Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,864,711 | C→T | 5.9% | L480L (CTG→CTA) | cadA‑III ← | cadmium translocating P‑type ATPase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,864,711 | 0 | C | T | 5.9% | 206.3 / 2.2 | 67 | L480L (CTG→CTA) | cadA‑III | cadmium translocating P‑type ATPase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/31); new base T (2/2); total (34/33) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.27e-01 |
CCAAGTGGTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTA > NC_002947/5864566‑5864851 | ccAAGTGGTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACTCCACTCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTTCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACAGCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAgg < 8:108794/149‑1 (MQ=255) ccAAGTGGTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCTCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCGAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAgg < 6:236654/149‑1 (MQ=255) cAAGTGGTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACACGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGc < 1:224865/149‑1 (MQ=255) tAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGgccgc > 6:179431/1‑149 (MQ=255) gACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCa < 8:98454/137‑1 (MQ=255) gACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCa > 7:98454/1‑137 (MQ=255) ccTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAg < 5:278973/149‑1 (MQ=255) cTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAgg < 7:43753/149‑1 (MQ=255) ccGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTg < 2:162099/149‑1 (MQ=255) cGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTgc > 4:219501/1‑149 (MQ=255) acgccacgcacgccacgcCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGgcc < 4:174225/129‑1 (MQ=255) acgccacgcacgccacgcCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGgcc > 3:174225/1‑129 (MQ=255) cacgcacgccacgcCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTc > 4:113248/1‑148 (MQ=255) gcacgccacgcCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGaa > 5:287614/1‑148 (MQ=255) cgccacgccCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAgc < 3:113248/149‑1 (MQ=255) ccacgccCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCTAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAgcgg > 3:180607/1‑149 (MQ=255) ccacgccCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCTAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAgcgg > 5:36243/1‑149 (MQ=255) ggCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCTAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCa < 6:36243/149‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCTAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCa < 4:180607/149‑1 (MQ=255) cAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCtt > 4:88223/1‑116 (MQ=255) cAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCtt < 3:88223/116‑1 (MQ=255) aGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAg > 7:138167/1‑134 (MQ=255) aGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAg < 8:138167/134‑1 (MQ=255) aGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCa > 6:188373/1‑142 (MQ=255) aGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCa < 5:188373/142‑1 (MQ=255) gcAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGc < 1:13519/149‑1 (MQ=255) aGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTc < 8:116861/149‑1 (MQ=255) tCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTg > 6:88385/1‑149 (MQ=255) aCTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCa > 6:94598/1‑149 (MQ=255) aCTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCa > 8:200438/1‑149 (MQ=255) aCTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCATGCTGCTTGCCGAACTCGCCAATGGCGAGGGACAACGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACGTGTGCGTCGGTCTGCa > 8:274745/1‑149 (MQ=255) aCCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCgg > 6:18864/1‑149 (MQ=255) aCCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCgg < 5:94598/149‑1 (MQ=255) cTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCt > 3:63134/1‑149 (MQ=255) tCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCtt > 8:36637/1‑149 (MQ=255) tCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCtt > 1:59065/1‑149 (MQ=255) gCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCtt < 8:13797/147‑1 (MQ=255) gCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCtt < 8:108254/147‑1 (MQ=255) cTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGcc < 7:36637/149‑1 (MQ=255) aggccaggccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATgg < 4:63134/149‑1 (MQ=255) aggccaggccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATgg < 3:219501/149‑1 (MQ=255) aggccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGAt > 7:27054/1‑149 (MQ=255) gccTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCAAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATgg > 1:255494/1‑149 (MQ=255) tgctgcTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGcc > 1:263255/1‑149 (MQ=255) ctTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTc < 2:59065/148‑1 (MQ=255) ctTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTc < 2:263255/148‑1 (MQ=255) cGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTc > 3:89487/1‑148 (MQ=255) gAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTc > 6:234034/1‑147 (MQ=255) gAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTc > 4:54221/1‑147 (MQ=255) aCTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAgg < 2:157740/149‑1 (MQ=255) tCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGc > 8:57882/1‑149 (MQ=255) tCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGc < 2:255494/149‑1 (MQ=255) gCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAg > 8:75003/1‑149 (MQ=255) aaTGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGa < 5:179431/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGaa < 7:57882/149‑1 (MQ=255) aTGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGaa < 7:75003/149‑1 (MQ=255) gcgGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATc > 2:120873/1‑147 (MQ=255) gcgGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATc > 1:194363/1‑147 (MQ=255) ggACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGt < 2:194363/149‑1 (MQ=255) ccGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTggcgg > 2:17556/1‑149 (MQ=255) gtCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTg < 1:236651/115‑1 (MQ=255) gtCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTg > 2:236651/1‑115 (MQ=255) gtCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTggcg < 8:124135/141‑1 (MQ=255) gtCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTggcg > 7:124135/1‑141 (MQ=255) ccGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGcc > 5:209335/1‑142 (MQ=255) ccGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGcc < 6:209335/142‑1 (MQ=255) gCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTa > 8:240703/1‑148 (MQ=255) | CCAAGTGGTAGACCTCACCGGCAATGACGCCACGCACGCCACGCCCGGCCAGCGCAACGAAGTCACTGACCTCGCTCAAGGCCAGGCCTTGCTGCTTGCCGAACTCGGCAATGGCGCGGGACACCGGGTGGTCCGAACGCTCGCCCAGGCTGGCCGCCAAGGCTTGCGCACGGTCTTCGAACAGCGGCGCCAGCACCTTGGCGTCGGTCTGCACCGGCTTGCCATGGGTGATGGTGCCGGTCTTGTCCAGGGCCAGGAAATCAAGGTGGCGGCCACCCTCCAGGTA > NC_002947/5864566‑5864851 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |