New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2254855 | 51 (1.030) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 5.2% | coding (28/1113 nt) | asd | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
? | NC_002947 | = 2254919 | 60 (1.240) | coding (92/1113 nt) | asd | aspartate‑semialdehyde dehydrogenase |
AGTTGGTACGCAGGAAATGGGCGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAGGACGCTTATT > NC_002947/2254710‑2255002 | aGTTGGTACGCAGGAAATGGGCGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGcgcg < 2:210216/149‑1 (MQ=255) cGCAGGAAATGGGCGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGt < 6:168436/148‑1 (MQ=255) gCAGGAAATGGGCGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATCGTCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTc > 1:233182/1‑149 (MQ=255) ggAAATGGGCGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGtt < 1:95982/149‑1 (MQ=255) aaTGGGCGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTCGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCg < 4:206787/149‑1 (MQ=255) cGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCa > 2:290578/1‑149 (MQ=255) tCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATg > 2:194423/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGtt < 1:295965/127‑1 (MQ=255) gCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGtt > 2:295965/1‑127 (MQ=255) gCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCt > 4:199495/1‑149 (MQ=255) gCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCt > 3:222677/1‑149 (MQ=255) gcTGCGTAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCTGTGGCGTCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTggag < 5:277424/148‑1 (MQ=255) cGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGgaggag > 7:254446/1‑147 (MQ=255) gAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAgg < 1:290578/149‑1 (MQ=255) tGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCtcgataaggtcgaaatcctgctcctccagcatccgctgcatgagcacggaacc > 8:24161‑M1/1‑96 (MQ=255) tGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTc > 1:152674/1‑149 (MQ=255) agc‑tctctGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGAcc < 2:233182/147‑1 (MQ=255) aTC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCACGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGAcc > 7:29060/1‑149 (MQ=255) tc‑tctcTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGATCTCATCGGTTGGCGAGTAATGTTCAGTTAAGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCt > 2:173470/1‑149 (MQ=255) tctctGGCCCGCCCCCCAAAATTCACGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTa > 5:229667/1‑149 (MQ=255) tctGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATc > 5:193366/1‑149 (MQ=255) tctGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGGGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGATCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCt < 5:188058/145‑1 (MQ=255) gcccgcccCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCtcgataaggtcgaaatcctgctcctccagcatccgctgcatgagcacggaaccgaccataccgcgc < 7:24161‑M1/149‑67 (MQ=255) cgcccCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCtcgataaggtcgaaatcctgctcctccagcatccgctgcatgagcacggaaccgaccataccgcgccaa < 8:25341‑M1/149‑70 (MQ=255) gcccCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGgt < 3:199495/149‑1 (MQ=255) cccAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGttc > 3:136489/1‑149 (MQ=255) cccAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGttc > 2:137493/1‑149 (MQ=255) cccAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGATCTCATAGGTAGCCGAATAATTATCAATTACGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGttc > 6:112175/1‑149 (MQ=255) cAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGttctt < 2:152674/149‑1 (MQ=255) aTTCCCGGAGGCGGCCCACATTTAGCACACGTGTAGGTGCGATGAAACGTGCAGGTCTGCTCGGTTCGCGCGGTATGGTCGGTCCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACt < 8:254446/149‑1 (MQ=255) ttCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTa < 6:193366/149‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTAcc < 4:222677/148‑1 (MQ=255) ccGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCt > 2:192088/1‑149 (MQ=255) cACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTtggtg < 6:229667/149‑1 (MQ=255) cACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTtggtg < 8:138709/149‑1 (MQ=255) ttttAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCa > 6:50516/1‑128 (MQ=255) ttttAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCa < 5:50516/128‑1 (MQ=255) cAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCACGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTc < 8:29060/149‑1 (MQ=255) aaaGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTcc > 7:192438/1‑149 (MQ=255) aaaGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTACGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTcc > 8:18066/1‑149 (MQ=255) aGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCg > 4:170993/1‑148 (MQ=255) tAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTg < 1:137493/149‑1 (MQ=255) gTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCTGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTgg < 8:192438/148‑1 (MQ=255) gTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTgg < 1:192088/148‑1 (MQ=255) gATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAg > 2:305823/1‑148 (MQ=255) gATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAg > 6:327042/1‑148 (MQ=255) aaCGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGTAg < 1:284582/71‑1 (MQ=255) aaCGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGAGGTATGGTCGATTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGTAg > 2:284582/1‑71 (MQ=255) aCGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAg > 4:179371/1‑70 (MQ=255) aCGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAg < 3:179371/70‑1 (MQ=255) cGTGTAGGGCTGAGCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCCGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAgc < 1:194423/149‑1 (MQ=255) tGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAg > 6:15478/1‑149 (MQ=255) tGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAg > 6:144413/1‑149 (MQ=255) aTCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAgg < 5:58816/148‑1 (MQ=255) aTCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAGGa < 1:173470/149‑1 (MQ=255) ttGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAgccaaccgatcagacctacacgtttcatcgcaactacacctttgctaaaagtgggccgccaccgggaattttggggggcg < 8:25341‑M2/149‑81 (MQ=255) ttGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAGGACGCt > 3:152541/1‑148 (MQ=255) ggCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAGGACGCTTa < 5:327042/148‑1 (MQ=255) gcgcGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAgccaaccgatcagacctacacgtttcatcgcaactacacctttgctaaaagtgggccgccaccgggaattttggggggcgggc < 7:24161‑M2/149‑84 (MQ=255) | AGTTGGTACGCAGGAAATGGGCGACGCAGTAGTCGCAGCGCTGCGGAATCTGTAATC‑TCTCTGGCCCGCCCCCCAAAATTCCCGGTGGCGGCCCACTTTTAGCAAAGGTGTAGTTGCGATGAAACGTGTAGGTCTGATCGGTTGGCGCGGTATGGTCGGTTCCGTGCTCATGCAGCGGATGCTGGAGGAGCAGGATTTCGACCTTATCGAGCCGGTGTTCTTCACTACCTCCAATGTTGGTGGCCAGGGTCCGAACGTGGGCAAGGATACAGCGCCCCTCAAGGACGCTTATT > NC_002947/2254710‑2255002 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |