Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 999,625 | C→G | 7.0% | G165A (GGC→GCC) | PP_0861 ← | outer membrane ferric siderophore receptor |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 999,625 | 0 | C | G | 7.0% | 181.6 / 4.0 | 57 | G165A (GGC→GCC) | PP_0861 | outer membrane ferric siderophore receptor |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (25/28); new base G (2/2); total (27/30) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.07e-01 |
GGCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGT > NC_002947/999479‑999769 | ggCAACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGgccgcgccg > 8:270484/1‑149 (MQ=255) cGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGccgcgccgcg > 5:321226/1‑149 (MQ=255) ggCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGGCGCGGccgg < 6:47007/149‑3 (MQ=255) gCAACGGTATCGCTGAACTCGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCCGCCAcc > 1:103668/1‑149 (MQ=255) ggTATCGCTGAACTCGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATgg > 2:234515/1‑149 (MQ=255) aCTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCgg < 3:308834/148‑1 (MQ=255) gTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGccc < 5:71883/147‑1 (MQ=255) gTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCt > 1:26016/1‑149 (MQ=255) gTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCt > 3:163168/1‑149 (MQ=255) gTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAACTCGGccatcgg < 6:133142/148‑6 (MQ=255) ttGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGc < 3:159075/149‑1 (MQ=255) aTCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACt > 2:98705/1‑148 (MQ=255) gAAGGTGTAGCGCTGTGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCaa < 8:264169/149‑1 (MQ=255) gAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCaa < 1:231884/149‑1 (MQ=255) aaGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCaa > 8:159958/1‑148 (MQ=255) aGGTGTAGCTCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCCGGTCCAGGCGCCGTCCTGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGGTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACa < 6:309693/149‑1 (MQ=255) tgtAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGAt < 4:163168/149‑1 (MQ=255) tAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGAtt < 1:234515/148‑1 (MQ=255) tGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTg > 3:192443/1‑126 (MQ=255) tGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTg < 4:192443/126‑1 (MQ=255) gggTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCg < 7:270484/149‑1 (MQ=255) gTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGaa < 1:85895/149‑1 (MQ=255) gTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGaa > 4:78955/1‑149 (MQ=255) tGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCg < 5:62279/112‑1 (MQ=255) tGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCg > 6:62279/1‑112 (MQ=255) tGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGAt > 8:206488/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGttt > 6:101231/1‑149 (MQ=255) ccAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGttt < 2:26016/149‑1 (MQ=255) gTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgc > 4:285377/1‑149 (MQ=255) ccAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgcgc < 3:11126/149‑1 (MQ=255) cAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgcgc > 3:159239/1‑148 (MQ=255) cAGGCGCCGTCCAGCGAGTTCCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGgcgc < 3:6662/148‑1 (MQ=255) cGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTca < 4:159239/149‑1 (MQ=255) gTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTcac > 4:27805/1‑149 (MQ=255) tCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATgg < 8:132338/115‑1 (MQ=255) tCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATgg > 7:132338/1‑115 (MQ=255) cAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTcacgca > 7:150510/1‑149 (MQ=255) cAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTcacgca < 3:27805/149‑1 (MQ=255) gCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGACGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTcacgcacg < 6:321226/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTgg > 5:220433/1‑127 (MQ=255) gTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTgg < 6:220433/127‑1 (MQ=255) cccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATgg > 8:43484/1‑64 (MQ=255) ccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTc > 6:90654/1‑133 (MQ=255) ccAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTc < 5:90654/133‑1 (MQ=255) cAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCgg > 2:153629/1‑115 (MQ=255) cAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCgg < 1:153629/115‑1 (MQ=255) aGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGt > 2:275937/1‑148 (MQ=255) ttgcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTg > 1:12262/1‑149 (MQ=255) ttgcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTg > 5:213722/1‑149 (MQ=255) gcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTgg < 3:285377/148‑1 (MQ=255) gcttACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTgg < 7:206488/148‑1 (MQ=255) ccAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCAGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTc < 7:159958/148‑1 (MQ=255) aTGGTACCGGCGGCCGCGCCGCGGCCACGGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCcgc < 2:103668/148‑1 (MQ=255) tGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCgg > 7:161180/1‑149 (MQ=255) aCCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATg > 4:213203/1‑148 (MQ=255) gtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGaa > 7:226801/3‑134 (MQ=255) gtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGaa < 8:226801/132‑1 (MQ=255) gtggccgCGGCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACgg > 8:145918/3‑149 (MQ=255) cggccgCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACggg < 1:275937/149‑1 (MQ=255) cgcgccgcgGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGt > 1:247874/1‑149 (MQ=255) cgcgccgcgGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGt > 5:28176/1‑149 (MQ=255) | GGCGACCGGCAACGGTATCGCTGAACTGGTAGTTGCCATCGAAGGTGTAGCGCTGGGTCTGGTCGCTGCCCCAGGTCCAGGCGCCGTCCAGCGAGTTGCCCAGATGCGCGCGCTTGCTTACCAGGTTGATGGTACCGCCGGCCGCGCCGCGGCCACCGATGGCCGAGTTCGGCCCCTTGGCCACTTCAACAGATTCGATGGCGAAGATTTCGCGGGTTTGGGCGCCAGTGTCACGCACGCCGTCCAGGTAAGTATCGCCCTGGGCGTCGAAGCCGCGGATGAACGGGCGGT > NC_002947/999479‑999769 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |