| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 6,171,859 | T→C | 5.4% | K148R (AAG→AGG) | glmS ← | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 6,171,859 | 0 | T | C | 5.4% | 225.1 / 2.2 | 74 | K148R (AAG→AGG) | glmS | L‑glutamine/D‑fructose‑6‑phosphate aminotransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (32/38); new base C (2/2); total (34/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.39e-01 | |||||||||||
CGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGATGATGCCGTTGTG > NC_002947/6171711‑6172007 | cgcCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCt < 4:177219/149‑1 (MQ=255) aGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAg < 7:226814/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAgg < 6:37988/149‑1 (MQ=255) gCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAgg < 7:125253/149‑1 (MQ=255) ggACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCg < 1:299448/148‑1 (MQ=255) cAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGt > 3:253903/1‑149 (MQ=255) gAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTg < 4:57651/149‑1 (MQ=255) gAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTg < 1:87325/149‑1 (MQ=255) tctcGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATg > 5:137894/1‑149 (MQ=255) ctcGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGc > 4:251613/1‑149 (MQ=255) gCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGctc < 1:160560/148‑1 (MQ=255) ggCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAgg < 5:88906/149‑1 (MQ=255) ggCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAgg < 4:207928/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAg < 5:289791/145‑1 (MQ=255) ccAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAg > 6:289791/1‑145 (MQ=255) ccAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGgtg > 7:27294/1‑149 (MQ=255) cAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCCCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGACTGGAATGCTCTTCAGGgtgt > 7:222962/1‑149 (MQ=255) aGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGtgtg > 5:173064/1‑149 (MQ=255) ccGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTgtggtg < 8:27294/149‑1 (MQ=255) gATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGt < 2:238062/113‑1 (MQ=255) gATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGt > 1:238062/1‑113 (MQ=255) tAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGAt > 5:274613/1‑148 (MQ=255) aGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGACGCCCTTAAGGCGGCGGtgaa > 5:207968/1‑110 (MQ=255) aGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGACGCCCTTAAGGCGGCGGtgaa < 6:207968/113‑4 (MQ=255) gCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTgg < 6:137894/149‑1 (MQ=255) gCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTg > 3:267581/1‑148 (MQ=255) gggCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGAc > 4:47144/1‑149 (MQ=255) gCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGa > 1:183482/1‑149 (MQ=255) cTACCAGTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGAACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGATTCACCGCCGCCTTAAGTGCGTCGGTCAGGTCTGGAATTCTGTTCAGTGTGTGGTGGATCAGGTGGACGAt < 8:90941/149‑1 (MQ=255) cTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGAt < 4:253903/149‑1 (MQ=255) cTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGAt < 6:274613/149‑1 (MQ=255) cTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGAt > 4:127569/1‑149 (MQ=255) cACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACt > 6:4367/1‑149 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGTATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAg < 1:9243/134‑1 (MQ=255) cTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAg > 2:9243/1‑134 (MQ=255) cGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGTCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCg < 6:173064/147‑1 (MQ=255) gTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCg < 4:136588/146‑1 (MQ=255) gTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCg > 3:136588/1‑146 (MQ=255) ctgcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCg < 5:187995/149‑1 (MQ=255) tgcCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCgg > 7:159009/1‑149 (MQ=255) accaGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTg > 5:100050/1‑149 (MQ=255) ggCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGa > 5:176464/1‑148 (MQ=255) ggCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGAc < 3:127569/149‑1 (MQ=255) tgctTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCt < 7:69775/133‑1 (MQ=255) tgctTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCt > 8:69775/1‑133 (MQ=255) ctTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGc > 5:140863/1‑149 (MQ=255) gCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCa < 6:176464/148‑1 (MQ=255) cACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACt < 2:298657/113‑1 (MQ=255) cACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACt > 1:298657/1‑113 (MQ=255) cACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAgg < 2:183482/149‑1 (MQ=255) cACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAgg < 8:159009/149‑1 (MQ=255) aCTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGc > 5:53640/1‑149 (MQ=255) aTCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCt > 7:128746/1‑148 (MQ=255) tCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTc < 3:251613/149‑1 (MQ=255) cAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTc < 8:222962/148‑1 (MQ=255) aGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAg < 6:53640/149‑1 (MQ=255) gcgcCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGc > 5:237497/1‑149 (MQ=255) gcgcCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGc > 3:302281/1‑149 (MQ=255) ggCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTcg < 6:237497/149‑1 (MQ=255) gCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTcgc > 1:16774/1‑149 (MQ=255) ccGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTcgcg < 2:16774/149‑1 (MQ=255) cGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTGAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGCCGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGATGTGAAGACATAGCCGAGGCCCGGCAGCTCTTCgggc > 4:225815/1‑149 (MQ=255) tgaaGCGCC‑TGCACGGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTcgcg > 7:34252/3‑147 (MQ=255) gTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGt < 6:213480/114‑1 (MQ=255) gTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGt > 5:213480/1‑114 (MQ=255) tAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAg < 4:267581/149‑1 (MQ=255) cGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCa < 1:234433/149‑1 (MQ=255) gcgcTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATg > 6:182982/1‑144 (MQ=255) gcgcTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATg < 5:182982/144‑1 (MQ=255) cgcTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCTGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTtctc < 5:221339/149‑1 (MQ=255) ttCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCgat > 5:124159/1‑149 (MQ=255) cACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCgatg < 6:140863/148‑1 (MQ=255) cACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCgatg < 3:47144/148‑1 (MQ=255) aCCGACGCCCTTAAGGCGGCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTAt > 7:283228/1‑79 (MQ=38) aCCGACGCCCTTAAGGCGGCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTAt < 8:283228/79‑1 (MQ=38) ttAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGATGATGCCGTtgtg > 3:224384/1‑149 (MQ=255) | CGCCAGCTGGTCGGACGCCAGGAAGTTCTCGCCAAGGCCCAGGCCGATAACCAGCGGGCTACCACTGCGTGCTGCCACCAGGCGGTCCGGCTGCTTGGCACTGATCAGCGCCAGGCCGTAAGCGCCGTGCA‑GGCGCTTCACCGCCGCCTTAAGGGCGTCGGTCAGGTCTGGAATGCTCTTCAGGGTGTGGTGGATCAGGTGGACGATGACTTCGGTATCGGTCTGCGAAGTGAAGACATAGCCCAGGCCCTTCAGCTCTTCGCGCAGCTCCTCATGGTTCTCGATGATGCCGTTGTG > NC_002947/6171711‑6172007 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |