Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 5,981,889 | A→C | 6.4% | Q845P (CAG→CCG) | PP_5242 → | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 5,981,889 | 0 | A | C | 6.4% | 200.2 / 4.6 | 63 | Q845P (CAG→CCG) | PP_5242 | GAF domain‑containing sensor histidine kinase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (27/32); new base C (2/2); total (29/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.06e-01 |
CGCTCGGTGTTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGTCATCATCCTTCTTCGTGAAGGA > NC_002947/5981744‑5982036 | cgctcgGTGTTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGt > 8:58287/1‑149 (MQ=255) gctcgGTGTTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTc < 8:49249/149‑1 (MQ=255) gctcgGTGTTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTc > 8:209552/1‑149 (MQ=255) ggtggtGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACCTGCTGCCAGTCGAgg < 6:327133/149‑1 (MQ=255) ggTGTTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAgg > 1:121107/1‑149 (MQ=255) gtgtTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGc > 4:218653/1‑149 (MQ=255) gtgtTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACCTGCTGCCAGTCGAGGc < 2:184209/149‑1 (MQ=255) gtgtTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGCTAGCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTCGCAGCAGGTCGAGGc < 8:119891/149‑1 (MQ=255) gtgtTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGAACAACTTGCGCGGTGACTATCAGACGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGCGCCTCGACTGGCACCAGGTCGAGGc > 3:152180/1‑149 (MQ=255) gtTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGc > 5:146339/1‑147 (MQ=255) gACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTTTCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAg > 6:65310/1‑141 (MQ=255) gACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTTTCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAg < 5:65310/141‑1 (MQ=255) gACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCGTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCa > 1:61611/1‑149 (MQ=255) ccAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGATGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGACGGGCATCGACAGCGCGCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATg < 4:152180/149‑1 (MQ=255) cAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGc < 1:137144/149‑1 (MQ=255) ggCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGcc > 3:147974/1‑148 (MQ=255) cGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑g < 4:131074/149‑1 (MQ=255) cTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGAt < 3:218653/149‑1 (MQ=255) agCAGGCCATGCTGTACACCATGCGCCTAGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGTCCGGCCTCGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGCCCTCGACTGCCACCAGGTCTAGGCCAGTCATGCA‑CATGTTCA‑GGCGTTGCTc > 8:154997/2‑149 (MQ=255) cAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATc < 6:146339/147‑1 (MQ=255) aGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGaa < 4:188217/149‑1 (MQ=255) ggCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAAc < 2:264078/149‑1 (MQ=255) gcgcTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACa < 4:147974/149‑1 (MQ=255) tgTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGAc > 5:58909/1‑149 (MQ=255) gTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGAcc > 8:255868/1‑149 (MQ=255) tACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCg > 5:18976/1‑149 (MQ=255) tACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCg < 6:58909/149‑1 (MQ=255) cacCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCgg < 7:209552/148‑1 (MQ=255) acCTTGCGCGGTGACTTTCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGc < 1:307795/125‑1 (MQ=255) acCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGc > 2:307795/1‑125 (MQ=255) cTTGCGCGGTGACTATCAGGCTGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCAtt < 7:154997/149‑1 (MQ=255) cTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCAtt > 4:93006/1‑149 (MQ=255) gcgGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTg > 8:10529/1‑149 (MQ=255) gcgGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTg < 7:197/149‑1 (MQ=255) gcgGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTg > 8:195573/1‑149 (MQ=255) ggTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGa < 7:255868/149‑1 (MQ=255) ggTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGa < 6:18976/149‑1 (MQ=255) ggTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGa < 8:278237/149‑1 (MQ=255) ccATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGa > 1:47584/1‑133 (MQ=255) ccATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGa < 2:47584/133‑1 (MQ=255) tCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGTGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGa > 6:83596/1‑148 (MQ=255) tCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGAc < 7:195573/149‑1 (MQ=255) aCAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCg > 2:66684/1‑149 (MQ=255) aGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCgga < 2:121107/149‑1 (MQ=255) aGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCgga < 4:207956/149‑1 (MQ=255) gcgcCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCggag < 5:43494/149‑1 (MQ=255) cggccTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACgg > 7:8066/1‑149 (MQ=255) gccTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGtt < 2:61611/149‑1 (MQ=255) cTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGc > 1:119112/1‑149 (MQ=255) cTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGc < 2:119112/149‑1 (MQ=255) aCTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGTGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATc < 5:83596/149‑1 (MQ=255) aCTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGa > 6:260980/1‑74 (MQ=255) aCTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGa < 5:260980/74‑1 (MQ=255) tGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCAGGGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCct > 1:253297/1‑149 (MQ=255) ggTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCCGCATGTGAA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGACACTGCCGCGCCCCGAAACGGAGGAAGTGACGTTTGCCATCACCctgc > 1:82700/1‑149 (MQ=255) cccGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCAc < 5:162041/147‑1 (MQ=255) cccGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCAc > 6:162041/1‑147 (MQ=255) gTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGtc < 3:93006/149‑1 (MQ=255) gTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGt > 1:247381/1‑148 (MQ=255) ggggCCTCGACTGGGAGGAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGATGGTCAGGCATTGCCTGGATTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGtcatca < 2:111032/149‑1 (MQ=255) ccTCGACCTGCTGCCAGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGTCATCATCct > 7:100915/1‑149 (MQ=255) ccTCGACCTGCTGCCAGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGTCATCATCct > 8:43287/1‑149 (MQ=255) aCTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGTCATCATCCttcttc < 4:306872/149‑1 (MQ=255) gcagcaGGTCGAGCCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCAATGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGACGAAGTGAAGGTTGCCATCAGCCTGCTGGACACTCTCTCATCATCCTTCATCGTg > 8:265966/1‑148 (MQ=255) cagGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGTCATCATCCTTCTTCGTGAAGga < 1:66684/149‑1 (MQ=255) agGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGc < 5:175496/118‑1 (MQ=255) agGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGc > 6:175496/1‑118 (MQ=255) | CGCTCGGTGTTGGACCAGGCACGGGCGTGCCGGCTGCAGGCGCTGCTGTACACCTTGCGCGGTGACTATCAGGCGGCCATCGACAGCGCCCTGGCCGGCCTGGACTTACTGGGTATCAGCCCGGTGCGGGGCCTCGACTGGCAGCAGGTCGAGGCCAGTCATGCC‑CATGTGCA‑GGCGTTGATCGAACAGAAGGACCGGCATTGCCTGGAGTCACTGCCGCGCACCGACTCGGAGGAAGTGACGGTTGCCATCAGCCTGCTGGCCACTCTGTCATCATCCTTCTTCGTGAAGGA > NC_002947/5981744‑5982036 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |