| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,120,932 | G→A | 6.8% | V125I (GTT→ATT) ‡ | PP_0982 → | YjgP/YjgQ family permease |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,120,932 | 0 | G | A | 6.8% | 218.7 / 3.1 | 73 | V125I (GTT→ATT) ‡ | PP_0982 | YjgP/YjgQ family permease |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (31/37); new base A (2/3); total (33/40) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
TTACGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCGGG > NC_002947/1120784‑1121078 | ttACGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCg > 4:14507/1‑149 (MQ=255) cGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGtt < 5:30343/148‑1 (MQ=255) cGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTg < 1:142317/149‑1 (MQ=255) gggCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGc < 5:190409/149‑1 (MQ=255) tACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTg > 2:259094/1‑147 (MQ=255) ccTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCACCTGGGCAACGCCCAggggggcc < 6:198880/149‑7 (MQ=255) gAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGcagcag < 4:139940/147‑1 (MQ=255) gAAAGCGAGATGACCGGGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCCGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTTGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGGTGCCCAGGTGcagcag < 1:203786/147‑1 (MQ=255) aaGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGTTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGatca > 7:54216/1‑149 (MQ=255) gCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGatcatc < 5:280138/149‑1 (MQ=255) cGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGAtcatca < 5:295546/149‑1 (MQ=255) cGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATcagacaaacct > 4:292439/1‑144 (MQ=255) tGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCg > 5:221813/1‑111 (MQ=255) tGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCg < 6:221813/111‑1 (MQ=255) tGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGatcat < 5:95249/133‑1 (MQ=255) tGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGatcat > 6:95249/1‑133 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCt > 5:6839/1‑149 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCt > 2:113777/1‑149 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCAACGCCCAggg > 3:279849/1‑118 (MQ=255) tCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCAACGCCCAggg < 4:279849/119‑2 (MQ=255) aCTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGAtcatca < 4:96503/127‑1 (MQ=255) aCTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGAtcatca > 3:96503/1‑127 (MQ=255) gCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGTGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTc > 8:251323/1‑149 (MQ=255) gCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTgca > 6:160948/1‑112 (MQ=255) gCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTgca < 5:160948/112‑1 (MQ=255) gCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTc < 6:6839/149‑1 (MQ=255) aTGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGAt > 3:136414/1‑132 (MQ=255) aTGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGAt < 4:136414/132‑1 (MQ=255) gAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTg > 6:15274/1‑106 (MQ=255) gAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTg < 5:15274/106‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAcc > 7:136661/1‑137 (MQ=255) gCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGAcc < 8:136661/137‑1 (MQ=255) gCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACAcc > 7:163214/1‑149 (MQ=255) cagcGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGACGCCTGGCCCCCCTGGGCAACGCCCAggggg < 1:28955/101‑4 (MQ=255) cagcGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCAACGCCCAggggg > 2:28955/1‑97 (MQ=255) gcgcCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGAGGGCATGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATAAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGATTTCGAAACCTTGGt > 1:249507/1‑149 (MQ=255) gcgcCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGc > 3:9597/1‑149 (MQ=255) ccTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCgg > 3:49370/1‑149 (MQ=255) tgctgGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGc > 6:310874/1‑149 (MQ=255) gctgGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGcc > 4:236655/1‑149 (MQ=255) tgGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGc < 4:9597/149‑1 (MQ=255) tgGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGc > 5:163445/1‑149 (MQ=255) gggCATGACCTTGGCGGGGGCTGCTGTTGTTGCCCTGCTGGGGGCCTGGCTGA‑‑GCGTTA‑GCCTGGCCCGCCTGGGCGTTGCCCAGGTGGTGCAGATCATCTGCCAGCTGGATGCCCTGAGTGAGTTCGACACGTTGGTGCCGGGCCGc < 8:54216/148‑1 (MQ=255) gggCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCt > 5:312852/1‑149 (MQ=255) gCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGTGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTc < 7:251323/149‑1 (MQ=255) gCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGcc < 3:293866/113‑1 (MQ=255) gCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGcc > 4:293866/1‑113 (MQ=255) aTGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt > 8:247963/1‑130 (MQ=255) aTGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCt < 7:247963/130‑1 (MQ=255) tGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAg < 3:236655/149‑1 (MQ=255) aCCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGAc < 4:49370/149‑1 (MQ=255) cATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTg > 3:278532/1‑127 (MQ=255) cATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTg < 4:278532/127‑1 (MQ=255) aTGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCtt < 3:14507/149‑1 (MQ=255) tGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGAc > 7:214498/1‑145 (MQ=255) tGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGAc < 8:214498/145‑1 (MQ=255) gcgcCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGc < 6:163445/148‑1 (MQ=255) gcCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTg < 5:310874/149‑1 (MQ=255) gTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCgg < 2:249507/147‑1 (MQ=255) gCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCGTGCAGCCCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAc > 6:29642/1‑149 (MQ=255) cccTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAAc < 1:113777/148‑1 (MQ=255) ctgctgGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCta > 6:89906/1‑149 (MQ=255) tgctgGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCta > 6:104411/1‑148 (MQ=255) tggtggCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATAcc > 7:86576/1‑149 (MQ=255) gtggCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGa < 6:299306/149‑1 (MQ=255) gtggCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCACCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATAcc < 5:89906/147‑1 (MQ=255) gCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGc > 4:154449/1‑148 (MQ=255) gCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGc > 7:194255/1‑148 (MQ=255) cTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAAc > 1:203124/1‑149 (MQ=255) a‑‑gcctga‑gcctgGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCgg < 6:312852/148‑1 (MQ=255) ctga‑gcctgGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCgg < 1:158312/120‑1 (MQ=255) tga‑gcctgGCCCCCCTGGGAGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCATCCAGCAGTATGCCCTGACCGAGTTCTACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCta < 7:52781/115‑2 (MQ=255) ccccccTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAAc < 2:203124/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCggg < 8:163214/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCggg < 5:29642/149‑1 (MQ=255) gCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCggg < 3:154449/149‑1 (MQ=255) | TTACGGGCGCCTGTACCTGGAAAGCGAGATGACCGTGCTGTCGGCCACTGGCATGAGCCAGCAGCGCCTGCTGGGCATGACCATGGCGCCGGCTGCCCTGGTTGCCCTGCTGGTGGCCTGGCTGA‑‑GCCTGA‑GCCTGGCCCCCCTGGGCGTTGCCCAGGTGCAGCAGATCATCAGCCAGCAGGATGCCCTGACCGAGTTCGACACCTTGGTGCCGGGCCGCTTCCAGACCTTGCGTGATGGCTCGCGGGTAACCTATACCGAGCAACTGTCGGATGACCGCATCAACCTGGGCGGG > NC_002947/1120784‑1121078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |