| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | NC_002947 | 5450336 = | 56 (1.130) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 5.2% | coding (214/474 nt) | ybeY | endoribonuclease YbeY |
| ? | NC_002947 | 5450378 = | 57 (1.220) | coding (256/474 nt) | ybeY | endoribonuclease YbeY | |||||
GTTGCGCCAGCGCAGCGCCGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCACTTGCTCGGCTACGACCA > NC_002947/5450203‑5450484 | gTTGCGCCAGCGCAGCGCCGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTc < 4:178481/145‑1 (MQ=255)gTTGCGCCAGCGCAGCGCCGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTc > 3:178481/1‑145 (MQ=255) gcCAGCGCAGCGCCGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCg > 2:103817/1‑149 (MQ=255) gcgcCGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTgg > 8:147200/1‑147 (MQ=255) gcgcCGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTgg < 7:147200/147‑1 (MQ=255) agcagACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGc < 1:270284/144‑1 (MQ=255) cctcgatgtggtcgtagccgagcaagtgcaggcaaccgtggatgaccaggtgcgcccagtgcgcttccagcgatttgccttgttcggccgcttcgcgctcgaccaccgctacacaGATGAcc > 6:272785‑M1/116‑122 (MQ=255) cctcgatgtggtcgtagccgagcaagtgcaggcaaccgtggatgaccaggtgcgcccagtgcgcttccagcgatttgccttgttcggccgcttcgcgctcgaccacccctacacaGATGAcc < 5:272785‑M1/7‑1 (MQ=255) cGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGAcc < 5:115428/149‑1 (MQ=255) ggAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGt < 2:63101/147‑1 (MQ=255) gAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCAt < 1:240576/149‑1 (MQ=255) gAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCAt < 1:244620/149‑1 (MQ=255) gtcgtagccgagcaagtgcaggcaaccgtggatgaccaggtgcgcccagtgcgcttccagcgatttgccttgttcggccgcttcgcgctcgaccaccgctacacaGa > 1:45315‑M1/106‑107 (MQ=255) gtcgtagccgagcaagtgcaggcaaccgtggatgaccaggtgcgcccagtgcgcttccagcgatttgccttgttcggccgcttcgcgctcgaccaccgctacacaGa < 2:45315‑M1/2‑1 (MQ=255) gtagccgagcaagtgcaggcaaccgtggatgaccaggtgcgcccagtgcgcttccagcgatttgccttgttcggccgcttcgcgctcgaccaccgctacacaGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCtgtg > 7:17259‑M1/103‑148 (MQ=255) aCCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTc < 2:154272/114‑1 (MQ=255) aCCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTc > 1:154272/1‑114 (MQ=255) ccgagcaagtgcaggcaaccgtggatgaccaggtgcgcccagtgcgcttccagcgatttgccttgttcggccgcttcgcgctcgaccaccgctacacaGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCtg < 7:17136‑M1/44‑1 (MQ=255) ccgagcaagtgcaggcaaccgtggatgaccaggtgcgcccagtgcgcttccagcgatttgccttgttcggccgcttcgcgctcgaccaccgctacacaGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCtg > 8:17136‑M1/99‑142 (MQ=255) gCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCggtg > 5:63900/1‑149 (MQ=255) gTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCggt < 1:236942/143‑1 (MQ=255) gTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTc < 1:282717/147‑1 (MQ=255) gTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAACGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCggt > 2:236942/1‑143 (MQ=255) acgaAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAgcgc > 2:104113/1‑149 (MQ=255) acgaAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAgcgc > 3:57226/1‑149 (MQ=255) gCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAgcg < 2:234285/143‑1 (MQ=255) gCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAgcg > 1:234285/1‑143 (MQ=255) cGAAGGCCGCGATCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTCGGAGACCTCGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCgg > 6:69110/1‑149 (MQ=255) cGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGCCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCgg > 4:140707/1‑149 (MQ=255) cgcgAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCg < 6:180816/141‑1 (MQ=255) cgcgAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCg > 5:180816/1‑141 (MQ=255) cgcgAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAAc > 5:3973/1‑148 (MQ=255) gcgAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTc < 8:97830/128‑1 (MQ=255) gcgAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTc > 7:97830/1‑128 (MQ=255) cgAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAg > 4:129278/1‑149 (MQ=255) gAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAgg < 4:57226/149‑1 (MQ=255) gAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAgg < 6:3973/149‑1 (MQ=255) tGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTggg > 2:228972/1‑94 (MQ=255) tGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCaaa > 5:70688/1‑149 (MQ=255) tGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGATCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTggg < 1:228972/94‑1 (MQ=255) aaCCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTgg > 5:59123/1‑91 (MQ=255) aaCCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTgg < 6:59123/91‑1 (MQ=255) aaCCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATc > 8:10079/1‑149 (MQ=255) cacCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTg > 2:122382/1‑148 (MQ=255) cTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAg > 2:95679/1‑149 (MQ=255) aaGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCTGCCGATGTGCCCGATGAACTTCTCGATATCCCTATGCTGGGCGACCTGGTCATATGTGTAGCGGTTGTCGAGCGCGAAGGGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGgc < 1:104113/149‑1 (MQ=255) aaGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGc < 8:74116/133‑1 (MQ=255) aaGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGc > 7:74116/1‑133 (MQ=255) aCTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCAc < 6:63900/149‑1 (MQ=255) aCTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCAc < 3:129278/149‑1 (MQ=255) tACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGCGCGCACCt > 8:218523/1‑149 (MQ=255) cgcgACCAATGTGTTGTCGTTGCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGGCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGGACTGGGCGCACCTgg < 5:69110/149‑1 (MQ=255) gcgACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGgc < 6:194655/140‑1 (MQ=255) gcgACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGgc > 5:194655/1‑140 (MQ=255) aTGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCAc > 2:27691/1‑149 (MQ=255) tgttgtCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACgg < 2:98925/148‑1 (MQ=255) ttgtCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTg < 3:260274/149‑1 (MQ=255) gTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAAt > 6:188339/1‑104 (MQ=255) cccGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCAc < 1:122382/148‑1 (MQ=255) cccGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCAc < 1:95679/148‑1 (MQ=255) ccGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCACtt > 2:151124/1‑149 (MQ=255) ggCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCACTTGc > 3:82612/1‑149 (MQ=255) ggCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCACTTGc < 6:70688/149‑1 (MQ=255) gCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCACTTGCTCGGCTAc > 2:51428/1‑148 (MQ=255) GATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCACTTGCTCGGCTACGACca > 1:51428‑M1/1‑149 (MQ=255) | GTTGCGCCAGCGCAGCGCCGACTCGGAAATGACCATTCGCCTGGTCGACGAAGCCGAAGGCCGCGAGCTGAACCACACCTACCGGCACAAGGACTACGCGACCAATGTGTTGTCGTTCCCGGCCGATGTGCCCGATGACCTGCTCGATATCCCGCTGCTGGGCGACCTGGTCATCTGTGTAGCGGTGGTCGAGCGCGAAGCGGCCGAACAAGGCAAATCGCTGGAAGCGCACTGGGCGCACCTGGTCATCCACGGTTGCCTGCACTTGCTCGGCTACGACCA > NC_002947/5450203‑5450484 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |