Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 693,590 | C→G | 8.2% | G151A (GGC→GCC) | PP_0595 ← | LysR family transcriptional regulator |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 693,590 | 0 | C | G | 8.2% | 208.0 / 9.7 | 73 | G151A (GGC→GCC) | PP_0595 | LysR family transcriptional regulator |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/36); new base G (3/3); total (34/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.16e-01 |
TCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGC > NC_002947/693443‑693727 | tcTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGcc < 5:117592/149‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGATAAACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTc < 1:245602/148‑1 (MQ=255) ctgGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGc < 6:64000/145‑1 (MQ=255) agggccgtcgGCTTACAACCGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGGTCGCTGTACAAGGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGTTCTGAGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCt < 3:243276/141‑1 (MQ=255) ggTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGAcg < 5:183938/149‑2 (MQ=255) ggTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGAcc > 5:185489/1‑149 (MQ=255) gCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTggg > 3:12810/1‑149 (MQ=255) tAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGc > 6:223239/1‑149 (MQ=255) gAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCg < 3:186695/148‑1 (MQ=255) gAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCg > 4:9371/1‑148 (MQ=255) gAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCg < 3:286342/148‑1 (MQ=255) gAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGa < 6:185489/149‑1 (MQ=255) aaCAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGc < 1:269328/129‑1 (MQ=255) aaCAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGc > 2:269328/1‑129 (MQ=255) cAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCa > 3:228791/1‑149 (MQ=255) cAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCGCGACCTGGCTGGGGGCGATCa > 8:103916/1‑149 (MQ=255) aGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGAcg > 2:53082/1‑131 (MQ=255) aGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGAcg < 1:53082/132‑2 (MQ=255) aGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑t < 4:12810/149‑1 (MQ=255) gCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCt > 2:64306/1‑149 (MQ=255) aaCCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGa > 5:249501/1‑119 (MQ=255) aaCCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGGCGTGCTCGa < 6:249501/119‑1 (MQ=255) gcgcAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATgcg > 1:284625/1‑149 (MQ=255) cgcAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGa > 6:9723/1‑138 (MQ=255) cgcAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGa < 5:9723/138‑1 (MQ=255) cgcAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATgcg > 5:147361/1‑148 (MQ=255) agcagcGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCTACGTGCAGGCTGCCGTCGAGAACTCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAgg < 5:223239/149‑1 (MQ=255) agcagcGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAgg < 1:8124/149‑1 (MQ=255) cagcGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGc > 2:265021/1‑149 (MQ=255) gcgagcgTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGACCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGccc > 3:304206/1‑149 (MQ=255) cgagcgTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGcccc < 7:58857/149‑1 (MQ=255) gTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGTTCTGTGGTACGACGCCAACTTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTAGACCTTGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATcc > 3:88971/1‑149 (MQ=255) gTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGAACTGGATGCGCACATCACGGCCCC‑GATcc > 3:93383/1‑149 (MQ=255) cGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCtt < 5:224267/148‑1 (MQ=255) cGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCtt < 5:2543/148‑1 (MQ=255) cGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCtt < 6:147361/148‑1 (MQ=255) cGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCtt < 1:265021/148‑1 (MQ=255) aaCGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGGTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GCTCCTTGAGTTACGc > 5:206242/1‑149 (MQ=255) tGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCtt < 6:100500/134‑1 (MQ=255) tGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCtt > 5:100500/1‑134 (MQ=255) gATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGc < 2:284625/148‑1 (MQ=255) tCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGt < 3:172087/149‑1 (MQ=255) tCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGt > 4:172087/1‑149 (MQ=255) aaGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGa < 1:8310/149‑1 (MQ=255) aGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGAt < 7:103916/149‑1 (MQ=255) gCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATa < 5:117734/149‑1 (MQ=255) ccGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAgg > 5:278550/1‑134 (MQ=255) ccGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAgg < 6:278550/134‑1 (MQ=255) t‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCAtgt < 1:64306/149‑1 (MQ=255) aCGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACTTGCAGGCTGCCTTCGAGCACGCCGTTCTCGAGCTGGCTGGGGGCGATGA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGc < 4:304206/149‑1 (MQ=255) gggCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCgg > 4:94926/1‑149 (MQ=255) ggCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGc < 6:132368/149‑1 (MQ=255) tCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTc > 6:3743/1‑149 (MQ=255) gtgGTACGACGCCTACGTGCTGGCTGCCGTCGTGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCAc < 8:174978/148‑1 (MQ=255) gtgGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATAAGGGCCCC‑GAGCCTTGAGTTCCGCCACGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCAc > 7:174978/1‑148 (MQ=255) tgGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCAc > 8:293014/1‑147 (MQ=255) tgGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCAc < 5:3743/147‑1 (MQ=255) ggTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCCTGATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCAc > 5:269838/1‑147 (MQ=255) gacgCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAgg < 8:143035/136‑1 (MQ=255) gacgCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAgg > 7:143035/1‑136 (MQ=255) ccAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGt < 3:9371/149‑1 (MQ=255) cAACGTGCAGGCTGCCGTCGCGCACGCCGTGCTCGCCCGGGGTGGGGGCGATCA‑AGCGGATATGGCTGCGGACCTCAGGGCCCC‑GGTCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGt > 5:198624/1‑148 (MQ=255) tGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGcc < 7:195995/149‑1 (MQ=255) gCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATAc > 5:163426/1‑111 (MQ=255) gCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATAc < 6:163426/111‑1 (MQ=255) gCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGt > 2:96032/1‑149 (MQ=255) ccaggTCGAGCACGGCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGtt > 2:14827/5‑148 (MQ=255) ccGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTc < 1:96032/147‑1 (MQ=255) ccGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑AGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGGTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAg < 4:53444/149‑1 (MQ=255) cGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGc > 3:264194/1‑149 (MQ=255) gTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGc > 6:91675/1‑148 (MQ=255) gTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGc < 5:91675/148‑1 (MQ=255) gCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCAGTGCGGATCTGGATgcgc > 1:184644/1‑47 (MQ=255) gCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATgcgc < 2:184644/46‑1 (MQ=255) | TCTATCTGCTGGTCGTCGGCGTAGAACAGCGGGTGGCCAACCGCGCAGTACAGCAGCGAGCGTTCGCTGTACAACGGTTGATACTCAAGCCCCGAT‑AACGGGCTGGTCTGTGGTACGACGCCAACGTGCAGGCTGCCGTCGAGCACGCCGTGCTCGACCTGGCTGGGGGCGATCA‑TGCGGATCTGGATGCGCACATCAGGGCCCC‑GATCCTTGAGTTCCGCCAGGGCATGGGTGATACGCATGTGCGGCAGGGTCACCAGGTTGTCGGTCAGGCCGATGTTCAGC > NC_002947/693443‑693727 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |