New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | 5586334 = | 46 (0.930) | 3 (0.060) | 3/242 | NT | 6.9% | coding (952/1026 nt) | PP_4914 | phytase‑like protein |
? | NC_002947 | 5586372 = | 38 (0.810) | coding (914/1026 nt) | PP_4914 | phytase‑like protein |
TGGCAAGAAACAGCGCCGCCGCCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATCAGCAGCGAACGACCAGCAACGCTCGACCTTGCCACTGTC > NC_002947/5586188‑5586481 | gaacgtaacgcctaccgggtgtgccgacgtgatatcgacagtggcaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaaggg > 2:34452‑M1/147‑149 (MQ=255) aacgtaaggcctacggggtgttccgacgtgatatcgagagtgggaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaaGGgc > 3:137309‑M1/146‑149 (MQ=255) gCAAGAAACAGCGCCGCCGCCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGgcg > 4:147234/1‑149 (MQ=255) gCAAGAAACAGCGCCGCCGCCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGgc < 2:136035/148‑1 (MQ=255) acgcctaccgggtgtgccgacgtgatatcgacagtggcaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaaGGGCGCCgtt < 7:45218‑M1/10‑1 (MQ=255) aaaCAGCGCCGCCGCCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgtt > 3:84918/1‑149 (MQ=255) aaaCAGCGCCGCCGCCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgtt < 6:41392/149‑1 (MQ=255) cgccgccgcCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGATGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgttgttgtt < 7:64468/149‑1 (MQ=255) cgccgccgcCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgttgttgtt < 5:263145/149‑1 (MQ=255) accgggtgtgccgacgtgatatcgacagtggcaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaagg < 1:99754‑M1/2‑1 (MQ=255) accgggtgtgccgacgtgatatcgacagtggcaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaagg > 2:99754‑M1/134‑135 (MQ=255) ccgccCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCa < 1:185567/149‑1 (MQ=255) gtgatatcgacagtggcaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaagg > 2:269613‑M1/119‑120 (MQ=255) gtgatatcgacagtggcaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaagg < 1:269613‑M1/2‑1 (MQ=255) tcatcaGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGgcgc < 6:51515/149‑1 (MQ=255) tcaGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCt > 8:10856/1‑149 (MQ=255) caGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgttgttg > 1:85752/1‑123 (MQ=255) caGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgttgttg < 2:85752/123‑1 (MQ=255) aGTTACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGGTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAATCGCCAGACTACCGGCCGGGTTTCACCGTCCGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTg < 7:246291/149‑1 (MQ=255) agtggcaaggtcgagcgttgctggtcgttcgctgctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaaGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTgg > 8:45218‑M1/108‑149 (MQ=255) tAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTgg > 2:290196/1‑148 (MQ=255) ttGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgttgttgtt > 8:205163/1‑118 (MQ=255) ttGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCgttgttgtt < 7:205163/118‑1 (MQ=255) ccGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCg < 1:239778/145‑1 (MQ=255) ccGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCg > 2:239778/1‑145 (MQ=255) ccGCGCGCTTGCCCGGCACCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCa > 4:175274/1‑149 (MQ=255) gcgcgcTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTg > 1:76354/1‑137 (MQ=255) gcgcgcTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTg < 2:76354/137‑1 (MQ=255) gcTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTgg > 4:246001/1‑134 (MQ=255) gcTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTgg < 3:246001/134‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGc < 5:268484/133‑1 (MQ=255) ttGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGc > 6:268484/1‑133 (MQ=255) cccGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTc < 7:10856/148‑1 (MQ=255) cGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCggc < 3:147234/149‑1 (MQ=255) gCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCaaa > 7:170189/1‑149 (MQ=255) gCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCaaa > 5:40908/1‑149 (MQ=255) gCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCAAGGAGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCaaa > 6:68908/1‑149 (MQ=255) gctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaaGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAg > 8:153815‑M1/75‑106 (MQ=255) gctgatgcgctggtcgagtcacggcgctacgcgcagccgtttggcctggccgaagcactggtgatcgatgccaaGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAg < 7:153815‑M1/32‑1 (MQ=255) tttGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTgcg > 7:118173/1‑149 (MQ=255) gcgcTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTg > 5:46582/1‑105 (MQ=255) gcgcTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTg < 6:46582/105‑1 (MQ=255) gcTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAgc > 2:81983/1‑149 (MQ=255) cgccTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGAc < 6:40908/149‑1 (MQ=255) cTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCg < 1:81983/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGAc < 8:118173/148‑1 (MQ=255) gTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAgc < 3:175274/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATcag > 5:252226/1‑148 (MQ=255) gcgcCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCggcca > 8:249423/1‑101 (MQ=255) aGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATCAGCAGCGAAc > 3:284928/1‑149 (MQ=255) acCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTGCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCATCGCATCAGCAGCGAACGACCa < 6:252226/149‑1 (MQ=255) ccggccggGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATCAGCAGCGAACGTCCAg < 4:84918/149‑1 (MQ=255) cACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATCAGCAGCGAACGACCAGCAACGCTCGAcc > 7:102640/1‑149 (MQ=255) cACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATCAGCAGCGAACGACCAGCAACGCTCGAc < 6:306143/148‑1 (MQ=255) aCCGTCGGCACGGGTGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAg < 3:222700/114‑1 (MQ=255) aCCGTCGGCACGGGTGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAg > 4:222700/1‑114 (MQ=255) aCCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGa < 3:47700/110‑1 (MQ=255) aCCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGa > 4:47700/1‑110 (MQ=255) cGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATCAGCAGCGAACGACCAGCAACGCTCGACCTTGCCACTGTc < 4:284928/149‑1 (MQ=255) | TGGCAAGAAACAGCGCCGCCGCCCAGGCGACGATCATCAGTAACTTGCCCGCGCGCTTGCCCGGCGCCTGGCTCATGGTTTGGCGCTCCAGCCGCCTTCCGGTGCGTCGAAGCGCCAGACGACCGGCCGGGTTTCACCGTCGGCACGGGCGCCGTTGTTGTTGTCCAGGCCAATCCAGGCGCCCTTGGCATCGATCACCAGTGCTTCGGCCAGGCCAAACGGCTGCGCGTAGCGCCGTGACTCGACCAGCGCATCAGCAGCGAACGACCAGCAACGCTCGACCTTGCCACTGTC > NC_002947/5586188‑5586481 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |