| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,716,352 | G→T | 5.5% | S528I (AGT→ATT) | PP_4173 → | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,716,352 | 0 | G | T | 5.5% | 239.6 / 3.4 | 73 | S528I (AGT→ATT) | PP_4173 | two‑component system sensor histidine kinase/response regulator |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/36); new base T (2/2); total (35/38) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.25e-01 | |||||||||||
GCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGCTATGAAG > NC_002947/4716208‑4716495 | gCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTc > 6:41566/1‑149 (MQ=255) cTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCCACCGGAGggtggt > 4:267787/1‑149 (MQ=255) cTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGt > 5:239000/1‑149 (MQ=255) cTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGt < 8:237191/149‑1 (MQ=255) cTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGt < 5:41566/149‑1 (MQ=255) ggTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTgg < 4:101245/148‑1 (MQ=255) ggTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGa < 1:111971/149‑1 (MQ=255) gACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGTCAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGcc < 1:192361/148‑1 (MQ=255) gACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACACTCCGGTTGACCGGATTGTcct < 8:265988/141‑3 (MQ=255) gACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACACTCCGGTTGACCGGATTGTcct > 7:265988/1‑139 (MQ=255) aCCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑At < 6:147408/149‑1 (MQ=255) ccTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑Atg < 2:230270/149‑1 (MQ=255) ccTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑Atg < 6:239000/149‑1 (MQ=255) cTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑Atgc > 2:13462/1‑149 (MQ=255) aCCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑Atgctgc < 3:267787/148‑1 (MQ=255) cccTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGCCGCCGCCAACGACTGTACGCACGACGG‑TGCCGGACAATGAACAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGCTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTgcg > 6:104827/1‑148 (MQ=255) ccTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTgcg > 5:7807/1‑147 (MQ=255) gCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAg > 5:267052/1‑148 (MQ=255) ccTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTAt > 2:273807/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTAt > 7:185014/1‑149 (MQ=255) ccTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCag > 4:233361/1‑148 (MQ=255) cTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCag > 7:187545/1‑147 (MQ=255) gCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCagaa > 2:54493/1‑147 (MQ=255) gCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCagaa < 1:54493/147‑1 (MQ=255) cccccGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGAt > 7:171855/1‑149 (MQ=255) cccgtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCa < 6:112865/141‑1 (MQ=255) cccgtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCa > 5:112865/1‑141 (MQ=255) cgtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGcc < 6:30649/149‑1 (MQ=255) gtcccgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGGTTGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGcc > 1:216226/1‑149 (MQ=255) cgtTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTg > 1:33326/1‑147 (MQ=255) aCGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGAACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGt > 8:296671/1‑149 (MQ=255) cgccAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCag < 7:92969/126‑1 (MQ=255) cgccAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCag > 8:92969/1‑126 (MQ=255) cgccAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAg < 1:273807/149‑1 (MQ=255) cAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTg < 1:13462/149‑1 (MQ=255) tACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCt < 7:206184/139‑1 (MQ=255) tACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCt > 8:206184/1‑139 (MQ=255) tACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTcggccgg < 2:216226/149‑1 (MQ=255) gaacgaCGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAg > 8:49491/1‑149 (MQ=255) gacgG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCt > 5:313194/1‑149 (MQ=255) ccGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTtgctg < 7:49491/148‑1 (MQ=255) ccGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTAGGCCGGCAGCGCTTtgctgc > 3:145792/1‑149 (MQ=255) gACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGt > 3:62459/1‑149 (MQ=255) aaTGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCt > 8:215066/1‑149 (MQ=255) aaTGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTAGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTCGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCt > 3:150616/1‑149 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCGGGTCCACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCTGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGa < 5:104827/149‑1 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGa < 4:62459/149‑1 (MQ=255) tGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGACAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGGAGCGCGTTGCTGCCGTGCGGa > 4:4503/1‑149 (MQ=255) aTCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGACAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGAt < 3:4503/148‑1 (MQ=255) tCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTgg > 7:115663/1‑74 (MQ=255) tCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTgg < 8:115663/74‑1 (MQ=255) aGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGa < 6:313194/148‑1 (MQ=255) aGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGGCGTGGAAGCC‑ATGCTGCTCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGAt < 4:273427/149‑1 (MQ=255) ggTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGAtt < 2:294828/149‑1 (MQ=255) ggTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGGCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGAtt < 6:267052/149‑1 (MQ=255) gTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTg > 6:44595/1‑149 (MQ=255) ctgctgGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTgccg < 3:233361/149‑1 (MQ=255) ctgGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTgccgcc > 3:61887/1‑148 (MQ=255) ggaCAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCAcc > 4:25959/1‑149 (MQ=255) cAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTgg < 8:171855/149‑1 (MQ=255) cAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTACCTCACCTgg < 4:61887/149‑1 (MQ=255) aaTCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTggg < 5:225765/149‑2 (MQ=255) aTCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGAc < 5:44595/149‑1 (MQ=255) tCCGGTTGACCGGATTGTCGTGGAAGCCTATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATgg > 1:178842/1‑126 (MQ=255) tCCGGTTGACCGGATTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATgg < 2:178842/125‑1 (MQ=255) tCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGGCGCCTGCCTGACCTGGACg < 4:150616/149‑1 (MQ=255) tCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACg > 7:120191/1‑149 (MQ=255) ggTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGc > 1:149310/1‑148 (MQ=255) gTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGCTa < 3:25959/149‑1 (MQ=255) ccGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGCTATg > 8:277746/1‑146 (MQ=255) ccGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGCTATGaa < 7:277746/148‑1 (MQ=255) ccGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGCTATGAAg < 8:185014/149‑1 (MQ=255) ccGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGCTATGAAg < 2:149310/149‑1 (MQ=255) | GCCTGGGTTCGACCTTCACCCTGGAGATGCCGTTGGCCCTTGCCAACCCTGCCCCCGTCCCGTTGACGCCGCCAACGACTGTACGAACGACGG‑TGCCGGACAATGATCAGGTACTGCTGGTGGAGGACAATCCGGTCAACCGGAGTGTCGTGGAAGCC‑ATGCTGCGCAGCCTGGGGCTGGCAGTATGCACGGCAGAAGATGGCCTTGAAGCCGTCGAGCTGGTCGGCCGGCAGCGCTTTGCTGCCGTGCTGATGGATTGCCGCCTGCCTCACCTGGACGGCTATGAAG > NC_002947/4716208‑4716495 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |