| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,082,380 | G→A | 5.8% | T629I (ACC→ATC) | alaS ← | alanine‑‑tRNA ligase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,082,380 | 0 | G | A | 5.8% | 206.3 / 2.4 | 69 | T629I (ACC→ATC) | alaS | alanine‑‑tRNA ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/32); new base A (2/2); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.06e-01 | |||||||||||
CAGGCTGATGTCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGAGCCCTTCTGCTGT > NC_002947/5082232‑5082526 | cAGGCTGATGTCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCG‑CCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGt > 7:73026/1‑149 (MQ=255) gCTGATGTCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGt > 3:290791/1‑147 (MQ=255) gCTGATGTCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGt > 4:292972/1‑147 (MQ=255) gCTGATGTCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGt > 4:288194/1‑147 (MQ=255) aTGTCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTc < 4:290791/149‑1 (MQ=255) tCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGt < 1:63793/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTc < 7:211987/149‑1 (MQ=255) ccGGTGCGCTTGGCGGGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTc < 4:282919/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAAc > 7:294638/1‑149 (MQ=255) gcTTGGCGTGGATACCTCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGGTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCggg > 6:77795/1‑149 (MQ=255) ttGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCgggg > 8:190213/1‑148 (MQ=255) cGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTc > 7:70209/1‑149 (MQ=255) tGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTAtt > 5:261389/1‑146 (MQ=255) tGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTAtt < 6:261389/146‑1 (MQ=255) aCCGCCGCACAATTCCCCCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACCCGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACCTCGCCATTGCGCCTGTGGCCTTGGAAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAAACGGGGTATTCTTGCTaa > 3:8883/1‑149 (MQ=255) cgccgcACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCGTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGCAtc > 4:87341/1‑149 (MQ=255) gccgcACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGtt < 4:249890/124‑1 (MQ=255) gccgcACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGtt > 3:249890/1‑124 (MQ=255) gccgcACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAAtct > 6:5411/1‑149 (MQ=255) ccgcACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGAGGTCGGTCAGTTCGGTTTCAGCCGGGGTATTCTTGCGAAtctc > 8:146837/1‑149 (MQ=255) gcACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTcgc < 7:16871/149‑1 (MQ=255) cACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCggg < 1:142416/121‑1 (MQ=255) cACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCggg > 2:142416/1‑121 (MQ=255) cACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGa < 8:294638/149‑1 (MQ=255) cGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGt > 7:272962/1‑149 (MQ=255) gAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTc > 2:23571/1‑149 (MQ=255) gAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGATCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTc > 6:219414/1‑149 (MQ=255) gAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGATCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTc > 6:214747/1‑149 (MQ=255) aaaaaTCACCGCCCATTATCAGCACACGCACTGTGTCGCCGTATTTCTCGACGAACAGCGCAAATGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGTTTTCAACAGGCGTATTCTTTCGAATCTCGCTGTTGCCGATGTCt > 4:176039/1‑149 (MQ=255) aaaaaTCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCggg < 7:45348/116‑1 (MQ=255) aaaaaTCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCggg > 8:45348/1‑116 (MQ=255) aaaaTCACCGCCCATGCTCAGAACACGCACTGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGGCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCtt < 3:176039/149‑1 (MQ=255) aaTCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTcc < 8:272962/149‑1 (MQ=255) aaTCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTcc < 3:122460/149‑1 (MQ=255) ccgccATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAgctgc < 8:73026/146‑1 (MQ=255) cccATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCtt > 8:85453/1‑113 (MQ=255) cccATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCtt < 7:85453/113‑1 (MQ=255) aGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAgctgc > 5:33483/1‑138 (MQ=255) aGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAgctgc < 6:33483/138‑1 (MQ=255) cacaCGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTAtt < 7:113841/99‑1 (MQ=255) cacaCGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTAtt > 8:113841/1‑99 (MQ=255) cacgcacgTTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACCGCGCCATTGCGCCTTTTGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGTTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGc < 4:8883/149‑1 (MQ=255) cacgcacgGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGc < 5:5411/149‑1 (MQ=255) acgcacgGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGACTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCt > 1:61765/1‑149 (MQ=255) acgGTGTCGCCGTATTTCTAGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTGGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATGTCGCGGTTGAGGATGTCTTGCAGGTGCTTGATGTGCTCCGGCTGCAc > 8:43742/1‑149 (MQ=255) gCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCg > 8:178602/1‑148 (MQ=255) ccGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTc < 5:305784/113‑1 (MQ=255) ccGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTc > 6:305784/1‑113 (MQ=255) ccGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCg > 2:256613/1‑147 (MQ=255) gTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGt < 8:232406/149‑1 (MQ=255) tcGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTgg < 3:15856/144‑1 (MQ=255) tcGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTgg > 4:15856/1‑144 (MQ=255) gCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGt > 4:58711/1‑149 (MQ=255) aCAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTGGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTTTTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGaaa < 7:43742/149‑1 (MQ=255) cgcCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCgctgg > 5:97195/1‑149 (MQ=255) cgcCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCgctgg < 3:288194/149‑1 (MQ=255) cgcCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCgctgg < 3:67954/149‑1 (MQ=255) cgcCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTAGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCgctgg < 1:283486/149‑1 (MQ=255) gcCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGATTCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCgctggc < 2:61765/149‑1 (MQ=255) tttGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCggg < 3:44217/46‑1 (MQ=255) tttGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCggg > 4:44217/1‑46 (MQ=255) ggCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGc < 7:178602/148‑1 (MQ=255) gCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGa < 3:292972/149‑1 (MQ=255) cAGTTTCGATGTCGGTCAGGTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGAg < 4:146204/149‑1 (MQ=255) cGATGTCGATCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGAGCCCtt < 5:214747/148‑1 (MQ=255) cGATGTCGATCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGAGCCCtt < 5:219414/148‑1 (MQ=255) tCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGAGCCCTTctgctg > 6:229980/1‑149 (MQ=255) cGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGtt < 2:204305/46‑1 (MQ=255) cGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGtt > 1:204305/1‑46 (MQ=255) ggTCAGTTCTGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGAGCCCTTCTGCTGt < 8:70209/148‑1 (MQ=255) | CAGGCTGATGTCACCGGTGCGCTTGGCGTGGATACCGCCGCACAATTCCACCGAAAAATCACCGCCCATGCTCAGCACACGCACGGTGTCGCCGTATTTCTCGCCGAACAGCGCCATTGCGCCTTTGGCCTTGGCAGTTTCGATGTCGGTCAGTTCGGTTTCAACCGGGGTATTCTTGCGAATCTCGCGGTTGACGATGTCTTCCAGCTGCTTGATCTGCTCCGGCTTCACCGCTTCGAAGTGGCTGAAGTCGAAACGCAGGCGCTGGCTGTCGACCAGCGAGCCCTTCTGCTGT > NC_002947/5082232‑5082526 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |