| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,667,258 | G→T | 6.6% | intergenic (+36/+35) | nhaP → / ← PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,667,258 | 0 | G | T | 6.6% | 213.4 / 3.3 | 69 | intergenic (+36/+35) | nhaP/PP_4975 | NhaP‑type Na+(K+)/H+ antiporter/acyl‑CoA thioesterase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (33/31); new base T (2/3); total (35/34) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTC > NC_002947/5667113‑5667400 | tggAACGGGACCTGCTGCTGTCGAGCCCCTACATCGTGGTGGTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCTCAAGGTCAGCGCCGAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAc < 3:167673/148‑1 (MQ=255)aGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAc > 1:166496/1‑149 (MQ=255) gAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCTGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGTCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAcca > 3:179725/1‑148 (MQ=255) ggACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTTCACCCGCGaa < 2:130008/149‑1 (MQ=255) ggACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGaa < 7:160218/149‑1 (MQ=255) ccTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAagag > 1:168158/1‑149 (MQ=255) ctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGca > 5:278696/1‑149 (MQ=255) ctgTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGca > 4:21595/1‑149 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAgg > 8:69092/1‑148 (MQ=255) gATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCAGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGACTTGAGAATGCAGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGAGAAGATGCCGGCACAgg > 5:256299/1‑148 (MQ=39) tCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCaa > 2:245619/1‑149 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGaa > 2:180642/1‑128 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGaa < 1:180642/128‑1 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAg > 5:38342/1‑149 (MQ=255) cTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAg > 8:121979/1‑149 (MQ=255) tggtgTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTAtt < 3:21595/149‑1 (MQ=255) tggtgTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTAtt < 1:295240/149‑1 (MQ=255) gtgtTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAcc < 4:291624/112‑1 (MQ=255) gtgtTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAcc > 3:291624/1‑112 (MQ=255) gtgtTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTc < 7:69092/148‑1 (MQ=255) gttgtCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCGCGCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGa < 1:245619/149‑1 (MQ=255) gtcgtcGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAagag > 5:302607/1‑116 (MQ=255) gtcgtcGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAagag < 6:302607/116‑1 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAcc < 7:172918/106‑1 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAcc > 8:172918/1‑106 (MQ=255) tcgtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGcc > 2:281632/1‑149 (MQ=255) gtcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAAGCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTGGACTGCGGa > 8:151626/1‑149 (MQ=255) tcgATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGa > 1:299783/1‑148 (MQ=255) ttCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCg > 8:214774/1‑149 (MQ=255) gttgTGCAGGTGTGGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCgg < 6:256299/145‑1 (MQ=255) tGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCggg > 2:135263/1‑148 (MQ=255) gCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAaga < 7:187521/100‑1 (MQ=255) gCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAaga > 8:187521/1‑100 (MQ=255) ggggTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTc > 8:96997/1‑149 (MQ=255) gttgttcATTGGGCGGGTGGGGGGGAAGGGCAGCGGCCATGCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTg < 2:94141/143‑1 (MQ=38) gTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTg > 7:51998/1‑149 (MQ=255) ttGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGTCCTCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGc < 4:263875/149‑1 (MQ=255) aGCTTTGGGCGGGTGGTTCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGTGGCTCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGTCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCaa < 4:179725/148‑2 (MQ=255) aGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCAc < 6:38342/148‑1 (MQ=255) tGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACtt > 2:204339/1‑149 (MQ=255) gggTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGAtct < 2:166496/149‑1 (MQ=255) gtggtgCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCg < 2:299783/149‑1 (MQ=255) cgcAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCCAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTgcgc > 5:275599/1‑149 (MQ=255) ggTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATg > 6:238983/1‑149 (MQ=255) ccAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAAc < 8:257090/74‑1 (MQ=255) ccAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAAc > 7:257090/1‑74 (MQ=255) gCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCaa < 8:51998/149‑1 (MQ=255) gagaATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCa < 7:96997/148‑1 (MQ=255) gCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGc > 4:211796/1‑149 (MQ=255) ccGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGc < 3:211796/148‑1 (MQ=255) aatgggCCGCAAAGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCg < 5:31962/82‑1 (MQ=37) aatgggCCGCAAAGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCg > 6:31962/4‑85 (MQ=37) cGGGGCCGGTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACGAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGccc < 7:151626/149‑1 (MQ=255) cGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGtt > 6:154767/1‑148 (MQ=255) cTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCg < 5:154906/105‑1 (MQ=255) cTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCg > 6:154906/1‑105 (MQ=255) cTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGAc < 7:121979/149‑1 (MQ=255) cTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGAc < 4:35093/149‑1 (MQ=255) gccG‑GCCTCTTCGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGcc > 2:309691/3‑120 (MQ=38) gccG‑GCCTCTTCGCGGGTTCACCCGCGAATGGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGcc < 1:309691/118‑1 (MQ=38) gCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCt < 5:187527/116‑1 (MQ=255) gCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCt > 6:187527/1‑116 (MQ=255) gCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGaa < 2:168158/148‑1 (MQ=255) g‑gCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAacac < 7:214774/149‑1 (MQ=255) gcctcttCGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGAc > 3:274963/6‑142 (MQ=255) gcctcttCGCGGGTTCACCCGCGAATAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGAc < 4:274963/137‑1 (MQ=255) aTTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCt > 1:254561/1‑149 (MQ=255) aTTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCt > 1:194410/1‑149 (MQ=255) gcgGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTc < 1:204339/149‑1 (MQ=255) | AGGAACGGGACCTGCTGCTGTCGATCACCTACATCGTGGTGTTGTCGTCGATTCTGGTGCAGGGGTTGAGCATTGGGCGGGTGGTGCGCAAGGTCAGCGCCCAGCCTTGAGAATGCCGGGGCCGCTTTGCG‑GCCCATTCGCGGGTGAACCCGCGAAGAGGCCGGCACAGGCAACCAGGGTCTATTCGACTGCCGAATCCGGGAACTGGTCCTGCACGTACTTGATCTCGGTGCGCCCATGGGCTGCCGGCAAGCCATCCTCGCCCAGGTTGACGAACACCATCTTGTC > NC_002947/5667113‑5667400 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |