Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,558,505 | A→T | 7.2% | S250T (TCC→ACC) | purA ← | adenylosuccinate synthetase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,558,505 | 0 | A | T | 7.2% | 210.3 / 5.6 | 69 | S250T (TCC→ACC) | purA | adenylosuccinate synthetase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/33); new base T (2/3); total (33/36) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.91e-01 |
CGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGTGACGTCGAGC > NC_002947/5558358‑5558647 | cGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGa > 3:73043/1‑148 (MQ=255) aaCTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGaaa > 4:232794/1‑148 (MQ=255) accttGGCCAAGCGTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATac > 6:148145/5‑149 (MQ=255) gCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGTATTTCCACCgg < 5:14297/149‑1 (MQ=255) ttGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAgtggt > 5:295516/1‑149 (MQ=255) cAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGTATTTCCACCggtt > 4:172960/1‑137 (MQ=255) cAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGTATTTCCACCggtt < 3:172960/139‑3 (MQ=255) cAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCAATTGGGGTAGGCCTTGGTGATACCGAGCTTTTTGTGGAGTGGCAACGGCCCGCCCCCGCAACCGGTGGAAATACAACCGGAAGTGTTGTTgg > 6:27184/1‑149 (MQ=255) aCCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGa > 1:7618/1‑149 (MQ=255) ccGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGAc < 6:191236/149‑1 (MQ=255) ggctcGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTa < 6:40777/147‑1 (MQ=255) gTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTa > 5:197953/1‑149 (MQ=255) tctcGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGTATTTCCACCggttcc > 8:220811/1‑123 (MQ=255) tctcGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGTATTTCCACCggttcc < 7:220811/127‑5 (MQ=255) tcgtcgAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTAc > 4:67501/1‑147 (MQ=255) tcgtcgAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTAc < 3:67501/147‑1 (MQ=255) gtcgAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACggg < 8:21138/148‑1 (MQ=255) gtcgAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACgg < 6:295516/147‑1 (MQ=255) gAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAgg < 5:148145/149‑1 (MQ=255) aaCAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGATGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTAc < 7:117473/141‑1 (MQ=255) aaCAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGt > 3:293400/1‑149 (MQ=255) aaCAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACAACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTAc > 8:117473/1‑141 (MQ=255) aaCAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGAGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGt > 1:216195/1‑149 (MQ=255) ttCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGt > 8:23032/1‑149 (MQ=255) ggtcggGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGt < 4:58764/149‑1 (MQ=255) aaCGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACTGGTa < 7:166778/131‑1 (MQ=255) aaCGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTa > 8:166778/1‑131 (MQ=255) ggAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCagcagc > 7:149863/1‑148 (MQ=255) cccACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTg < 1:208245/108‑1 (MQ=255) cccACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTg > 2:208245/1‑108 (MQ=255) ccACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGccc > 2:191776/1‑149 (MQ=255) aCGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGa > 4:176749/1‑130 (MQ=255) aCGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGa < 3:176749/130‑1 (MQ=255) aCGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTg > 5:77947/1‑149 (MQ=255) gtgtAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCtt < 7:23032/148‑1 (MQ=255) gtgtAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTc > 6:272246/1‑149 (MQ=255) tgtAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTc > 2:306828/1‑148 (MQ=255) tgtAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCCGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCg < 5:272246/149‑1 (MQ=255) tAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCcag > 2:37680/1‑125 (MQ=255) tAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCcag < 1:37680/125‑1 (MQ=255) ggCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAAc < 7:103169/148‑1 (MQ=255) ccTTGGTGATACCGAGGATGTAGGCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACatg < 6:50978/149‑1 (MQ=255) cTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACatga > 7:158605/1‑149 (MQ=255) gTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGt < 7:11684/148‑1 (MQ=255) aTACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCtt < 4:293400/149‑1 (MQ=255) aTACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCtt < 3:232794/149‑1 (MQ=255) aTACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCtt < 2:216195/149‑1 (MQ=255) cGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCg > 6:102596/1‑149 (MQ=255) gAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGaa < 4:170186/132‑1 (MQ=255) gAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGaa > 3:170186/1‑132 (MQ=255) gATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGgcgc < 6:77947/149‑1 (MQ=255) tGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGa < 1:191776/149‑1 (MQ=255) gTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGAc > 6:187425/1‑149 (MQ=255) aGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGc < 1:130573/138‑1 (MQ=255) aGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGc > 2:130573/1‑138 (MQ=255) gAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCtt < 6:321899/132‑1 (MQ=255) gAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCtt > 5:321899/1‑132 (MQ=255) gAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAgg < 8:158605/148‑1 (MQ=255) gTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTtg < 2:7618/148‑1 (MQ=255) aCATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAAc > 4:183226/1‑116 (MQ=255) aCATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAAc < 3:183226/116‑1 (MQ=255) cATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCa < 6:197953/149‑1 (MQ=255) cGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCCGGTTGTGCAGCTcggcg > 8:295738/1‑149 (MQ=255) aCGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGt < 8:149863/149‑1 (MQ=255) ccGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGTGAc > 6:23028/1‑149 (MQ=255) cGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGTGACg > 1:303472/1‑149 (MQ=255) ggAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGa > 8:130907/1‑121 (MQ=255) ggAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGa < 7:130907/121‑1 (MQ=255) gAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCAAGCAGCGAGCCCTGGGCGCATTCGAACATGATGTGCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGTGACGTc > 5:323559/1‑149 (MQ=255) aCCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGTGACGTCGa < 1:306828/149‑1 (MQ=255) cGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGTGACGTCGAGc < 5:187425/149‑1 (MQ=255) | CGAACTCGTGGCCACGCTTGGCCAAGGTAGCACCGGTCTCGTCGAACAGTTCGGTCGGGAACGGACCGGAACCCACGCGAGTGGTGTAGGCCTTGGTGATACCGAGGATGTAGTCGAGGTACATCGGGCCGACGCCGGAACCGGTGGAAATACCACCGGCAGTGGTGTTGGAGCTGGTGACGTACGGGTAGGTGCCGTGGTCGATGTCCAGCAGCGAGCCCTGGGCGCCTTCGAACATGATGTCCTTGCCGGCGCGACGCAGGTTGTGCAGCTCGGCGGTGACGTCGAGC > NC_002947/5558358‑5558647 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |