New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | NC_002947 | = 3687632 | 62 (1.260) | 4 (0.080) | 4/246 | NT | 6.8% | coding (706/951 nt) | PP_3252 | HemK family modification methylase |
? | NC_002947 | = 3687669 | 50 (1.050) | coding (743/951 nt) | PP_3252 | HemK family modification methylase |
GCGGTACGTTCGACCTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGAAATCGACCCCGACGTATTTGGCGAGCAACTGGCTGAAC > NC_002947/3687525‑3687815 | gCGGTACGTTCGACCTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGtacg > 7:185967‑M2/1‑145 (MQ=255) gTACGTTCGACCTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTtg > 6:132993/1‑149 (MQ=255) ttCGACCTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTtgctgc > 4:248755/1‑148 (MQ=255) ttCGACCTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTgctgct < 3:248755/149‑1 (MQ=255) gACCTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCtat < 7:217061/148‑1 (MQ=255) ccTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATaca < 2:178239/149‑1 (MQ=255) gTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGt < 7:132712/149‑1 (MQ=255) ccAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGc > 6:64036/1‑148 (MQ=255) ccAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCCTCACCGTCGCGCCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACCTATCGTGGAGCACGCTCGCGATCCGCTCAGCCGCCACGGAACGTTGCTCGTATACACAGGGGTgcc > 4:226405/1‑146 (MQ=255) cccGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAg < 7:164804/137‑1 (MQ=255) cccGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAg > 8:164804/1‑137 (MQ=255) gCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTGGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTc > 6:96704/1‑148 (MQ=255) aCATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGc > 3:219780/1‑149 (MQ=255) aCATGCTTGACCCCAACGCACGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACACGGCTGGCCATTGACGAAGGc > 2:256796/1‑149 (MQ=255) cATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTc < 3:130874/142‑1 (MQ=255) cATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTc > 4:130874/1‑142 (MQ=255) cATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGcc < 8:193629/149‑1 (MQ=255) aTGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCcg > 2:146078/1‑149 (MQ=255) gACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGAt < 5:132993/147‑1 (MQ=255) gACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGc > 6:40530/1‑149 (MQ=255) cccAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCt‑t > 3:10797/1‑149 (MQ=255) cccAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCt‑t > 7:260068/1‑149 (MQ=255) cccAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCt‑t > 2:172713/1‑149 (MQ=255) cccGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGaa < 4:219780/149‑1 (MQ=255) ccGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAg > 7:128878/1‑149 (MQ=255) gCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGGCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGcc < 8:164437/149‑1 (MQ=255) aTCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGACGCCAt > 6:70445/1‑149 (MQ=255) tACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAg > 7:223387/1‑142 (MQ=255) tACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAg < 8:223387/142‑1 (MQ=255) aCCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGc > 7:69370/1‑149 (MQ=255) ccGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGcc > 6:44172/1‑149 (MQ=255) aCGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGt < 5:314230/149‑1 (MQ=255) ggTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCt < 5:64036/149‑1 (MQ=255) tGGCGGCGCGCTGGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTgg < 5:96704/149‑1 (MQ=255) ggcgCGGTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTTTCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCgg < 3:226405/149‑1 (MQ=255) gcTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGaa > 4:288280/1‑121 (MQ=255) gcTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGaa < 3:288280/121‑1 (MQ=255) cTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGa < 8:69370/149‑1 (MQ=255) cTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGa < 1:146078/149‑1 (MQ=255) aCCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTg < 3:53701/142‑1 (MQ=255) aCCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTg > 4:53701/1‑142 (MQ=255) aCCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTgg < 5:44172/149‑1 (MQ=255) ccTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTgg < 8:260068/148‑1 (MQ=255) cTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGgt < 1:172713/149‑1 (MQ=255) gCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGtacgtagcgacaggtcgacgcctagcgcgccgccaccgtgacggtagatgcgggcgttggggtcaagcatgtagggcgggttggcaacgatcaggtcgaacgta < 1:440‑M2/149‑105 (MQ=255) cTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGTCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCg > 3:60976/1‑149 (MQ=255) cGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGtacgtagcgacaggtcgacgcctagcgcgccgccaccgtgacggtagatgcgggcgttggggtcaagcatgtagggcgggttggcaacgatcaggt < 7:107640‑M2/137‑97 (MQ=255) cGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGtacgtagcgacaggtcgacgcctagcgcgccgccaccgtgacggtagatgcgggcgttggggtcaagcatgtagggcgggttggcaacgatcaggt > 8:107640‑M2/1‑41 (MQ=255) tATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGaaa > 3:282977/1‑149 (MQ=255) tCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGAAATc < 4:10797/149‑1 (MQ=255) aGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGAAATCGACCCCGAc < 1:261829/149‑1 (MQ=255) tCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTggg < 7:152920/110‑1 (MQ=255) tCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTggg > 8:152920/1‑110 (MQ=255) gCTGAGCCGCCACGGtacgtagcgacaggtcgacgcctagcgcgccgccaccgtgacggtagatgcgggcgttggggtcaagcatgtagggcgggttggcaacgatcaggtcgaacgtaccgctgataccgtccagcaagtcgctgggc > 2:440‑M2/1‑15 (MQ=255) ggcatcGGTAGGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTTTTGAAGGCGGGGAGGCGTCCGCTCGAAGCCATCTCCCTCGTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGTCTTGGGTGTATCGGGAAATCGACCGCGACGTATTTGGCGAGCAAc < 1:256796/144‑1 (MQ=255) ccACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGaa > 7:71603/1‑115 (MQ=255) ccACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGaa < 8:71603/115‑1 (MQ=255) cACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGAAATCGACCCCGACGTATTTGGCGAGCAACTGGCTg > 8:55968/1‑148 (MQ=255) gTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGAAATCGACCCCGACGTATTTGGCGAGCAACTGGCTGAAc > 7:79523/1‑147 (MQ=255) | GCGGTACGTTCGACCTGATCGTTGCCAACCCGCCCTACATGCTTGACCCCAACGCCCGCATCTACCGTCACGGTGGCGGCGCGCTAGGCGTCGACCTGTCGCTACGTATCGTGGAGCAGGCTCGCGATCGGCTGAGCCGCCACGGTACGTTGCTGCTATACACAGGGGTGGCCATTGTCGAAGGCCGCGATGCCT‑TGCTCGAAGCCAT‑‑‑CCGCCTGCGTCTGGCCGGTCCGGATTGGGCTTGGGTGTATCGGGAAATCGACCCCGACGTATTTGGCGAGCAACTGGCTGAAC > NC_002947/3687525‑3687815 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |