| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 1,622,188 | G→A | 9.2% | E368K (GAG→AAG) | PP_1421 → | sensor histidine kinase TctE |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 1,622,188 | 0 | G | A | 9.2% | 210.4 / 5.8 | 75 | E368K (GAG→AAG) | PP_1421 | sensor histidine kinase TctE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (28/40); new base A (5/2); total (33/42) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.29e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
AAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGA > NC_002947/1622042‑1622333 | aaGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAg > 1:196052/1‑149 (MQ=255) gTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAgttgtt > 5:184848/1‑148 (MQ=255) tGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAATGAGTTGTTGa < 6:182955/149‑1 (MQ=255) tGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGa < 7:160660/149‑1 (MQ=255) gcgcAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAg > 8:241716/1‑149 (MQ=255) cAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCa > 1:186605/1‑148 (MQ=255) cAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCa < 2:186605/148‑1 (MQ=255) aGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCCCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAAc < 7:267728/149‑1 (MQ=255) gCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAAcc > 8:252561/1‑149 (MQ=255) ggTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACAACTCGTTGAGCaatgt < 7:39587/148‑4 (MQ=255) cTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtggt > 2:85681/1‑149 (MQ=255) tGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCACCCtggtg > 8:139687/1‑149 (MQ=255) gACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtggtg < 8:295847/147‑1 (MQ=255) aCTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGa > 2:315076/1‑148 (MQ=255) ttGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtg < 6:31659/141‑1 (MQ=255) ttGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtg > 5:31659/1‑141 (MQ=255) ttGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACaa > 1:49525/1‑149 (MQ=255) ttGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTAGATCAAGGTGGACCCCAAATAAATAAAAAAAAAATTGAGCAACCTGGTGGACaa > 6:278690/1‑149 (MQ=255) gTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGcc > 3:310874/1‑149 (MQ=255) aGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTAGATCAAGGTGGACCCCAAATAAATAAAAAAAAAATTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCttt > 4:293158/1‑148 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTgg > 2:42692/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTgg > 3:162204/1‑149 (MQ=255) gTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTgg < 2:49525/149‑1 (MQ=255) ttGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGgc < 7:247206/149‑1 (MQ=255) ggCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGgcg > 6:212930/1‑148 (MQ=255) ccGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATa < 1:315076/149‑1 (MQ=255) cTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGc < 7:99888/149‑1 (MQ=255) cTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGGGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGTGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGc < 3:204831/149‑1 (MQ=255) gggCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCgg > 2:262997/1‑149 (MQ=255) gCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGt < 2:196052/149‑1 (MQ=255) catggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTg > 2:136501/1‑149 (MQ=255) atggccatggcTCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTgg < 4:162204/149‑1 (MQ=255) ggccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGc > 5:216273/1‑148 (MQ=255) gccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCaa < 5:80853/149‑1 (MQ=255) ccatggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAt < 1:85681/149‑1 (MQ=255) atggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAtgt < 4:269991/149‑1 (MQ=255) atggcGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGGGGCAAtgt > 7:984/1‑149 (MQ=255) gcgcCTTTGGCGCACAAGCGGGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGa < 3:293158/148‑1 (MQ=255) cgcCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGTCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGAtt < 1:262997/149‑1 (MQ=255) cgcCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGAtt < 6:216273/149‑1 (MQ=255) gcCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTAGATCAAGGTGGACCCGACATTAATAAAAAAATTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCg > 6:284256/1‑133 (MQ=255) gcCTTTCGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCg < 5:284256/133‑1 (MQ=255) tttGGCGCACAAGGGGGGGGTGGCGCTGGCGGTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGc < 4:310874/149‑1 (MQ=255) tGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGc < 8:9655/147‑1 (MQ=255) tGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg < 1:42692/148‑1 (MQ=255) tGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCg < 6:184848/148‑1 (MQ=255) ggCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 8:111174/148‑1 (MQ=255) ggCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 4:87763/148‑1 (MQ=255) ggCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCgg < 2:176374/148‑1 (MQ=255) gcACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTaa > 7:258469/1‑149 (MQ=255) gcACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTaa > 5:321280/1‑149 (MQ=255) gcgcGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCtggt < 3:112272/90‑1 (MQ=255) gcgcGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTCGATGAAGGAGGAGCCGACATTACTCAACAACTAGTTTAGCAACAtggt > 4:112272/1‑90 (MQ=255) gctggcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtg > 5:275441/1‑148 (MQ=255) gcgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagt < 4:259257/149‑1 (MQ=255) cgctggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGGGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtg < 8:984/149‑1 (MQ=255) tggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaa < 6:275441/149‑1 (MQ=255) tggAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtggaa < 8:258469/149‑1 (MQ=255) gcggCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAga < 5:278690/147‑1 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtg > 6:206288/1‑141 (MQ=255) gCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCtggaagtg < 5:206288/141‑1 (MQ=255) ccGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacgac < 5:212930/149‑1 (MQ=255) gcCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAg < 7:241716/149‑1 (MQ=255) gtgGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGACTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATTTGATTTTGCGGGTAATGGCGCAGGCAGAGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTc > 5:205188/1‑149 (MQ=255) ggTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTccc > 2:189558/1‑149 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAtgtg > 6:114617/1‑88 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAtgtg < 5:114617/88‑1 (MQ=255) gTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAgacg > 3:96423/1‑131 (MQ=255) tGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTg > 5:145608/1‑149 (MQ=255) tGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAAAGTGATTTTGCGGGTAATGGCTCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCCGGTATTCACGTg > 6:188821/1‑149 (MQ=255) acgggggAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTCAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAAAGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTgg < 7:139687/146‑1 (MQ=255) gACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGTCCGAGCGCGAAc < 6:321280/149‑1 (MQ=255) ttGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGgt < 1:189558/149‑1 (MQ=255) tCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTc > 5:287937/1‑149 (MQ=255) aaCGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGa < 7:252561/149‑1 (MQ=255) | AAGGCGGTGCGCAGCGTCTGGACTTGAGTCAGTTGGCCCGCGAGCTGGGCATGGCCATGGCGCCTTTGGCGCACAAGCGCGGGGTGGCGCTGGCGCTGGAGGCCGAGGCGCCGGTGTGGTTGAAGGGGGAGCCGACATTGCTCAACGAGTTGTTGAGCAACCTGGTGGACAATGCCTTGGCGCATACGCCAGCGGGTGGCAATGTGATTTTGCGGGTAATGGCGCCGGCAGTGCTGGAAGTGGAAGACGACGGGCCAGGTATTCCCGTGGCCGAGCGCGAACGGGTGTTCGA > NC_002947/1622042‑1622333 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |