| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 4,762,842 | C→G | 5.2% | A60A (GCC→GCG) | pvdO → | pyoverdine biosynthesis‑like protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 4,762,842 | 0 | C | G | 5.2% | 248.1 / 2.2 | 76 | A60A (GCC→GCG) | pvdO | pyoverdine biosynthesis‑like protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/38); new base G (2/2); total (36/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.31e-01 | |||||||||||
CCCGGTTCACGCCTCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGATGCCTATATCCGCGAGAG > NC_002947/4762694‑4762988 | cccGGTTCACGCCTCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCccgcc > 1:295161/1‑149 (MQ=255) ccGGTTCACGCCTCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCccgccg < 3:237942/149‑1 (MQ=255) cGGTTCACGCCTCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCgg < 3:276773/149‑1 (MQ=255) cGGTTCACGCCTCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCgg < 2:168998/149‑1 (MQ=255) aCGCCTCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCtt > 8:46394/1‑149 (MQ=255) tCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGa > 7:84859/1‑149 (MQ=255) ggttGCGCCACTTGTGCTTCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCTGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGa < 2:264669/145‑1 (MQ=255) gCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGAt < 6:114497/148‑1 (MQ=255) gCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATg < 8:84859/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATg‑g > 2:160995/1‑149 (MQ=255) ttGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGccc > 7:233188/1‑147 (MQ=255) ttGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGccc > 2:104302/1‑147 (MQ=255) gtgCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGa > 6:174335/1‑147 (MQ=255) gtgCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGa < 5:174335/147‑1 (MQ=255) gtgCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGa < 2:295161/147‑1 (MQ=255) tgctgcCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTc < 7:274251/129‑1 (MQ=255) tgctgcCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTc > 8:274251/1‑129 (MQ=255) ctgcCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATg < 1:160995/149‑1 (MQ=255) cTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGcc > 4:124844/1‑149 (MQ=255) cTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCAGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATg‑g < 6:228866/130‑1 (MQ=255) cTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCAGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATg‑g > 5:228866/1‑130 (MQ=255) gCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCGAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTGTTCCGCGTCTGCATGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTGC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCg < 2:73832/148‑1 (MQ=255) ttGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAg > 8:124443/1‑149 (MQ=255) ggTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAg < 1:104302/147‑1 (MQ=255) gTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGc > 5:4106/1‑149 (MQ=255) cTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGa > 7:118816/1‑149 (MQ=255) ggCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCGAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGAt > 2:137838/1‑147 (MQ=255) ggCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGAt > 7:130242/1‑147 (MQ=255) ggCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGAt < 3:138657/147‑1 (MQ=255) ggCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGAt < 3:133872/147‑1 (MQ=255) cgccAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCTGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTc > 8:33337/1‑149 (MQ=255) cAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCcac < 7:124443/149‑1 (MQ=255) gTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAgg < 2:279752/141‑1 (MQ=255) gTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAgg > 1:279752/1‑141 (MQ=255) ccAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGcaca > 8:221988/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCacac < 5:141261/149‑1 (MQ=255) gccgccAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGt < 8:233188/149‑1 (MQ=255) gccgccAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGt > 4:274329/1‑149 (MQ=255) ccgccAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGt > 5:136348/1‑148 (MQ=255) ccgccAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTg < 6:4106/149‑1 (MQ=255) cgccAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCTGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGa < 7:33337/149‑1 (MQ=255) cgccAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGGGGGGTAGAGGTTCGGAGATGAGGTACGCCCCAGAATGAGCCCGGGGGCGAGGGCGAGAAGGGTCCCCAGca > 1:101882/1‑149 (MQ=255) gccagccaGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGAc > 7:37430/1‑149 (MQ=255) ccagccCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTg < 1:137838/149‑1 (MQ=255) ccagccCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTg < 8:12216/149‑1 (MQ=255) cagccCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGt > 5:882/1‑126 (MQ=255) cagccCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGt < 6:882/126‑1 (MQ=255) agccCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGcgcg > 5:33943/1‑111 (MQ=255) agccCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGcgcg < 6:33943/111‑1 (MQ=255) cccAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAg < 1:117240/124‑1 (MQ=255) cccAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAg > 2:117240/1‑124 (MQ=255) cccAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCAt > 4:236979/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCAtt < 6:136348/149‑1 (MQ=255) gCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGc > 2:2488/1‑148 (MQ=255) gAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAAc < 6:124059/139‑1 (MQ=255) gAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAAc > 5:124059/1‑139 (MQ=255) gAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTc > 2:181467/1‑144 (MQ=255) gAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTc < 1:181467/144‑1 (MQ=255) gAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCAt > 6:54260/1‑149 (MQ=255) ttCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCg > 7:155639/1‑149 (MQ=255) gCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGAc > 4:21133/1‑112 (MQ=255) gCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGAc < 3:21133/112‑1 (MQ=255) cAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑Tc < 5:54260/148‑1 (MQ=255) cAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCa < 8:155639/149‑1 (MQ=255) gcggcCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGc < 7:46394/149‑1 (MQ=255) ccTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGc > 7:286376/1‑149 (MQ=255) ggAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTg > 3:252421/1‑148 (MQ=255) aaaTGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGAt < 3:124844/149‑1 (MQ=255) ttggtggGGCTCGCCGGGGG‑‑‑‑‑‑CTGCTTC‑GTGTTG‑GGTACGCGGGTGGATGTGGGCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACGGTGACGTTTGCCAAAGGATTCGCCATCAGGCGCTTCCATG‑TCTCCGCAGGGGAACTGGATgg < 2:95530/148‑2 (MQ=255) aTGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGATGc < 8:286376/149‑1 (MQ=255) cgaagctgcCGGCGGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGATGCCta > 7:224708/5‑148 (MQ=255) gtgCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATGCTCACCGCAGGCGAACTGGATGCCtat < 1:2488/148‑1 (MQ=255) tgctgcCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGATGCCTATATc < 8:37430/149‑1 (MQ=255) agctgcCGGCGGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTg < 4:275326/89‑1 (MQ=255) agctgcCGGCGGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTg > 3:275326/2‑90 (MQ=255) ctgcCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGAGGAGCCCGGGCGCGCGGGCGATGCGGGTCCACAGCACACCGTGACCGTGGCCCAACACTTCGACATCAGCCGCTACCATG‑GCACCGCAGGc > 1:194676/1‑129 (MQ=255) ctgcACGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGGACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGc < 2:194676/129‑1 (MQ=255) cccGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGATGCCTATATCcgc < 8:130242/147‑1 (MQ=255) gccgG‑‑‑‑‑‑CAGATTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGATGCCTATATCCGCGagag > 1:89448/1‑149 (MQ=255) | CCCGGTTCACGCCTCGCTTGCGCCACTTGTGCTGCCTGGCCGTGCTTGGTCTGGGCGCCGCCAGTGCCCAGGCCGCCAGCCAGCCCACCCCAGGCGAAGTCTTCCGCGACTGCAAGGCGGCCTGCCCGGAAATGGTGGTGCTGCCCGCCGG‑‑‑‑‑‑CAGCTTC‑GTGATG‑GGTACGCCCGAGGATGAGCCCGGGCGCGAGGGCGATGAGGGTCCACAGCACACCGTGACCTTTGCCAAACCATTCGCCATCAGCCGCTACCATG‑TCACCGCAGGCGAACTGGATGCCTATATCCGCGAGAG > NC_002947/4762694‑4762988 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |