New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 4330858 = | 42 (0.850) | 5 (0.110) | 5/242 | NT | 10.0% | coding (304/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein |
? | NC_002947 | 4330923 = | 50 (1.070) | coding (369/747 nt) | PP_3802 | cation ABC transporter ATP‑binding protein |
AAGAGCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCG > NC_002947/4330711‑4331005 | gccgacatcggttcgtccagcaccagcaactgcggctcggggatcaggccctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaAt > 2:269520‑M1/148‑149 (MQ=255) aaGAGCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCAt > 8:201928/1‑149 (MQ=255) agagCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATg < 5:112593/149‑1 (MQ=255) aaGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGc > 8:72855/1‑147 (MQ=255) gACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAgc > 7:246859/1‑149 (MQ=255) ccTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATg > 3:186630/1‑130 (MQ=255) ccTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATg < 4:186630/130‑1 (MQ=255) tCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCg > 7:59723/1‑149 (MQ=255) gggCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCg < 8:59723/147‑1 (MQ=255) ctgcggctcggggatcaggccctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATg > 5:249666‑M1/119‑121 (MQ=255) ctgcggctcggggatcaggccctgggccagcagcacgcgctggcgctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATg < 6:249666‑M1/3‑1 (MQ=255) cacaCCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGc < 1:276501/149‑1 (MQ=255) cacCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCt > 7:128189/1‑149 (MQ=255) aGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTcg > 2:38555/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCgcggc < 5:194571/149‑1 (MQ=255) cTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGt < 7:79892/149‑1 (MQ=255) aCCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTg > 8:26359/1‑147 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGc > 6:265969/1‑148 (MQ=255) aTTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGc > 4:231629/1‑148 (MQ=255) gCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCTGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAtt > 5:14458/1‑148 (MQ=255) gCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAtt > 4:81077/1‑148 (MQ=255) cTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGAt < 3:81077/149‑1 (MQ=255) cTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGAt > 1:303090/1‑149 (MQ=255) gctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAtt > 4:136476‑M1/75‑140 (MQ=255) gctcaccgccggacagtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCAtt < 3:136476‑M1/66‑1 (MQ=255) aGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGcc > 6:319605/1‑149 (MQ=255) aGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGc < 2:303090/148‑1 (MQ=255) cgcgAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCtt < 5:265969/149‑1 (MQ=255) cgcgAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCtt > 8:265039/1‑149 (MQ=255) gcgAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGATGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTg < 2:86844/149‑1 (MQ=255) aaGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGtt < 1:122397/149‑1 (MQ=255) tGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAg < 4:77030/149‑1 (MQ=255) tGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAg < 8:128189/149‑1 (MQ=255) aTTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAgg < 7:201928/148‑1 (MQ=255) aTTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGt < 1:14733/149‑1 (MQ=255) ggCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTg < 8:980/148‑1 (MQ=255) agtgcccccatgcgccgcgtgcgcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTgg > 1:37740‑M1/61‑149 (MQ=255) gCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTgg > 5:292377/1‑148 (MQ=255) cAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACaa < 2:302911/149‑1 (MQ=255) aCTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTACCACGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCa > 1:57965/1‑149 (MQ=255) tGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCAcg > 7:95365/1‑149 (MQ=255) gAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCAcg < 5:319605/147‑1 (MQ=255) gcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGGCTT‑‑‑CACGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTg > 4:49310‑M1/39‑89 (MQ=255) gcttgtcgagcatgccaacctgaaccaaggctgcatcaATGGCCGGCTT‑‑‑CACGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTg < 3:49310‑M1/51‑1 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCAt > 6:41829/1‑149 (MQ=255) gACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCAt > 5:258776/1‑149 (MQ=255) tGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTg > 3:92373/1‑149 (MQ=255) ccATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTcc > 8:75626/1‑149 (MQ=255) aTGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCcgg > 6:255363/1‑149 (MQ=255) aTGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCcgg > 2:63036/1‑149 (MQ=255) aCCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCcggcg < 6:258776/148‑1 (MQ=255) tGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTcc < 5:133049/140‑1 (MQ=255) tGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTcc > 6:133049/1‑140 (MQ=255) gATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAgcgc > 1:15908/1‑147 (MQ=255) cATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAgc < 8:259889/140‑1 (MQ=255) cATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAgc > 7:259889/1‑140 (MQ=255) cATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAgcgc < 8:246859/148‑1 (MQ=255) ATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGcgcg > 7:26359‑M1/1‑148 (MQ=255) | AAGAGCTCGTTGATCAAGACCCTGCTCGGGCAGATGCCACACCAGGGCCAGCTGACCTTGCATTGGCCTGGTGAGCGCGAAGTGATTGGCTACGTGCCGCAGGCACTGGAGTTCGACCGCGGCCTGCCCATGACCGTGGACGATTTCATGGCCGCCATGTGCCAGCGCCGCCCGGCCTTCCTCGGCCTGTCGCGGCGCGTGAAGCCGGCCATTGATGCAGCCTTGGTTCAGGTTGGCATGCTCGACAAGCGCACGCGGCGCATGGGGGCACTGTCCGGCGGTGAGCGCCAGCGCG > NC_002947/4330711‑4331005 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |