New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 1868503 | 50 (1.010) | 4 (0.090) | 4/242 | NT | 7.3% | coding (617/1296 nt) | cobB | cobyrinate a,c‑diamide synthase |
? | NC_002947 | = 1868531 | 55 (1.180) | coding (645/1296 nt) | cobB | cobyrinate a,c‑diamide synthase |
ATGCGCAACTGCTCGAAGGCAGCCTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCTTCATCTATGG > NC_002947/1868356‑1868647 | aTGCGCAACTGCTCGAAGGCAGCCTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGAcgccgcc > 3:194719/1‑149 (MQ=255) gcgcAACTGCTCGAAGGCAGCCTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGAcgccgccgc > 8:108846/1‑149 (MQ=255) tGCTCGAAGGCAGCCTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAgcg > 2:199200/1‑149 (MQ=255) aaGGCAGCCTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGCGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGgc > 6:272409/1‑149 (MQ=255) ggCAGCCTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGgcgc < 4:194719/149‑1 (MQ=255) cTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTg < 6:15107/149‑1 (MQ=255) gCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCatcgcaactggcgcccagcgcttcggcggcggcg > 4:148156‑M1/1‑115 (MQ=255) gCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCatcgcaactggcgcccagcgcttcggcggcggcg < 3:148156‑M1/149‑35 (MQ=255) gcgcTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGtt < 4:194276/147‑1 (MQ=255) tGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCa < 3:199653/148‑1 (MQ=255) tCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGc > 4:16929/1‑149 (MQ=255) cgcgAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGa < 1:199200/149‑1 (MQ=255) gcgGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGaa < 7:108846/149‑1 (MQ=255) gcgGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGaa > 2:142267/1‑149 (MQ=255) cgGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGTTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGTACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGTCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAAc < 5:272409/149‑1 (MQ=255) ggCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAAcc > 2:48980/1‑149 (MQ=255) ggCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTCGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAAcc > 2:53514/1‑149 (MQ=255) cATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCatcgcaactggcgcccagcgcttcggcggcggcgtcc > 2:239623‑M1/1‑78 (MQ=255) cATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCatcgcaactggcgcccagcgcttcggcggcggcgtcc < 1:239623‑M1/115‑38 (MQ=255) tCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGc > 5:278624/1‑147 (MQ=255) tGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTg < 1:213793/126‑1 (MQ=255) tGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTg > 2:213793/1‑126 (MQ=255) tGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGc > 3:115112/1‑149 (MQ=255) cAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCGGCCGCCGAAGCGCTgg < 8:256516/80‑1 (MQ=255) cAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTgg > 7:256516/1‑80 (MQ=255) ccgccACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCt > 7:20131/1‑149 (MQ=255) cACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCt < 4:115112/149‑1 (MQ=255) tGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGcc > 4:267984/1‑149 (MQ=255) ggCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGcc < 3:16929/147‑1 (MQ=255) gTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTgc < 8:20131/148‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAgg > 7:290974/1‑149 (MQ=255) gCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAgg < 6:29183/149‑1 (MQ=255) gCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCAGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAgg > 5:61151/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCg > 8:123381/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCg > 1:5329/1‑149 (MQ=255) aGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGt > 3:126377/1‑149 (MQ=255) tGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGaa > 1:173706/1‑98 (MQ=255) tGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGaa < 2:173706/98‑1 (MQ=255) tGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCgg > 6:234154/1‑149 (MQ=255) aaTGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGa > 6:38265/1‑149 (MQ=255) ccTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAgg > 7:179232/1‑149 (MQ=255) cTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGc > 1:103970/1‑149 (MQ=255) cTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGc < 1:31777/149‑1 (MQ=255) ggACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCg > 4:7778/1‑131 (MQ=255) ggACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCg < 3:7778/131‑1 (MQ=255) acCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGc < 8:179232/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAg < 4:254005/122‑1 (MQ=255) ccGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAg > 3:254005/1‑122 (MQ=255) ccGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCt > 3:140982/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCt < 2:5329/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCt < 5:234154/149‑1 (MQ=255) ccGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCt > 3:273586/1‑149 (MQ=255) ccGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCt > 4:258488/1‑149 (MQ=255) gCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCg > 2:223039/1‑123 (MQ=255) gCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGCAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCg < 1:223039/123‑1 (MQ=255) tGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCTTCATc > 4:250364/1‑149 (MQ=255) ggACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATgcggcgtccaggcgggtgtccaggtcattcagctcgctggcctgcaccaggcccaggtggcggctgggcagctcgatg < 1:239623‑M2/115‑79 (MQ=255) ggACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATgcggcgtccaggcgggtgtccaggtcattcagctcgctggcctgcaccaggcccaggtggcggctgggcagctcgatg > 2:239623‑M2/1‑37 (MQ=255) cgccgccgcCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATgcggcgtccaggcgggtgtccaggtcattcagctcgctggcctgcaccaggcccaggtggcggctgggcagctcgatgccgcgctcgcgggacaagccgccataccagcgcaagc < 3:148156‑M2/149‑116 (MQ=255) cgccgccgcCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATgcggcgtccaggcgggtgtccaggtcattcagctcgctggcctgcaccaggcccaggtggcggctgggcagctcgatgccgcgctcgcgggacaagccgccataccagcgcaagc > 4:148156‑M2/1‑34 (MQ=255) gccgccgccGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCTTCATCTATgg > 6:32121/1‑149 (MQ=255) | ATGCGCAACTGCTCGAAGGCAGCCTGACCGAGGGCTTGCGCTGGTATGGCGGCTTGTCCCGCGAGCGCGGCATCGAGCTGCCCAGCCGCCACCTGGGCCTGGTGCAGGCCAGCGAGCTGAATGACCTGGACACCCGCCTGGACGCCGCCGCCGAAGCGCTGGGCGCCAGTTGCGATGCGGCGTTGCCGCCGCCAGTCAGCTTTGCCGAGCCGGAACCGCAAGCCTGCGTTGCCTCGCTGGCCGGTGTGCGCATAGGCGTTGCGCGGGACGAGGCGTTCGCCTTCATCTATGG > NC_002947/1868356‑1868647 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |