| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
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| * | ? | NC_002947 | = 5859694 | 67 (1.360) | 4 (0.080) | 4/250 | NT | 5.5% | coding (292/1026 nt) | PP_5135 | ABC transporter substrate‑binding protein |
| ? | NC_002947 | = 5859734 | 73 (1.510) | coding (252/1026 nt) | PP_5135 | ABC transporter substrate‑binding protein | |||||
GAAGCAAATGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGTTTTCAGTTGC > NC_002947/5859590‑5859881 | gAAGCAAATGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATgccg > 4:89076/1‑149 (MQ=255)gAAGCAAATGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATgccg > 2:209060/1‑149 (MQ=255) gCAAATGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATgccgc > 1:255115/1‑147 (MQ=255) gCAAATGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATgccgc > 6:189503/1‑147 (MQ=255) aaTGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGcc < 4:229720/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGccc < 6:186552/149‑1 (MQ=255) aTGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGccc < 2:139011/149‑1 (MQ=255) tggCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCca > 4:40010/1‑148 (MQ=255) ggcggcCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCcaca < 6:211426/149‑1 (MQ=255) cgccccACACGTCCATGCCGAAACAGGCAGGCGGGTTGTCGGATTCGAGATAATTGACGCAGATCTTGCCCACGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCTAGCAATCCGT‑TGTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCAAGCCCacacccc > 8:255875/4‑146 (MQ=255) cacaCGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTc < 1:307173/149‑1 (MQ=255) cATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGc < 3:89076/148‑1 (MQ=255) aTGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCgg > 5:292345/1‑149 (MQ=255) aTGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCgg < 3:40010/149‑1 (MQ=255) gCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGAt > 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cTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTcc < 2:135414/149‑1 (MQ=255) tGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCg > 2:194526/1‑149 (MQ=255) tGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCg > 6:262175/1‑149 (MQ=255) gCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTc > 4:129522/1‑124 (MQ=255) gCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTc < 3:129522/124‑1 (MQ=255) ggTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCTCTCTTTCTCCGCcagc < 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gcgATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGtga < 1:209060/149‑1 (MQ=255) aTAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCg < 3:285125/113‑1 (MQ=255) aTAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCg > 4:285125/1‑113 (MQ=255) tGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTg < 2:64707/134‑1 (MQ=255) tGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTg > 1:64707/1‑134 (MQ=255) ccGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGt < 2:190836/149‑1 (MQ=255) cGGAGATCTTTCCCAGGTCCTGTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGCTGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCATCTTGCGTGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGt < 8:275107/148‑1 (MQ=255) cGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCTGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTg > 1:93012/1‑149 (MQ=255) gagaTCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGa < 3:13698/149‑1 (MQ=255) gagaTCTTGCCCAGGTCCTTTGACGCATAGGCTTCGAGCATCCCGT‑TCTGGTCCAGGATGGCCAGACTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTACGCCAGAAGCTTCGCGGTGATGATA‑CCCGTgg > 2:249572/1‑148 (MQ=255) cccAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCAc > 7:271322/1‑149 (MQ=255) 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gCCAGGCTCGATgcctatgcgccaaaggacctgggcaagatctccggcaattatcgcgacgccgccaacccgccagcctgggtcggcatggacgtgtgggccgccaccatttgcttcaacaccatcgaggccgagaaacagggtctga > 1:135556‑M2/1‑12 (MQ=255) gCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGt < 3:200599/149‑1 (MQ=255) cAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGttt > 3:284904/1‑149 (MQ=255) aGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGtttt < 4:272592/149‑1 (MQ=255) gCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCCCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGTTTTCa < 5:272446/149‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGtttt > 3:245105/1‑145 (MQ=255) tCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGtttt < 4:245105/145‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGTTTTCAGt > 2:39278/1‑149 (MQ=255) tCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTAGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAg < 7:268627/140‑1 (MQ=255) tCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTAGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAg > 8:268627/1‑140 (MQ=255) aTGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGTTTTCAGTTGc < 5:320866/149‑1 (MQ=255) | GAAGCAAATGGTGGCGGCCCACACGTCCATGCCGACCCAGGCTGGCGGGTTGGCGGCGTCGCGATAATTGCCGGAGATCTTGCCCAGGTCCTTTGGCGCATAGGCTTCGAGCATGCCGT‑TCTGGTCGAGGATGGCCAGGCTCGATGCCGCCAGCCCCCACACAGCGTCAGCTTGCGGGCGCTCTTTCTCCGCCAGCAGCTTGGCGGTGATGATA‑CCGGTGGAATCACGCACCCACTTGATCTCGATATCCGGGTTGGCTTTCTCGAAGGCCTGCTTGTAGGTTTTCAGTTGC > NC_002947/5859590‑5859881 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |