New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 2268094 | 40 (0.810) | 3 (0.060) | 3/250 | NT | 7.4% | coding (419/1506 nt) | purF | amidophosphoribosyl transferase |
? | NC_002947 | = 2268156 | 36 (0.750) | coding (481/1506 nt) | purF | amidophosphoribosyl transferase |
GGAGATCTACGAGTCCGACCTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTGGAATACATGATCGCCTCGGAAAGCGT > NC_002947/2268011‑2268304 | ggAGATCTACGAGTCCGACCTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAgcc > 3:222244‑M2/1‑146 (MQ=255) tCTACGAGTCCGACCTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCGGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGc > 1:60262/1‑149 (MQ=255) cGAGTCCGACCTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTg < 3:106693/149‑1 (MQ=255) gTCCGACCTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCg > 3:200212/1‑149 (MQ=255) gACCTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCGGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTa < 2:60262/149‑1 (MQ=255) cTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGc < 6:90949/149‑1 (MQ=255) gcCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCgtg > 1:107222/1‑149 (MQ=255) cACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCgtggt < 4:200212/149‑1 (MQ=255) aCGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGAGCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCGCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCgtggtg > 3:195065/1‑149 (MQ=255) cGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGtggtgg < 2:107222/149‑1 (MQ=255) cGTCAACACCAACTCCGACTCCGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGCAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGtggtgg < 7:226507/149‑1 (MQ=255) gTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTCTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGc > 3:22562/1‑149 (MQ=255) tCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTCCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGc > 5:154956/1‑148 (MQ=255) cacCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGa > 2:252855/1‑149 (MQ=255) ggAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCAt < 6:241962/132‑1 (MQ=255) ggAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCAt > 5:241962/1‑132 (MQ=255) tgctgcTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTCCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCAtcgtc < 6:154956/149‑1 (MQ=255) gctgctGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCAtcgtcg > 1:68746/1‑149 (MQ=255) tgctgAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGt < 2:68746/149‑1 (MQ=255) gtgtTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGa > 8:255425/1‑149 (MQ=255) aTGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATgg > 3:190229/1‑148 (MQ=255) gCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAgccagctcatgggcgaacacgttcagcagcacttccgagtcggagttggtgttgacgtggcgcaggtcggactcgtagatc < 3:233878‑M2/149‑82 (MQ=255) cTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAgccagctcatgggcgaacacgttcagcagcacttccgagtcggagttggtgttgacgtggcgcaggtcggactcgtagagct < 4:30650‑M2/149‑83 (MQ=255) aGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCgg < 4:22562/149‑1 (MQ=255) tGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCggtg > 8:227693/1‑149 (MQ=255) tGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCggtg < 7:227693/149‑1 (MQ=255) cAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGc < 7:255425/148‑1 (MQ=255) gCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAgccagctcatgggcgaacacgttcagcagcacttccgagtcggagttggtgttgacgtggcgcaggtcggactcgtagatctccttggccaactgctcgacattg > 4:233878‑M2/1‑44 (MQ=255) gaagaaGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACcga > 8:226213/1‑149 (MQ=255) gaagaCGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACcgacg > 1:3845/1‑148 (MQ=255) gtgtTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCa > 2:293355/1‑128 (MQ=255) gtgtTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCa < 1:293355/128‑1 (MQ=255) gtgtTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGATGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTACGGTCAGCGTCACACCGACGAAGgt > 8:55672/1‑147 (MQ=255) gtTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGtgtg > 3:97652/1‑148 (MQ=255) ttCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTgg > 3:275105/1‑148 (MQ=255) gCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTGGAAt < 4:190229/148‑1 (MQ=255) tGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGgt > 7:279992/1‑139 (MQ=255) tGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGgt < 8:279992/139‑1 (MQ=255) tctcCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTGGAATACATGATc < 7:226213/149‑1 (MQ=255) aTGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTGGAATACATGATCGCCTCg > 1:5014/1‑149 (MQ=255) tgCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTGGAATACATGATCGCCTCGGa > 3:206206/1‑148 (MQ=255) acaGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTCGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGCCGAAGGTGTGGATTACATGATCGCCTCGGAAAGc > 1:178563/1‑149 (MQ=255) aGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTGGAATACATGATCGCCTCGGAAAGCGt < 2:5014/149‑1 (MQ=255) | GGAGATCTACGAGTCCGACCTGCGCCACGTCAACACCAACTCCGACTCGGAAGTGCTGCTGAACGTGTTCGCCCATGAGCTGGCAGTGCGCGGCAAGCTGCAGCCGACCGAAGAAGACGTGTTCGCTGCGGTCTCCCATGTGCACAGCCGCTGCGTTGGCGGTTACGCCGTGGTGGCCATGATCACCGGCTACGGCATCGTCGGTTTCCGCGACCCCCATGGCATTCGCCCGGTGGTGTTCGGTCAGCGTCACACCGACGAAGGTGTGGAATACATGATCGCCTCGGAAAGCGT > NC_002947/2268011‑2268304 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |