| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,368,670 | G→T | 7.1% | R14S (CGC→AGC) | greA ← | transcription elongation factor GreA |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,368,670 | 0 | G | T | 7.1% | 206.9 / 4.4 | 68 | R14S (CGC→AGC) | greA | transcription elongation factor GreA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/28); new base T (3/2); total (38/30) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.75e-01 | |||||||||||
GCGCTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTGCAG > NC_002947/5368523‑5368814 | gcgcTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGa < 3:1134/149‑1 (MQ=255) gcTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAgc < 1:305615/149‑1 (MQ=255) cGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGccc > 2:74412/1‑149 (MQ=255) gACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCt < 7:95299/149‑1 (MQ=255) ccATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCTCGCGCCCTgg < 8:2142/149‑1 (MQ=255) cATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCTCGCGCCCTGGa < 8:274160/149‑1 (MQ=255) ctcACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCggg > 5:58275/1‑148 (MQ=255) ctcACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGt < 1:116897/149‑1 (MQ=255) gggCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCCCCAATGGCCTGACTAAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGCACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTg > 4:57725/1‑149 (MQ=255) cggcATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTa < 6:106705/149‑1 (MQ=255) tATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATc > 4:8338/1‑129 (MQ=255) tATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATc < 3:8338/129‑1 (MQ=255) tATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCAt < 5:189922/149‑1 (MQ=255) aTTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATg > 8:198885/1‑149 (MQ=255) cGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCa < 6:58275/149‑1 (MQ=255) gTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTACACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCACGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCCCCCAGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTACAg > 4:75040/1‑149 (MQ=255) cTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAAt < 4:220147/129‑1 (MQ=255) cTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAAt > 3:220147/1‑129 (MQ=255) cTTGAGGGCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGCCTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCtgc < 6:188226/149‑1 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGt > 8:53764/1‑118 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGt < 7:53764/118‑1 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt > 3:21520/1‑139 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCttt < 4:21520/139‑1 (MQ=255) ttGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCtgca > 1:44232/1‑149 (MQ=255) aGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCtgcatgc < 2:17057/149‑1 (MQ=255) ggTCACCCAGCTGACGCGCTTCACCAATGGCCAGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCggg > 2:109046/1‑113 (MQ=255) ggTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGTATCAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCtgcatgc < 3:226426/148‑1 (MQ=255) tCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCtgcatg > 7:135614/1‑145 (MQ=255) aCCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATc > 3:251847/1‑149 (MQ=255) cccAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATg > 8:256376/1‑126 (MQ=255) cccAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATg < 7:256376/126‑1 (MQ=255) aGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTg > 1:309481/1‑148 (MQ=255) aGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTg > 3:102730/1‑148 (MQ=255) tCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAg > 8:190170/1‑149 (MQ=255) gcgcTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGcgac > 1:125048/1‑149 (MQ=255) cTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGaa < 4:251847/149‑1 (MQ=255) tCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATg < 4:32700/105‑1 (MQ=255) tCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATg > 3:32700/1‑105 (MQ=255) ccAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTc < 2:309481/149‑1 (MQ=255) ccAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTc < 4:102730/149‑1 (MQ=255) cAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATTCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACgtgcg > 8:110163/1‑145 (MQ=255) cAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCt > 5:109310/1‑149 (MQ=255) gccggtcTCATGCTCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACCCGTGCGCTTCTTCCCGGGCGCGAGCGCCCTTGCCTGTCATCGGGTATTTGGTAATTCTCATTCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTCCAAGCGACGAACGGTCTTTTcc < 7:198885/143‑1 (MQ=255) ccTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGACCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCg < 2:44232/149‑1 (MQ=255) tGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGa > 3:171599/1‑149 (MQ=255) tCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGATCATGATTTCAG‑TCATGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCg > 7:166207/1‑148 (MQ=255) aGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGTAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAGCTCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGaa < 1:74412/149‑1 (MQ=255) gggCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAgc < 7:190170/149‑1 (MQ=255) ttGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATg > 5:298725/1‑149 (MQ=255) tCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCtt < 5:70970/137‑1 (MQ=255) tCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCtt > 6:70970/1‑137 (MQ=255) aGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCa > 3:126010/1‑149 (MQ=255) gAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCAc > 5:209388/1‑148 (MQ=255) cAGGTGCTCTTCTTCCCGGGCGCGAGCGCCCTGGACTGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGc < 8:135614/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGcc < 3:75040/149‑1 (MQ=255) gTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCg > 5:316741/1‑148 (MQ=255) gTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCCAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCg > 6:84136/1‑148 (MQ=255) ttcCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgt > 5:65420/1‑149 (MQ=255) gtcCAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATGGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTGCGGACAGAATTTAAGCGCTTAGCAGATGGCTTc > 1:26234/2‑131 (MQ=255) tcCAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtg > 3:288705/1‑149 (MQ=255) tcCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGTTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCCCTACCCACATCGCTACACCAGCCGCAATGGTAgtg > 7:223880/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGCTCGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtgg > 5:74974/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtgg > 2:294685/1‑149 (MQ=255) ccAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAg < 3:57725/146‑1 (MQ=255) cAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtggt > 1:5179/1‑149 (MQ=255) cAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtggt > 6:83712/1‑149 (MQ=255) aGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAgtggtg > 1:199734/1‑149 (MQ=255) gcgcGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTGCAg < 6:316741/149‑1 (MQ=255) | GCGCTTCGACCATGCCCTGCTCCTCACGGGCGGCATGGTATTCGGCGTTTTCCTTGAGGTCACCCAGCTCACGCGCTTCACCAATGGCCTGACTCAGGCGCGGGCGCTCGGTCTTGCTCAGGAACAGGTGCTCTTCTTCCAGGGCGCGAGCGCCCTGGACGGTCATCGGGTATTTGGTAATGCTCATGCTTTCAG‑TCCTGCATGCAGATCCTGCAAGCGACGAACGGTCTTTTCCGGACCGAATTTCAGCGCTTCGCAGATGGCTTCACCAGCCGCAATGGTAGTGGTGCAG > NC_002947/5368523‑5368814 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |