| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,767,352 | T→G | 5.5% | M1174L (ATG→CTG) ‡ | PP_5060 ← | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,767,352 | 0 | T | G | 5.5% | 232.5 / 3.7 | 73 | M1174L (ATG→CTG) ‡ | PP_5060 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (36/33); new base G (2/2); total (38/35) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 | |||||||||||
AGGCAAGTCACAGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGCGATCCAGCTGGCTGGAGACATTGATGATC > NC_002947/5767212‑5767500 | aGGCAAGTCACAGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTgg > 5:199193/1‑148 (MQ=255)aGGCAAGTCACAGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCATGGGCCTggt > 2:260930/1‑148 (MQ=255)aGGCAAGTCACAGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCATGGGCCTggt < 1:260930/149‑2 (MQ=255) gCAAGTCACAGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGaa > 3:183294/1‑148 (MQ=255) gCAAGTCACAGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGaa > 5:78702/1‑148 (MQ=255) catacaaTCCGCAGATGATGGGCTGGGGCGGCCACCCGCATACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGAt < 4:46513/143‑1 (MQ=255) caGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGAt < 1:123141/149‑1 (MQ=255) caGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGAt < 1:156223/149‑1 (MQ=255) cATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGa > 7:69653/1‑149 (MQ=255) cagcagATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGaa > 1:137679/1‑132 (MQ=255) cagcagATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGaa < 2:137679/132‑1 (MQ=255) gcagATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTg > 6:196509/1‑149 (MQ=255) gcagATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTg < 6:211280/149‑1 (MQ=255) gatgCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCATGGGCCTgg > 1:10971/1‑122 (MQ=255) gatgCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCATGGGCCTgg < 2:10971/122‑1 (MQ=255) atgCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCgg < 8:134823/130‑1 (MQ=255) atgCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCgg > 7:134823/1‑130 (MQ=255) atgCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGtt > 6:27435/1‑135 (MQ=255) atgCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGtt < 5:27435/135‑1 (MQ=255) cGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TAc < 6:241082/149‑1 (MQ=255) gTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAAGGATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TAc > 1:232716/1‑149 (MQ=255) tgtgCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCt > 2:98714/1‑149 (MQ=255) gCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTcgc > 7:124710/1‑149 (MQ=255) ccACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGgtcg > 5:50093/1‑132 (MQ=255) ccACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGgtcg < 6:50093/132‑1 (MQ=255) ccACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGa < 2:222236/147‑1 (MQ=255) ccACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGa > 1:222236/1‑147 (MQ=255) ccACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGAt > 7:238783/1‑148 (MQ=255) cGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCt < 8:124710/149‑1 (MQ=255) cAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCg < 6:78702/149‑1 (MQ=255) aCGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCgaga < 8:69653/149‑1 (MQ=255) gCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACg > 2:179225/1‑149 (MQ=255) aCTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTg > 1:29647/1‑90 (MQ=255) aCTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGt < 5:196509/147‑1 (MQ=255) tGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCa > 3:123481/1‑147 (MQ=255) gcgcATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTa < 6:199193/149‑1 (MQ=255) aTGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGa < 4:183294/149‑1 (MQ=255) tGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTg > 8:59511/1‑148 (MQ=255) ggTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCCGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGAGAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTAGTGACGGAAGGCAGTTGCctgtcgatgt > 4:200095/1‑149 (MQ=255) ggTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACtt > 7:8874/1‑137 (MQ=255) ggTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACtt < 8:8874/137‑1 (MQ=255) ggCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGt > 3:120315/1‑149 (MQ=255) gCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGt > 5:62209/1‑148 (MQ=255) gTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCat > 8:100390/1‑134 (MQ=255) gTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCat < 7:100390/134‑1 (MQ=255) gTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGAt > 3:302244/1‑149 (MQ=255) gCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCt < 1:311668/93‑1 (MQ=255) gCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCt > 2:311668/1‑93 (MQ=255) gCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAgg > 4:158852/1‑123 (MQ=255) gCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAgg < 3:158852/123‑1 (MQ=255) ccTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTTATGGc < 6:62209/149‑1 (MQ=255) cTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCatgtcgat < 1:73881/136‑1 (MQ=255) cTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCatgtcgat > 2:73881/1‑136 (MQ=255) cTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATggg > 8:229589/1‑147 (MQ=255) ccACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGc < 4:120315/149‑1 (MQ=255) aCTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACtt < 1:118976/117‑1 (MQ=255) aCTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACtt > 2:118976/1‑117 (MQ=255) aCTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGCGa < 2:232716/149‑1 (MQ=255) tGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGcaga > 5:163618/1‑145 (MQ=255) ggCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCTTCTTGGGCTCGCGATATTGTTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGCGATCCAg < 1:98714/149‑1 (MQ=255) 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cTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGCGATCCAgctggctg > 8:13368/1‑148 (MQ=255) gACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACg < 5:297024/73‑1 (MQ=255) gACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACg > 6:297024/1‑73 (MQ=255) aGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATg < 4:519/117‑1 (MQ=255) gCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGCGATCCAGCTGGCTGGAGACATtga > 7:288603/1‑149 (MQ=255) cccATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCgg < 8:165890/109‑1 (MQ=255) cccATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCgg > 7:165890/1‑109 (MQ=255) tGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGCGATCCAGCTGGCTGGAGACATTGATGATc < 7:59511/149‑1 (MQ=255) | AGGCAAGTCACAGAACATCAGCAGATGATGCGTTTGTGCGGCCACCCGCAGACGCTGACTGGCGAGCGCATGGCGGAA‑GATCATGTAGTGCTGGGTAGGCGTGCCTTTGTGCCACTGCAGGGCCAGCTCGACCAGGCCCATGGCCTGGAAAAACCGGATGTTGATCGTGGTCGTCT‑‑TACGGCTCGCGATAATGCTCGAGACGGTCAGAGTGGTATTGACGTAAGGCACTTGCATGTCGATGTCGGTGATGGCCAACAGGCGATCCAGCTGGCTGGAGACATTGATGATC > NC_002947/5767212‑5767500 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |