Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,622,921 | C→G | 7.3% | A146P (GCC→CCC) | PP_1422 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,622,921 | 0 | C | G | 7.3% | 209.3 / 5.7 | 68 | A146P (GCC→CCC) | PP_1422 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (31/32); new base G (3/2); total (34/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 2.61e-01 |
GCCTTGAGGATCTTGTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGATCACCAGGCCGATGGC > NC_002947/1622773‑1623068 | gCCTTGAGGATCTTGTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAACGTGGc < 7:286539/149‑1 (MQ=255) cTTGAGGATCTTGTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCt < 8:299979/149‑1 (MQ=255) gAGGATCTTGTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGt > 2:33220/1‑149 (MQ=255) tGTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGcc > 5:69910/1‑137 (MQ=255) tGTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGcc < 6:69910/137‑1 (MQ=255) gTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGGCCACCTTGGGTGGGCTGGTcaacc < 5:169254/145‑5 (MQ=255) tCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTga < 3:18685/148‑1 (MQ=255) tCCCCCAGCACCGGCGGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCTGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCGAATCTGTTTGACCAGCCCACGCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTga < 8:229294/148‑1 (MQ=255) ccccAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATATATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGagag > 8:165073/1‑149 (MQ=255) ccccAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGagag < 1:311532/149‑1 (MQ=255) cGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGc > 6:293328/1‑149 (MQ=255) ggCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCACTCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGc < 1:253273/149‑1 (MQ=255) gCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GTAGCGa > 4:84708/1‑149 (MQ=255) cTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTg < 1:297642/124‑1 (MQ=255) cTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTg > 2:297642/1‑124 (MQ=255) cTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGAttt < 5:301701/149‑1 (MQ=255) gATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCg > 6:291121/1‑148 (MQ=255) tCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAg < 3:210341/149‑1 (MQ=255) cacaTAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGc > 3:244302/1‑149 (MQ=255) aTGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGc > 5:121884/1‑149 (MQ=255) aGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGTCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGc < 6:121884/149‑1 (MQ=255) aGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGc > 8:141675/1‑149 (MQ=255) aGGCAAACCGGGTCAGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGc < 7:63485/149‑1 (MQ=255) gCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCa > 6:20878/1‑149 (MQ=255) gCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCa > 3:83263/1‑149 (MQ=255) gggTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAg < 5:20878/149‑1 (MQ=255) gggTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAg < 7:141675/149‑1 (MQ=255) gTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGTCGAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAgg < 1:60596/149‑1 (MQ=255) acaacaGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGATGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTg < 4:244302/149‑1 (MQ=255) aacaGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGc > 5:123397/1‑149 (MQ=255) caGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGcc > 2:59307/1‑148 (MQ=255) aGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCa < 4:83263/149‑1 (MQ=255) gTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCTGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGcc > 4:3505/1‑146 (MQ=255) gTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCTGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGcc < 3:3505/146‑1 (MQ=255) gTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGAt > 1:118494/1‑121 (MQ=255) gTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGAt < 2:118494/121‑1 (MQ=255) cGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGata > 1:8547/1‑149 (MQ=255) gCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGc < 4:302477/118‑1 (MQ=255) gCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGc > 3:302477/1‑118 (MQ=255) tctTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAg > 5:28248/1‑149 (MQ=255) ttCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACtt > 5:171623/1‑119 (MQ=255) ttCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACtt < 6:171623/119‑1 (MQ=255) ggCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTc < 1:59307/148‑1 (MQ=255) ggCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTc < 5:293328/148‑1 (MQ=255) cATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGc < 2:8547/149‑1 (MQ=255) aTAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAg > 1:264856/1‑97 (MQ=255) aTAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAg < 2:264856/97‑1 (MQ=255) tAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTc > 6:268139/1‑149 (MQ=255) tAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTc < 6:123397/149‑1 (MQ=255) aTGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATcgc < 8:153442/133‑1 (MQ=255) aTGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATcgc > 7:153442/1‑133 (MQ=255) tGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGcc < 6:201037/122‑1 (MQ=255) tGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGcc > 5:201037/1‑122 (MQ=255) ggAGGACCGGCA‑GCGCGCCACTCTGGGTGACCAGCCCACCCAAGGGGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATCTCGCGCAGTTTCTGCTCCACt < 7:262845/148‑1 (MQ=255) gAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTg > 8:139300/1‑149 (MQ=255) ccGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGc > 2:238266/1‑149 (MQ=255) cGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGc > 2:268945/1‑148 (MQ=255) gcCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCAt < 6:28248/149‑1 (MQ=255) tCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCa > 4:198089/1‑90 (MQ=255) tCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCa < 3:198089/90‑1 (MQ=255) aacccgACCAGGCCACCTTGGGTGGGCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAAt > 1:153450/6‑149 (MQ=255) acccgACCAGGCCACCTTGGGTGGGCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGc < 6:235953/127‑1 (MQ=255) acccgACCAGGCCACCTTGGGTGGGCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGc > 5:235953/5‑131 (MQ=255) gACCAGGCCACCTTGGGTGGGCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCt > 1:144135/1‑149 (MQ=255) aCCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCTGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTc < 7:165073/149‑1 (MQ=255) gCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGATc < 1:33220/149‑1 (MQ=255) gCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACGTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGAt > 2:239305/1‑148 (MQ=255) acccaAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGATc < 4:275240/145‑1 (MQ=255) acccaAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGATc > 3:275240/1‑145 (MQ=255) ccaAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGATCACCAgg > 1:303403/1‑149 (MQ=255) gCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGATCACCAGGCCGATGGc > 1:102971/1‑149 (MQ=255) | GCCTTGAGGATCTTGTCCCCCAGCACCGGCTGGAGTTGCTCGATCACATAATGCAGGCAAACCGGGTCGGACAACAGTTCGTTGTGCTCTTCGGCATAGATGAGTACCGGCA‑GCGCGCCAATCTGGTTGACCAGCCCACCCAAGGTGGCCTGGTCGGGTTTGAGAGGTGT‑GAAGCGACGGCAGATTTCGTAGCTGATGCCCGCCACTTCCAGGCTACTGGCCCAGATATCGCGCAGTTTCTGCTCCACTGCCGGCGAGCGGGCATGGAAAATCTGCTCGATCACCAGGCCGATGGC > NC_002947/1622773‑1623068 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |