Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,531,233 | C→A | 7.7% | intergenic (+35/+13) | lpxC → / ← PP_1344 | UDP‑3‑O‑[3‑hydroxymyristoyl] N‑acetylglucosamine deacetylase/hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,531,233 | 0 | C | A | 7.7% | 204.0 / 6.6 | 65 | intergenic (+35/+13) | lpxC/PP_1344 | UDP‑3‑O‑[3‑hydroxymyristoyl] N‑acetylglucosamine deacetylase/hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (34/26); new base A (3/2); total (37/28) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.58e-01 |
AACAACCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTT > NC_002947/1531085‑1531380 | aacaacCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTc < 4:271360/149‑1 (MQ=255) caacCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCgg > 1:152296/1‑149 (MQ=255) aacCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCggg > 2:178811/1‑149 (MQ=255) aacCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑ATGTTGCGGCAGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCggg > 2:21514/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCggg < 2:23262/147‑1 (MQ=255) ccAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTg > 2:15791/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATCAAGGCCACCTTCGGGTg > 4:28390/1‑149 (MQ=255) ccAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAAACGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCggg > 1:23262/1‑147 (MQ=255) gcgcAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCttttt < 2:152296/148‑1 (MQ=255) aTTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATgg < 5:6705/143‑1 (MQ=255) aTTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATgg > 6:6705/1‑143 (MQ=255) aTTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCCGAAGGTGGCCttaatgaa < 5:43011/141‑7 (MQ=255) aTTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCCGAAGGTGGCCttaatgaa > 6:43011/1‑135 (MQ=255) cTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTgg < 5:108030/149‑1 (MQ=255) tGAAACCGATGCCT‑GGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGc > 2:186760/1‑149 (MQ=255) aaaCCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGc < 2:173690/148‑1 (MQ=255) aTGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGgcc > 7:233289/1‑149 (MQ=255) cTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGgccgcc > 4:137033/1‑148 (MQ=255) tGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCaa > 1:269974/1‑149 (MQ=255) ggTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTc > 5:20697/1‑147 (MQ=255) gTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCCACTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTc > 1:70553/1‑147 (MQ=255) gTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGgcc < 1:124207/135‑1 (MQ=255) gTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCa < 3:137033/148‑1 (MQ=255) gTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAg > 4:178910/1‑149 (MQ=255) cTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCg < 2:70553/149‑1 (MQ=255) tCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCa > 8:274351/1‑149 (MQ=255) aaGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCCCCTTCGGGTGGCCGTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACg > 1:235451/1‑148 (MQ=255) aCCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCg < 4:287358/145‑1 (MQ=255) aCCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCg > 3:287358/1‑145 (MQ=255) ccGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAAt < 3:178910/149‑1 (MQ=255) gTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCAc > 3:102507/1‑122 (MQ=255) gTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCAc < 4:102507/122‑1 (MQ=255) aTGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCt > 2:146317/1‑85 (MQ=255) aTGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCt < 1:146317/85‑1 (MQ=255) cTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTcgcg > 5:157170/1‑148 (MQ=255) tGTTGCGGCCGTGTAAGTTAGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGACGCAAACCGTTCCAGTGCGGCAAGCAGTTTGGGGTCGGTAATGACCTcgg > 3:206249/1‑137 (MQ=255) gTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAg > 5:150854/1‑149 (MQ=255) gCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGct > 5:243170/1‑149 (MQ=255) gCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCTGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCtctc < 6:243170/149‑1 (MQ=255) cGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCgg < 5:210420/149‑1 (MQ=255) gTTCGAACACTCTCTAGTTCATCAAGGCCACCTTCGGGTTGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCt < 3:28390/149‑1 (MQ=255) gAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGtt < 6:157170/148‑1 (MQ=255) acacTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGGCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGa < 3:278432/149‑1 (MQ=255) tctctAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACAGTACCAGTGCGGCAGGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCCAA‑AGc > 4:219651/1‑149 (MQ=255) tctAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTc > 4:110118/1‑149 (MQ=255) tAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCTCTGTTCGAA‑AGCTc < 1:21514/147‑1 (MQ=255) gTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCcgcg < 8:235791/131‑1 (MQ=255) gTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCcgcg > 7:235791/1‑131 (MQ=255) ttCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGtt < 8:130038/135‑1 (MQ=255) ttCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGtt > 7:130038/1‑135 (MQ=255) ttCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCg > 4:54436/1‑149 (MQ=255) taaaaaaGGCCACCCGAAGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAg < 1:79693/111‑1 (MQ=255) taaaaaaGGCCACCCGAAGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAg > 2:79693/6‑116 (MQ=255) cATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGc < 7:274351/148‑1 (MQ=255) cATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCa > 1:121823/1‑149 (MQ=255) aTTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCa < 1:186760/148‑1 (MQ=255) aTTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCAt < 2:269974/149‑1 (MQ=255) aTTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGAGCT‑TTCGAACAGCGCGGCCgaga < 8:233289/149‑4 (MQ=255) ttAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCGAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCGTg > 8:300053/1‑149 (MQ=255) ttAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTc > 4:140726/1‑132 (MQ=255) ttAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTc < 3:140726/132‑1 (MQ=255) aaGGCCACCCGAAGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGcc > 6:67887/1‑149 (MQ=255) aGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGcc < 6:20697/148‑1 (MQ=255) ggCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTCGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGATTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCAGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGCCCg > 6:158468/1‑149 (MQ=255) cTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGc > 6:82707/1‑149 (MQ=255) cTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGGCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGc > 6:262376/1‑149 (MQ=255) cGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCtt < 3:110118/148‑1 (MQ=255) | AACAACCAGCTGTTGCGCAAGCTGATTGCTGAAACCGATGCCTGGGAAGTGGTCACTTTCGAAGATGCCAGCACGGCACCGATCTCGTACATGCGCC‑CTGTTGCGGCCGTGTAAGTTCGAACACTCTCTAGTTCATTAAGGCCACCTTCGGGTGGCCTTTTTTATGGCTTGCCCTGGGCGTGGGCCGCCAACCGTTCCAGTGCGGCACGCAGTTTGGGGTCGGTAATGCCCTCGGCGGTGTCGCGCAGGCTCTCGGCCGCGCTGTTCGAA‑AGCTCGGCCGCATGCCCGCCACGCTT > NC_002947/1531085‑1531380 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |