| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 5,790,152 | C→T | 8.5% | intergenic (+31/+37) | ynfM → / ← PP_5073 | efflux transporter/hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 5,790,152 | 0 | C | T | 8.5% | 200.8 / 5.5 | 70 | intergenic (+31/+37) | ynfM/PP_5073 | efflux transporter/hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/33); new base T (3/3); total (34/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
GGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCGGCGGCAG > NC_002947/5790007‑5790299 | ggTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCtgt < 3:190521/149‑1 (MQ=255) tgtTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTgg < 1:116193/149‑1 (MQ=255) tGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTgg > 5:288771/1‑144 (MQ=255) tGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTgg < 6:288771/144‑1 (MQ=255) tGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCg < 4:154572/149‑1 (MQ=255) gCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCgg < 8:277169/148‑1 (MQ=255) aCCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGgtg > 8:188665/1‑149 (MQ=255) ccAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGgtgt < 7:147606/149‑1 (MQ=255) cAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGgtgt > 6:41221/1‑148 (MQ=255) gggCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCAc > 5:201885/1‑149 (MQ=255) gggCTGGAAAGGGATCGGGCTGTTCATTGGCACCTTGCTGGCGGTGGCCGTGATGGTGGCGGTGCACCTGACCAACTTGCCAACCAAAACGGGGTGATGCAATCGGGGGCAC‑GCCTCGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCa < 1:201828/149‑1 (MQ=255) ggCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCa > 2:201828/1‑147 (MQ=255) gAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAagag < 7:188665/149‑1 (MQ=255) gATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTgg > 8:251296/1‑121 (MQ=255) gATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTgg < 7:251296/121‑1 (MQ=255) gATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatc < 1:248385/149‑1 (MQ=255) cGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCatcaga < 4:72981/149‑1 (MQ=255) gCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGGGTGACCACGAAGAGGCCatcagatca < 5:41221/149‑1 (MQ=255) tGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCCGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGTTGTGATGCTTTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGTAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGt < 4:138302/149‑1 (MQ=255) ttCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt > 7:236145/1‑148 (MQ=255) ttCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGt < 3:228539/147‑1 (MQ=255) ttGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtgatga > 2:35021/1‑149 (MQ=255) gCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGAtc < 8:236145/148‑1 (MQ=255) cTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGa > 6:115532/1‑148 (MQ=255) gCTGGGGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCTCCTGAGCAAGTTGCGAAGCAATATGTTGTGATGCATTCGTTGGCTC‑GCC‑CGCACCCAGATCCTGTGGTAGCGTTTGTGACCACGAAGAGGCCTTCTGATCAGTTGTTTATCTCGa < 8:291144/145‑1 (MQ=255) gCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatcc < 6:201885/149‑1 (MQ=255) cTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGtt < 1:46558/122‑1 (MQ=255) cTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGACATCAGATCAGtt > 2:46558/1‑122 (MQ=255) ttGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACt > 7:28531/1‑149 (MQ=255) ggCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGAc < 2:50468/125‑1 (MQ=255) ggCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGAc > 1:50468/1‑125 (MQ=255) ggCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATACACTTCCCGGCt > 5:167026/1‑149 (MQ=255) gCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCtc < 3:311110/149‑1 (MQ=255) gTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatccaca < 1:128912/132‑1 (MQ=255) gTTGCACCAGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATatccaca > 2:128912/1‑132 (MQ=255) aCCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtgat < 4:42462/108‑1 (MQ=255) aCCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtgat > 3:42462/1‑108 (MQ=255) cAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCtttt > 7:293891/1‑148 (MQ=255) gTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCACTGCC‑CGCCCCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAGGAGGCCATCAGATCAGTTGATGAGCTCGCCAATATCCACATCCACTACCCGGGtc > 1:215594/1‑133 (MQ=255) gTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCtc < 2:215594/132‑1 (MQ=255) gTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAAc > 5:207195/1‑149 (MQ=255) aagtccACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTTTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATTATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAAc < 6:74503/145‑1 (MQ=255) aCCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑ACC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCAcc < 6:156520/149‑1 (MQ=255) cccAAAACGGTGTGATGCATTCGTTGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCg < 3:166775/149‑1 (MQ=255) cccAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGTGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCg > 6:12855/1‑149 (MQ=255) aaaaCGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTc > 3:305598/1‑149 (MQ=255) aCGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGc < 5:115532/149‑1 (MQ=255) tgATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATTTCCTCATCCACTTCGCGGCTGATCAGGTGCTTTTCTACCTCACCGGTGAGCTTGAcc > 5:175747/1‑149 (MQ=255) tGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTg > 7:164137/1‑149 (MQ=255) tGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTg < 8:293891/149‑1 (MQ=255) gCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTgg > 6:279283/1‑149 (MQ=255) gCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTgg > 4:69328/1‑149 (MQ=255) cttCGTGGTCAC‑ACC‑CGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTc > 1:115191/2‑149 (MQ=37) aTTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCa > 6:133069/1‑122 (MQ=255) aTTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCa < 5:133069/122‑1 (MQ=255) gTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGt > 4:101271/1‑149 (MQ=255) tGGTCAC‑ACC‑CGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTc > 8:96544/1‑149 (MQ=37) cacc‑cGCTCCCACAGGTTGTGGGTGCGGGCGTGCCCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGaa < 7:96544/147‑1 (MQ=38) gCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGa > 6:253746/1‑147 (MQ=255) gCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAAc < 6:207195/149‑1 (MQ=255) cc‑cGCTCCCACAGGTTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGt < 2:239914/143‑1 (MQ=255) cc‑cGCTCCCACAGGTTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGt > 1:239914/1‑143 (MQ=255) cACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGgtgt < 8:164137/149‑1 (MQ=255) aCCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTc > 3:306009/1‑149 (MQ=255) ccACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTcgg > 5:103843/1‑149 (MQ=255) acaACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGtt < 7:229112/135‑1 (MQ=255) acaACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGtt > 8:229112/1‑135 (MQ=255) acaACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTcggcg > 6:139905/1‑149 (MQ=255) aaCCTGTGGGAGCGTGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCggcggc < 3:223373/149‑1 (MQ=255) aaCCTGTGGGAGCGTGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCggcggc < 1:35021/149‑1 (MQ=255) ccTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCGGCGGCAg < 5:253746/149‑1 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtg > 3:33328/1‑44 (MQ=255) cTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTtg < 4:33328/44‑1 (MQ=255) | GGTGTTCTGGCACCAGTGGGGCTGGAACGGGATCGGGCTGTTCATTGGCAGCTTGCTGGCGGTGGCCTTGATGGTGGCGTTGCACCTGAGCAAGTTGCCACCCAAAACGGTGTGATGCATTCGTGGGCAC‑GCC‑CGCACCCACAACCTGTGGGAGCGGGTGTGACCACGAAGAGGCCATCAGATCAGTTGATGATCTCGACAATATCCACATCCACTTCCCGGCTCATCAGGTGCTTTTCAACCTCACCGGTCAGCTTCACCTTGGTCTTGTCGTTGAACGGTGTCGGCGGCAG > NC_002947/5790007‑5790299 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |