New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 3577425 = | 26 (0.530) | 3 (0.070) | 3/228 | NT | 10.9% | intergenic (+19/‑161) | PP_3157/PP_3158 | inositol monophosphatase family protein/hypothetical protein |
? | NC_002947 | 3577480 = | 26 (0.590) | intergenic (+74/‑106) | PP_3157/PP_3158 | inositol monophosphatase family protein/hypothetical protein |
ATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCG > NC_002947/3577278‑3577549 | atcGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTgg > 5:239151/1‑149 (MQ=255) tcGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGc > 5:1417/1‑149 (MQ=255) gAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCct > 8:24447/1‑149 (MQ=255) gggggaggaaattcgcgtagcttgcaaccatcggcaccgggtcgatattgggcggctgcgccgggagtcagcgcggcctggccaagcatagagcccgaaaatgggaaaaagtgcggtggctggagagaatgcaaacctgtggcGGCctc > 8:144717‑M1/144‑149 (MQ=255) aggaaattcgcgtagcttgcaaccatcggcaccgggtcgatattgggcggctgcgccgggagtcagcgcggcctggccaagcatagagcccgaaaatgggaaaaagtgcggtggctggagagaatgcaaacctgtggcGGCCTCTTcgc > 6:76513‑M1/139‑149 (MQ=255) gCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCgggtaac > 7:47621/1‑145 (MQ=255) cGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGt < 2:269559/149‑1 (MQ=255) cGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGt < 6:1417/149‑1 (MQ=255) tCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGAAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCctt > 8:185231/1‑149 (MQ=255) aTGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCg < 1:123699/149‑1 (MQ=255) tGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCgg < 4:207110/149‑1 (MQ=255) ggCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCgg < 6:239151/148‑1 (MQ=255) gTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTAc < 7:24447/149‑1 (MQ=255) gatattgggcggctgcgccgggagtcagcgcggcctggccaagcatagagcccgaaaatgggaaaaagtgcggtggctggagagaatgcaaacctgtggcGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGaa > 8:9299‑M1/101‑149 (MQ=255) aGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGaa > 1:124130/1‑147 (MQ=255) tggCGTGTGGTGACCTTGTGGTGCTTGCGCTGGTGGTGTATATGTTGCGCCACGCATTGTTATCGGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTTTTCGGGGGGGTGTCCTTTCTTGTGGGTGCGGGTTCCCGGCTAAGTGGCCGCCACAGGTTTGc < 4:114846/148‑1 (MQ=255) tggCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCa < 6:66239/149‑1 (MQ=255) gCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGc > 3:114846/1‑146 (MQ=255) gCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTGCGCGGGCGAGTCCCTTCTtg > 8:140984/1‑106 (MQ=255) gtcagcgcggcctggccaagcatagagcccgaaaatgggaaaaagtgcggtggctggagagaatgcaaacctgtggcGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTTTGGGAGCGGGTTACCCGCGAagag < 1:216332‑M1/52‑1 (MQ=255) gtcagcgcggcctggccaagcatagagcccgaaaatgggaaaaagtgcggtggctggagagaatgcaaacctgtggcGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAagag > 2:216332‑M1/78‑129 (MQ=255) aCCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGttt < 4:70193/134‑1 (MQ=255) aCCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGttt > 3:70193/1‑134 (MQ=255) ccTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAg < 6:68026/84‑1 (MQ=255) ccTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAg > 5:68026/1‑84 (MQ=255) cAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCAt > 6:29695/1‑149 (MQ=255) tGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATtctctc > 3:281203/1‑123 (MQ=255) gagaTGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGct > 6:99089/1‑149 (MQ=255) gaTGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACtttt > 3:21404/1‑132 (MQ=255) gcgcCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCtt > 1:155861/1‑149 (MQ=255) gccaTGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAgg < 5:29695/149‑1 (MQ=255) aTGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCcg > 2:275322/1‑149 (MQ=255) gATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTcc < 5:112530/97‑1 (MQ=255) gATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTcc > 6:112530/1‑97 (MQ=255) | ATCGAAGGGGCGGGTGGCGTGATCACGGCGTGGGATGGCAGTTCGGCGCAGGATGGCGGGTGTGTGGTGGCCTGTGGTGACCCTGTGCTGCATGCGCAGGTGCTGGAGATGTTGCGCCACGCCATGTGATCCGGGTTCTTCGCTCCTGGCCTCTTCGCGGGCGAGTCCCTTCTTGTGGGAGCGGGTTACCCGCGAAGAGGCCGCCACAGGTTTGCATTCTCTCCAGCCACCGCACTTTTTCCCATTTTCGGGCTCTATGCTTGGCCAGGCCG > NC_002947/3577278‑3577549 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |