| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,073,536 | G→T | 5.2% | H240Q (CAC→CAA) | PP_5327 ← | phosphate ABC transporter permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,073,536 | 0 | G | T | 5.2% | 254.1 / 3.3 | 77 | H240Q (CAC→CAA) | PP_5327 | phosphate ABC transporter permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (35/38); new base T (2/2); total (37/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 5.02e-01 | |||||||||||
ACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTGCAGGCGCAGGCGCTCAAGGCCAT > NC_002947/6073388‑6073681 | aCTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTgg < 4:273761/149‑1 (MQ=255) cTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGt > 8:92387/1‑149 (MQ=255) aGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAgg > 1:131944/1‑149 (MQ=255) aGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGACTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAgg > 8:284490/1‑149 (MQ=255) ccTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCg < 3:205665/149‑1 (MQ=255) ttGCCGAAGAAGGTGCCCAACATGGTGAACGCCGACATGACGATTGGCTGAACGGCATCCACTACCTTGCACAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGATGCCATACCGGGACACAAGGCTGACGCGGGAAAAAGCCTGGTGAAGGCAgg > 4:70205/1‑148 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAgg < 1:286943/149‑1 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAgg > 5:99595/1‑149 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAgg > 2:28670/1‑149 (MQ=255) cGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAgg > 2:255598/1‑149 (MQ=255) aaGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCg < 4:64711/149‑1 (MQ=255) gTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGt < 4:1646/149‑1 (MQ=255) tAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTc < 6:108302/149‑1 (MQ=255) aGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCt > 6:82622/1‑149 (MQ=255) ggTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCtt < 7:83325/149‑1 (MQ=255) ggTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCtt < 5:82622/149‑1 (MQ=255) ccAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCCGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 8:44007/1‑147 (MQ=255) ccAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGGTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 6:40574/1‑147 (MQ=255) aaCTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGc > 5:200427/1‑149 (MQ=255) cTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCTCGGCCTTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCt > 1:223393/1‑149 (MQ=255) ggTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGATAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTGAGGGTGTCTTCGATAGCCtt < 2:25605/147‑1 (MQ=255) ggTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa < 3:29669/140‑1 (MQ=255) ggTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGa > 4:29669/1‑140 (MQ=255) ggTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCtt < 2:131944/147‑1 (MQ=255) ggTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTg < 6:200427/148‑1 (MQ=255) gAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGTTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGc > 7:221394/1‑149 (MQ=255) gAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGTTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGc > 7:225674/1‑149 (MQ=255) aaCGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGGCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGc < 3:70205/148‑1 (MQ=255) gCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCt > 8:167339/1‑149 (MQ=255) gACCTGCCGTTTGGCTGAACGGCATACACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGtt < 8:295028/149‑1 (MQ=255) cATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCa < 7:167339/149‑1 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGtt > 2:83625/1‑149 (MQ=255) gCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGtt > 4:211119/1‑149 (MQ=255) gTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCgg < 6:99595/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCgg < 3:211119/149‑1 (MQ=255) gTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCgg > 6:12568/1‑149 (MQ=255) tttGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGc < 5:44451/149‑1 (MQ=255) gCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACgg > 7:170499/1‑149 (MQ=255) aaCGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCg < 7:284490/148‑1 (MQ=255) aCGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGc < 5:318196/149‑1 (MQ=255) cATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCa < 6:203728/137‑1 (MQ=255) cATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCCGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTcc < 7:44007/149‑1 (MQ=255) tGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCAt < 7:92387/149‑1 (MQ=255) aCTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCGCGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCg < 2:209008/138‑1 (MQ=255) aCTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCGCGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCg > 1:209008/1‑138 (MQ=255) ccTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGcc > 1:235937/1‑149 (MQ=255) cTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGTTCAGGCgg < 4:39107/91‑1 (MQ=255) cTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCt < 1:255598/149‑1 (MQ=255) cTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGATCAGGCgg > 3:39107/1‑91 (MQ=255) gCTCAGGTTGATTTCCACTTCTCGGCCTTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTgg < 2:223393/148‑1 (MQ=255) gCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCAGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTggg > 1:4978/1‑149 (MQ=255) gCTCAGGTTGAATTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTg < 6:273550/147‑1 (MQ=255) aGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGTTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGggcggc < 8:225674/149‑1 (MQ=255) aGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGTTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGggcggc < 8:221394/149‑1 (MQ=255) aGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGggcggc < 8:170499/149‑1 (MQ=255) ggTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGggcggcg < 2:235937/149‑1 (MQ=255) tacACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAg > 4:228250/3‑149 (MQ=255) tCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGGTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAg > 2:307095/1‑149 (MQ=255) cTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTg > 4:93287/1‑149 (MQ=255) aCGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGcc > 2:295729/1‑147 (MQ=255) aCGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGcc < 1:295729/147‑1 (MQ=255) aCGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGt > 6:25941/1‑149 (MQ=255) aCGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGt > 6:131579/1‑149 (MQ=255) cGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGGGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGtc > 5:75604/1‑149 (MQ=255) cGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGtc < 2:4978/149‑1 (MQ=255) ccGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAATGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGtccag < 6:4631/149‑1 (MQ=255) gTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGtccagct > 7:136423/1‑149 (MQ=255) tCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGggcggcg > 6:205096/1‑120 (MQ=255) tCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGggcggcg < 5:205096/120‑1 (MQ=255) tCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGtccagctcc < 1:114130/144‑1 (MQ=255) tCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGtccagctcc > 2:114130/1‑144 (MQ=255) ccaccaGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCt > 6:91842/1‑149 (MQ=255) caccaGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCtt < 8:136423/149‑1 (MQ=255) accaGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCTATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTg < 3:93287/149‑1 (MQ=255) accaGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTg < 1:83625/149‑1 (MQ=255) aaaaGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTGCAGGCGCAGGCGCTc > 2:304336/1‑147 (MQ=255) gCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTGCAGGCGCAGGCGCTCAAGGc > 1:295293/1‑148 (MQ=255) cTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTGCAGGCGCAGGCGCTCAAGGCCAt < 5:91842/149‑1 (MQ=255) ggTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTgcaggcgcag > 6:307051/1‑133 (MQ=255) ggTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTgcaggcgcag < 5:307051/133‑1 (MQ=255) | ACTCCCAGACCTTGCCGAAGTAGGTGCCCAACTTGGTGAACGCCGACATGCCGTTTGGCTGAACGGCATGCACTACCTTGCTCAGGTTGATTTCCACTTCACGGCCGTTGCCATCCCGGGCCACCAGGCTGTCGCGGGAAAAAGCCTGGTGCAGGCCGGTCAGGCGGTCTTCGATAGCCTTGTAGCGGCTGTTCAGTTCGGCACGGTCGGCGTCCATGTCGGCCTGGGCGGCGGCGTCCAGCTTGCCGTCCAGCTCCAGCTTGCGCGCTTGCAGGCGCAGGCGCTCAAGGCCAT > NC_002947/6073388‑6073681 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |