| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 507,557 | G→A | 7.0% | A485V (GCG→GTG) | estP ← | esterase EstP |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 507,557 | 0 | G | A | 7.0% | 170.7 / 2.1 | 57 | A485V (GCG→GTG) | estP | esterase EstP |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (24/29); new base A (2/2); total (26/31) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.95e-01 | |||||||||||
CCCCACGCCCAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAGGTGCCCGGCGGTCAGCGCCGCGTCGGCC > NC_002947/507409‑507700 | ccccACGCCCAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGgccg > 4:12331/1‑149 (MQ=255) cccACGCCCAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGTTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGgccgc < 4:58891/149‑1 (MQ=255) aCGCCCAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAg > 5:192425/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTg < 7:175148/149‑1 (MQ=255) ccAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTg > 5:8422/1‑149 (MQ=255) cAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTg > 4:303136/1‑148 (MQ=255) gcggcgTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGc < 6:192425/149‑1 (MQ=255) gcgGGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAACCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCa < 8:48499/149‑1 (MQ=255) tGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGt < 2:238434/140‑1 (MQ=255) tGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGt > 1:238434/1‑140 (MQ=255) gAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAgccgcc > 6:179995/1‑131 (MQ=255) gAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAgccgcc < 5:179995/131‑1 (MQ=255) gAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCt > 1:42794/1‑149 (MQ=255) cAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCg < 3:182140/149‑1 (MQ=255) aaGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGt < 6:8422/149‑1 (MQ=255) cgcCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCa < 3:234206/135‑1 (MQ=255) cgcCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCa > 4:234206/1‑135 (MQ=255) cGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACa > 7:99306/1‑118 (MQ=255) cGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACa < 8:99306/118‑1 (MQ=255) cGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCtt < 3:12331/149‑1 (MQ=255) tcttctCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCACCAGGTTGTa < 7:214526/94‑1 (MQ=255) tcttctCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCACCAGGTTGTa > 8:214526/1‑94 (MQ=255) cttctCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGc < 7:75163/149‑1 (MQ=255) ttctCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTa < 6:282443/92‑1 (MQ=255) ttctCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTa > 5:282443/1‑92 (MQ=255) ctcGTCGTAGCCATCCCCCTTCACCCGCGCCTCGTCGGCACTGATCAACGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTGGTCGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGc < 4:119052/146‑1 (MQ=255) ctcGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGc < 4:114423/146‑1 (MQ=255) ctcGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCgg < 1:165853/148‑1 (MQ=255) ctcGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCACCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTc > 5:25381/1‑120 (MQ=255) ctcGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCACCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTc < 6:25381/120‑1 (MQ=255) ctcGTCCTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCgg > 2:165853/1‑148 (MQ=255) tcgtcgTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGcc > 3:278071/1‑134 (MQ=255) tcgtcgTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGcc < 4:278071/134‑1 (MQ=255) gtAGCCATCCAGCTTCAGCCGCGCATAGTCGGCACTGATGATAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCTGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCa < 6:315241/149‑1 (MQ=255) aTCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTg < 3:229503/133‑1 (MQ=255) aTCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTg > 4:229503/1‑133 (MQ=255) aTCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGGTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGcc > 3:170811/1‑147 (MQ=255) tCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAg > 4:147479/1‑149 (MQ=255) cTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCg > 6:80306/1‑148 (MQ=255) cACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGGCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCTTGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGaa < 1:82071/147‑1 (MQ=255) aCCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAgg > 8:207269/1‑148 (MQ=255) ccGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGccc > 5:93441/1‑136 (MQ=255) ccGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGccc < 6:93441/136‑1 (MQ=255) gcATAGTCTGCACTGATGACAGGTGCCAACTGCCAGGTGCTGGTGGCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCtt < 4:170811/149‑1 (MQ=255) gcATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCtt < 3:303136/149‑1 (MQ=255) aTAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCa > 8:190163/1‑131 (MQ=255) aTAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCa < 7:190163/131‑1 (MQ=255) tAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAg > 6:265269/1‑149 (MQ=255) gTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGt < 5:265269/149‑1 (MQ=255) ggCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGc < 5:80306/149‑1 (MQ=255) gaAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATc > 1:288178/1‑147 (MQ=255) aaaGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAg < 3:147479/149‑1 (MQ=255) gTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAGGTGc < 8:93636/149‑1 (MQ=255) tGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAGGTGCCCGGCGGTCAGCGCcgcg > 1:141604/1‑149 (MQ=255) gtgtCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAGGTGCCCGGCGGTCAGCGCCGCGTc > 2:33433/1‑149 (MQ=255) gtCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCATGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAGGTGCCCGGCGGTCAGCGCCGCGTCgg < 3:301205/149‑1 (MQ=255) tCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCtt < 7:222271/104‑1 (MQ=255) tCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCtt > 8:222271/1‑104 (MQ=255) ggCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAGGTGCCCGGCGGTCAGCGCCGCGTCGGcc > 6:65805/1‑148 (MQ=255) | CCCCACGCCCAGGCGGCGTGACGTGCGCTCCTGGTCATCGAAGCCAAGCGCCGTCGAACGTCCGCTCTTCTCGTCGTAGCCATCCACCTTCACCCGCGCATAGTCGGCACTGATGAAAGGTGCCAACTGCCAGTTGCTGGTGTCGGCCGCCAGGTTGTAGCCCAGCCGCCCGGACATTGCCCAGGCCTCGCCGTCGGTGTCGCCCTTCTCACTGCGGTCATTCACGCCCAGGGCGAAGGTACGCTTGAGGTCGCTGTAATCCAGGTGCCCGGCGGTCAGCGCCGCGTCGGCC > NC_002947/507409‑507700 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |