| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 973,283 | C→T | 5.5% | A525A (GCC→GCT) | secD → | protein translocase subunit SecD |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 973,283 | 0 | C | T | 5.5% | 226.0 / 2.1 | 73 | A525A (GCC→GCT) | secD | protein translocase subunit SecD |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (30/39); new base T (2/2); total (32/41) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.44e-01 | |||||||||||
GCGCCTTCGGTGTGCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTT > NC_002947/973144‑973427 | gcgcCTTCGGTGTGCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTg < 7:265504/149‑1 (MQ=255) cgcCTTCGGTGTGCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGa < 2:162516/149‑1 (MQ=255) gcCTTCGGTGTGCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGAt < 2:84909/149‑1 (MQ=255) ttCGGTGTGCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGATGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGAtctt > 7:28257/1‑149 (MQ=255) ctgtggGCTGGCCACCATCGCGCTGGCGGGCAACTTGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCTTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGAGCATTGGTATGGCTGTGGACGCCAACGTGCTGAtcttc < 8:205970/146‑1 (MQ=255) ggTGTGCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTtctc < 3:37544/149‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTcgc < 1:129806/149‑1 (MQ=255) tgtgCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGGGCTGCTGCTTGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGCCC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTcgc < 6:64463/149‑1 (MQ=255) tgCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTcgcg < 5:58103/148‑1 (MQ=255) tgCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTcgcg > 3:196733/1‑148 (MQ=255) ggCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTc > 4:254169/1‑149 (MQ=255) gCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCTAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTcg > 7:253356/1‑149 (MQ=255) ccaccaTCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTcgc < 8:278115/149‑1 (MQ=255) caccaTCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTcgc > 7:141272/1‑148 (MQ=255) accaTCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTcgcg > 3:83541/1‑148 (MQ=255) caTCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACCTCTGACCCTGCCGGGGATTGCCGGCAT‑GGTGTTGACCATGGGTATGGGGGTGGACGCCAACGTGCTGCTCTTCTCGCGTA‑TTcggg > 1:248952/1‑145 (MQ=255) caTCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTcgcg > 7:164157/1‑146 (MQ=255) aTCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGc < 8:65726/124‑1 (MQ=255) aTCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGc > 7:65726/1‑124 (MQ=255) cccTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGGGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATATTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATc < 7:43551/149‑1 (MQ=255) cTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑GGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATcgc < 8:23374/149‑1 (MQ=255) tGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATcgcg > 1:274846/1‑149 (MQ=255) gCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGc < 4:79012/149‑1 (MQ=255) gggCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTg < 4:196733/149‑1 (MQ=255) gggCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTCTTCGCGAA‑TACGCGAGAAGAt > 7:61623/1‑141 (MQ=255) gggCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTCTTCGCGAA‑TACGCGAGAAGAt < 8:61623/141‑1 (MQ=255) gCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCTAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGt < 8:253356/149‑1 (MQ=255) cAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTCGTa < 4:83541/149‑1 (MQ=255) aaCATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAgaga < 2:284293/136‑1 (MQ=255) aaCATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAgaga > 1:284293/1‑136 (MQ=255) aaCATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTAt > 4:246819/1‑149 (MQ=255) aCATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTcgc > 8:20136/1‑120 (MQ=255) aCATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTcgc < 7:20136/120‑1 (MQ=255) tgatgctgctgcTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCg < 8:28257/146‑1 (MQ=255) tGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCg < 8:141272/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCgg > 8:27900/1‑149 (MQ=255) gCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCg > 5:157098/1‑135 (MQ=255) gCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCg < 6:157098/135‑1 (MQ=255) gTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCATACGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATc > 1:78143/1‑149 (MQ=255) tCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGt < 7:124246/128‑1 (MQ=255) tCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGt > 8:124246/1‑128 (MQ=255) ggCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCTAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATcgcg > 1:304223/1‑149 (MQ=255) cGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGTTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGcc < 3:27665/149‑1 (MQ=255) tgaccctgCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAaga < 7:96930/88‑1 (MQ=255) tgaccctgCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAaga > 8:96930/1‑88 (MQ=255) gaccctgCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCgg > 1:227304/1‑149 (MQ=255) ccGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAAtc < 2:227304/147‑1 (MQ=255) cGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCTAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAAtcgtc < 2:304223/149‑1 (MQ=255) ggCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCt > 3:245222/1‑149 (MQ=255) ggCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCt > 3:241045/1‑149 (MQ=255) gCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCt > 6:133687/1‑148 (MQ=255) aT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTtctc < 2:271845/50‑1 (MQ=255) aT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTtctc > 1:271845/1‑50 (MQ=255) aT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTc > 4:192038/1‑111 (MQ=255) aT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTc < 3:192038/111‑1 (MQ=255) t‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGacc < 7:27900/149‑1 (MQ=255) tgtTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGaccacc < 4:242195/149‑1 (MQ=255) gtTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCAccc > 4:107569/1‑149 (MQ=255) gACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGt > 7:224377/1‑149 (MQ=255) aCCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGt < 4:245222/148‑1 (MQ=255) aCCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGt < 4:241045/148‑1 (MQ=255) ccATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTg < 7:32884/149‑1 (MQ=255) ccATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTg < 2:78143/149‑1 (MQ=255) cATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGt < 6:296111/67‑1 (MQ=255) cATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGt > 5:296111/1‑67 (MQ=255) gccgTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTAGTTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGa > 1:202666/4‑117 (MQ=255) gCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGa < 2:202666/116‑1 (MQ=255) gCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCa < 3:254169/148‑1 (MQ=255) gCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCAt > 6:116837/1‑149 (MQ=255) gTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGtt > 6:109559/1‑134 (MQ=255) gTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGtt < 5:109559/134‑1 (MQ=255) gACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCTCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGtt < 8:164157/149‑1 (MQ=255) aCGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGttt < 3:107569/149‑1 (MQ=255) | GCGCCTTCGGTGTGCTGGCCACCATCGCCCTGGCGGGCAACATGGTGCTGCTGCTGGCGTTGATGTCGCTGCTGGGGGCGACC‑CTGACCCTGCCGGGTATTGCCGGCAT‑CGTGTTGACCATGGGTATGGCGGTGGACGCCAACGTGCTGATCTTCTCGCGTA‑TTCGCGAAGAGATCGCGGCTGGTATGTCGGTGCAGCGCGCCATCCACGAAGGCTTCAATCGCGCCTACTCGGCAATCGTCGACGCCAACCTGACCACCCTGTTGGTCGGCGGCATCCTGTTT > NC_002947/973144‑973427 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |