New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 79432 | 38 (0.770) | 6 (0.130) | 4/244 | NT | 13.9% | coding (187/1098 nt) | PP_0069 | rossmann fold nucleotide‑binding protein |
? | NC_002947 | = 79457 | 38 (0.810) | coding (212/1098 nt) | PP_0069 | rossmann fold nucleotide‑binding protein |
CCTCCCCGATGCTGGACTGCGACGCTTTCGAACGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTTCGTCGCTGGCGAACCAGCCTTGCT > NC_002947/79311‑79601 | ccTCCCCGATGCTGGACTGCGACGCTTTCGAACGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGc < 5:133898‑M2/148‑2 (MQ=255) cccGATGCTGGACTGCGACGCTTTCGAACGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGcgatgg < 6:297411‑M2/149‑7 (MQ=255) tGGACTGCGACGCTTTCGAACGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGTCGCACTgg > 5:98991/1‑149 (MQ=255) cGACGCTTTCGAACGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTa < 6:133898/148‑1 (MQ=255) tttCGAACGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTAtggcttg > 4:277459/1‑149 (MQ=255) gagcGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTg > 4:65853/4‑149 (MQ=255) aaCGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTg > 6:313748/1‑148 (MQ=255) tGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGgctg < 6:143756/129‑1 (MQ=255) tGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGgctg > 5:143756/1‑129 (MQ=255) gCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAgcgc < 3:248611/148‑1 (MQ=255) cTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGcc < 6:279217/148‑1 (MQ=255) gAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTgg > 5:170196/1‑149 (MQ=255) gAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTgg > 7:92966/1‑149 (MQ=255) gCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCa < 3:277459/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGc < 6:170196/149‑1 (MQ=255) cAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGc < 5:313748/149‑1 (MQ=255) ctcctcCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGAtgt < 5:297411/149‑1 (MQ=255) tCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTg < 7:263827/134‑1 (MQ=255) tCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTg > 8:263827/1‑134 (MQ=255) cccGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTAcc > 6:58363/1‑148 (MQ=255) ccGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCATGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTAccc < 6:115299/148‑1 (MQ=255) cGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGccc > 7:66686/1‑108 (MQ=255) cGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGccc < 8:66686/108‑1 (MQ=255) cGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAg < 4:140582/135‑1 (MQ=255) cGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAg > 3:140582/1‑135 (MQ=255) gCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCt < 3:65853/149‑1 (MQ=255) gCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCt > 3:155272/1‑149 (MQ=255) gCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAACCCACCATCCATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCt < 2:284974/149‑1 (MQ=255) gCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGAt > 5:55732/1‑149 (MQ=255) cATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATg > 2:253584/1‑149 (MQ=255) ccccAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGcccc > 5:198389/1‑149 (MQ=255) cccAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCccg > 3:48668/1‑149 (MQ=255) caccaTCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGcgatggtggcttggggaatgcccaacgctcgccaggccgaagcgggagcactgagcgcggaggaggcactgccgaaggcttcgagcaacgttcgaaagcgtcgcagtccagcatcg < 3:40213‑M2/149‑117 (MQ=255) caccaTCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGcgatggtggcttggggaatgcccaacgctcgccaggccgaagcgggagcactgagcgcggaggaggcactgccgaaggcttcgagcaacgttcgaaagcgtcgcagtccagcatcg < 3:36178‑M2/149‑117 (MQ=255) accaTCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGcgatggtggcttggggaatgcccaacgctcgccaggccgaagcgggagcactgagcgcggaggaggcactgccgaaggcttcgagcaacgttcgaaagcgtcgcagtcca > 1:135130‑M2/1‑32 (MQ=255) accaTCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGcgatggtggcttggggaatgcccaacgctcgccaggccgaagcgggagcactgagcgcggaggaggcactgccgaaggcttcgagcaacgttcgaaagcgtcgcagtcca < 2:135130‑M2/142‑111 (MQ=255) aTCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATTGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCtttt < 6:98991/149‑1 (MQ=255) tCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTtc < 6:55732/149‑1 (MQ=255) gATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGcgatggtggcttggggaatgcccaacgctcgccaggccgaagcgggagcactgagcgcggaggaggcactgccgaaggcttcgagcaacgttcgaaagcgtcgcagtccagcatcggggagg > 4:40213‑M2/1‑26 (MQ=255) gATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGcgatggtggcttggggaatgcccaacgctcgccaggccgaagcgggagcactgagcgcggaggaggcactgccgaaggcttcgagcaacgttcgaaagcgtcgcagtccagcatcggggagg > 4:36178‑M2/1‑26 (MQ=255) gATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTtcg < 6:198389/148‑1 (MQ=255) gATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTAAGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTtcgt > 3:148665/1‑149 (MQ=255) ccGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAAt < 1:193672/117‑1 (MQ=255) ccGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAAt > 2:193672/1‑117 (MQ=255) cGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTTCGTCGCTGGCGAACCAGCCt < 4:155272/149‑1 (MQ=255) ggTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTTCGTCGCTGGCGAACCAGCCTTGc < 8:92966/149‑1 (MQ=255) gTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTTCGTCGCTGGCGAACCAGCCTTGCt > 4:114928/1‑149 (MQ=255) | CCTCCCCGATGCTGGACTGCGACGCTTTCGAACGTTGCTCGAAGCCTTCGGCAGTGCCTCCTCCGCGCTCAGTGCTCCCGCTTCGGCCTGGCGAGCGTTGGGCATTCCCCAAGCCACCATCGATGCCCGGCGCAGTGCCGAGGTACGCGATGGCGCACTGGCTGCTATGGCTTGGCTGGAGCGCCCTGGCCAGCATTTGCTGATGTGGGACGGCCCAGGCTACCCAGCTTTGCTGGCAGAAATCGACGATGCCCCGCCGCTGCTTTTCGTCGCTGGCGAACCAGCCTTGCT > NC_002947/79311‑79601 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |