTCTCGACCTTGCCGCCGGT > NC_002947/632046‑632339 | tacctgcagattgccgagtaagaaggcgaggagctgctcaccggcggcaaggtcgagaagctggaaggttcgctggctaccggttactacatccagccgaccctgctcaagggcaacaacaagatgcgcgtgttccaggaataaatCtt > 7:156081‑M1/147‑149 (MQ=255) tacctgcagattgcccaggaagaaggcgccgagctgctcaccggcggcaaggtcgagaagctggaaggttcgctggctaccggttactacatccagccgaccctgctcaagggcaacaacaagatgcgcgtgttccaggaagaaatCtt > 1:114458‑M1/147‑149 (MQ=255) cctgcagattgcccaggaagaaggcgccgagctgctcaccggcggcaaggtcgagaagctggaaggttcgctggctaccggttactacatccagccgaccctgctcaagggcaacaacaagatgcgcgtgttccaggaagaaatCTTc > 3:288758‑M1/145‑148 (MQ=255) cctgcagattgcccaggaagaaggcgccgagctgctcaccggcggcaaggtcgagaagctggaaggttcgctggctaccggttactacatccagccgaccctgctcaagggcaacaacaagatgcgcgtgttccaggaagaaatCTTCg > 8:52238‑M1/145‑149 (MQ=255) ccGGGTACAGGTGGTAGCAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTcc < 2:148165/149‑1 (MQ=255) gggTACAGGTGGTAGAAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCtt > 3:162012/1‑149 (MQ=255) cAGGTGGTAGCAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAgg > 4:212721/1‑149 (MQ=255) ggtggtAGCAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAggtg > 2:189081/1‑149 (MQ=255) gCAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGaa < 4:227458/138‑1 (MQ=255) gCAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGaa > 3:227458/1‑138 (MQ=255) cAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCt < 5:155788/149‑1 (MQ=255) gTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGacca < 2:95450/148‑1 (MQ=255) cacacaCGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCtt < 8:163373/125‑1 (MQ=255) cacacaCGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCtt > 7:163373/1‑125 (MQ=255) cacacaCGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCgg < 1:189081/149‑1 (MQ=255) cacacGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGc < 3:212721/149‑1 (MQ=255) acacGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGGTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGcc < 5:93705/149‑1 (MQ=255) acGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCg > 8:236864/1‑148 (MQ=255) gCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTTCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCg > 8:197207/1‑145 (MQ=255) gCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCg > 5:101917/1‑145 (MQ=255) ccggcggcaatgtcgagcacctggaatgttcgcttgcaaccggttactacaaccatcccaccctgctcaacggcaacaacaatactgcgcgtgttccaggaagaaatCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGa > 1:95032‑M1/108‑149 (MQ=255) cAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGACCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGAtt > 4:110537/1‑149 (MQ=255) aGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGAttt < 3:238598/149‑1 (MQ=255) tGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTcc > 6:234694/1‑149 (MQ=255) tGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTgg < 4:162012/149‑1 (MQ=255) ccGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAaca > 3:92293/1‑149 (MQ=255) tggaaggttcgctggctaccggttactacatccagccgaccctgctcaagggcaacaacaagatgcgcgtgttccaggaagaaatCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATttc > 7:131275‑M1/86‑131 (MQ=255) tggaaggttcgctggctaccggttactacatccagccgaccctgctcaagggcaacaacaagatgcgcgtgttccaggaagaaatCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATttc < 8:131275‑M1/46‑1 (MQ=255) cACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGATTCGGCTTCGTCATTGAAGGTGGTGACGCTGACAACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGACCAC‑GCGCATAttgttgttg > 2:217026/1‑149 (MQ=18) aCGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGc < 4:92293/149‑1 (MQ=255) aCGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGc > 3:64416/1‑149 (MQ=255) ggTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGccc > 7:109678/1‑149 (MQ=255) aTGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAg > 1:35650/1‑149 (MQ=255) aTGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAg > 3:60692/1‑149 (MQ=255) gTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAg > 6:82953/1‑147 (MQ=255) gcgGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAggg < 4:60692/149‑1 (MQ=255) gggTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTc < 8:109678/149‑1 (MQ=255) cacaCGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTg > 7:185163/1‑149 (MQ=255) cacaCGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTg > 3:71289/1‑149 (MQ=255) acacGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTg > 6:120145/1‑148 (MQ=255) cacGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGa > 8:251479/1‑149 (MQ=255) cGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATg < 5:82953/149‑1 (MQ=255) gcCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAAc < 4:64416/149‑1 (MQ=255) cAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGAt < 3:110206/138‑1 (MQ=255) cAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGAt > 4:110206/1‑138 (MQ=255) ggCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTa < 5:234694/149‑1 (MQ=255) ggCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTa < 7:236864/149‑1 (MQ=255) ggCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTa < 6:101917/149‑1 (MQ=255) gCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTgg > 8:152598/1‑133 (MQ=255) cGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGc > 5:130322/1‑148 (MQ=255) aCTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGc > 2:171915/1‑149 (MQ=255) ggTGTCGTTGGCAATAGCCAGCTCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAAc > 8:20357/1‑149 (MQ=255) tCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAACCTTc < 1:217026/149‑1 (MQ=255) cGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAACCTTc < 3:110537/148‑1 (MQ=255) cAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCttgttgttg > 8:148621/1‑85 (MQ=255) cAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCttgttgttg < 7:148621/85‑1 (MQ=255) ggcttcgTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACACAACGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAACCTTCCAGCTTATCGACCTTGccgccg > 1:90310/1‑149 (MQ=255) ggcttcgTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAACCTTCCAGCTTCTCTACCTTGccgccg < 7:20357/148‑1 (MQ=255) gcttcgTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAACCTTCCAGCTTCTCGACCTTGCCGCCGGt < 8:185163/149‑1 (MQ=255) | ATGCGCCGGGTACAGGTGGTAGCAGTTGGTCCACACACGGCCAGCCTTGATGCCCCGGCCCATGCGGTAGGCACGGTTGATGTCGCGGGTCCACACGCCGGCGCCCAGGCCGAACTCGGTGTCGTTGGCAATTGCCAGCGCTTCGGCTTCGTCCTTGAAGGTGGTGACGCTGACCACCGGGCCGAAGATTTCTTCCTGGAACAC‑GCGCATCTTGTTGTTGCCCTTGAGCAGGGTCGGCTGGATGTAGTAACCGGTAGCCAGCGAACCTTCCAGCTTCTCGACCTTGCCGCCGGT > NC_002947/632046‑632339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |