Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 1,693,686 | C→G | 7.7% | P52R (CCT→CGT) ‡ | PP_1489 → | CheW domain‑containing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 1,693,686 | 0 | C | G | 7.7% | 241.4 / 7.7 | 77 | P52R (CCT→CGT) ‡ | PP_1489 | CheW domain‑containing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/38); new base G (3/3); total (36/41) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.10e-01 |
TTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCT > NC_002947/1693541‑1693833 | ttGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgc > 1:286807/1‑149 (MQ=255) gCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcct > 1:238041/1‑149 (MQ=255) cAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg < 2:238041/149‑1 (MQ=255) cAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg < 7:299676/149‑1 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAcctgcctg < 2:119573/148‑1 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTgg > 1:185367/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTgg > 1:36272/1‑149 (MQ=255) aaCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTgg > 1:41029/1‑149 (MQ=255) aCTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTTCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTggg < 5:80911/149‑1 (MQ=255) tGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTc > 8:194142/1‑149 (MQ=255) cgcACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCAGGTGCCTgggcgat < 6:146792/149‑5 (MQ=255) cACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCACCCAGGCAGGTGCCTgggcgatcg < 6:30271/149‑7 (MQ=255) ccGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCggg > 4:203558/1‑148 (MQ=255) cGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCa < 8:74395/149‑1 (MQ=255) gggCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCACTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATtct < 5:119982/148‑1 (MQ=255) gAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATc > 8:256234/1‑149 (MQ=255) aaCACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCg < 4:116770/149‑1 (MQ=255) aaCACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCg > 6:187746/1‑149 (MQ=255) acCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTgg < 2:36272/149‑1 (MQ=255) acCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTgg < 2:41029/149‑1 (MQ=255) gTTGTACCTGTAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTc > 7:132678/1‑149 (MQ=255) gTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTc > 1:31601/1‑149 (MQ=255) tACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCTCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCgg < 5:322810/148‑1 (MQ=255) tACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCgg < 6:33443/148‑1 (MQ=255) ccTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCa < 2:147718/149‑1 (MQ=255) cTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCAt < 1:12535/149‑1 (MQ=255) gCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTGCTTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATc > 1:90659/1‑149 (MQ=255) cAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATc < 3:203558/147‑1 (MQ=255) cGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTg < 6:274573/148‑1 (MQ=255) gCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgcc > 5:284074/1‑149 (MQ=255) aTCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTgccgc > 2:99161/1‑149 (MQ=255) agagCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCtt < 7:194142/149‑1 (MQ=255) gagCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTg < 5:187746/149‑1 (MQ=255) agCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGa < 2:31601/149‑1 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt < 3:147801/149‑1 (MQ=255) aGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCGGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt < 6:184468/149‑1 (MQ=255) tttGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TCGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt > 4:47393/1‑144 (MQ=255) tttGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TCGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCttt < 3:47393/144‑1 (MQ=255) tGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGc > 3:6807/1‑149 (MQ=255) tGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCa < 6:130795/142‑1 (MQ=255) tGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCa > 5:130795/1‑142 (MQ=255) tGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcg > 3:150975/1‑149 (MQ=255) aGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcg < 2:185367/147‑1 (MQ=255) aGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcg < 4:150975/147‑1 (MQ=255) gCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAAc > 8:232453/1‑149 (MQ=255) gATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTg < 1:291316/122‑1 (MQ=255) aTCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCACAAGCCGATCGCCCAGGCACATACCTGGGTCGCGGGCATTCTCGACCATCGAGGCCAGCTGGTTCAGGACATCCACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGACAGACGGCGGTGCAACGCACCAGAAc > 8:283885/1‑149 (MQ=255) aaGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCAccagg > 4:211461/1‑146 (MQ=255) aaGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGc < 7:256234/149‑1 (MQ=255) aGTG‑TAGCCGCGTCAGCCGCGCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGGCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCGGGTTCCGGGCCTCGACCGTGCCGCCTTGAGCTGTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGcc < 3:47616/149‑1 (MQ=255) tg‑tTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTCGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctg < 1:99161/149‑1 (MQ=255) ttGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGATGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggt > 4:180784/1‑149 (MQ=255) gCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGATCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgc > 7:55358/1‑149 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcg > 7:64991/1‑120 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCcggcg < 8:64991/120‑1 (MQ=255) ccGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgc < 6:284074/148‑1 (MQ=255) cgTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCAGGcgggtgctggt < 3:211461/149‑1 (MQ=255) gTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGCCCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggtg > 3:72912/1‑149 (MQ=255) tCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATACTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCACCCGGCGGTGCAACGCACAAGCACCCGCctggtgctggtg > 6:109589/1‑148 (MQ=255) ccGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTa > 2:114962/1‑149 (MQ=255) ctgtCAAGCCGATCGGGCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCTTTCTCGCCCTTCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATGGACCTTGCCGCCTTGAGGTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAc < 5:150028/146‑1 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCa > 5:61673/1‑120 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCa < 6:61673/120‑1 (MQ=255) tCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTAcc > 4:192874/1‑147 (MQ=255) acgCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGGCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGa < 2:286807/145‑1 (MQ=255) aaGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGGCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAgg > 1:258442/1‑149 (MQ=255) cGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGATCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAggcggc < 8:55358/149‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCGTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggt > 4:210362/1‑132 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCctggtgctggt < 3:210362/132‑1 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGcc > 6:144395/1‑149 (MQ=255) gATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCAATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGcc > 8:93438/1‑149 (MQ=255) cgcgacccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCaa > 7:92056/6‑106 (MQ=255) cgcgacccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCaa < 8:92056/101‑1 (MQ=255) tCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGGCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTg < 8:132678/149‑1 (MQ=255) gacccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGCCCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGc > 7:262067/3‑149 (MQ=255) cccAGGCAGGTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAg > 4:25086/1‑149 (MQ=255) cccAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCGGCAg > 3:305775/1‑149 (MQ=255) aGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCtt > 8:237106/1‑149 (MQ=255) ggCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 7:237106/149‑1 (MQ=255) ggCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 7:232453/149‑1 (MQ=255) ggCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTg < 1:114962/149‑1 (MQ=255) cACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGc < 2:90659/149‑1 (MQ=255) cctgcctgGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCt < 5:144395/149‑1 (MQ=255) | TTGCAACTGCGCACCGCTCGGGCGGCGAACACCGAGGGGGCGTTGTACCTGCAGTTTCGCATCAGAGCGCAGCGTTTTGCCCTGAGCGTGCACGAGGTGATCGAAGTG‑TTGCCGCGTCAGCCGCTCAAGCCGATCGCCCAGGCACCTGCCTGGGTCGCGGGCATTCTCGCCCATCGTGGCCAGCTGGTTCCGGTCATCGACCTTGCCGCCTTGAGCTTTGGCCAGCCGGCGGTGCAACGCACCAGCACCCGCCTGGTGCTGGTGCACTACCGAGGCGGCCTGCAGCTTGGCCT > NC_002947/1693541‑1693833 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |