| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 2,234,931 | C→T | 5.2% | G14G (GGC→GGT) | uvrB → | uvrABC excinuclease protein B |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 2,234,931 | 0 | C | T | 5.2% | 238.4 / 2.1 | 76 | G14G (GGC→GGT) | uvrB | uvrABC excinuclease protein B |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/34); new base T (2/2); total (40/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.88e-01 | |||||||||||
CACCGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGGTGCTGGCG > NC_002947/2234784‑2235078 | cACCGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGc < 6:50535/148‑1 (MQ=255)cACCGTTGCAGGCGACCACACCTGTGCCTTTAAATCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGTTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCg < 7:76283/149‑1 (MQ=255) aCCGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGa > 3:262561/1‑149 (MQ=255) cGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGAcc < 5:301618/149‑1 (MQ=255) gTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGAc > 7:299612/1‑147 (MQ=255) aGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCg < 8:106512/149‑1 (MQ=255) gcgcCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAg < 4:262561/149‑1 (MQ=255) acCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCg > 4:272187/1‑149 (MQ=255) acCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCg > 6:116595/1‑149 (MQ=255) cTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAg < 4:263963/133‑1 (MQ=255) cTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAg > 3:263963/1‑133 (MQ=255) ttGAAAGTGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGTCGCCAGccggct > 4:170345/1‑128 (MQ=255) ttGAAAGTGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGTCGCCAGccggct < 3:170345/132‑5 (MQ=255) ttGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGTCGCCAGccggct > 5:23674/1‑128 (MQ=255) ttGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGTCGCCAGccggct < 6:23674/132‑5 (MQ=255) ttGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGt > 4:205853/1‑149 (MQ=255) aaaGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCg > 1:7302/1‑148 (MQ=255) ccccGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATc > 5:214035/1‑149 (MQ=255) ccGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCa < 8:13007/131‑1 (MQ=255) ccGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCa > 7:13007/1‑131 (MQ=255) ccGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATc > 3:196752/1‑147 (MQ=255) cGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAg < 3:165261/149‑1 (MQ=255) cGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgg < 3:205853/149‑1 (MQ=255) ggCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgggg < 5:116595/149‑1 (MQ=255) ggCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgggg < 8:299612/149‑1 (MQ=255) cATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGt < 1:116728/149‑1 (MQ=255) tttGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTAAAGATGCTTCAAAGCGAGGTCCATCAAGTCCTAGATCCAGCTCCTCACACGTTTAAAGCAGCCTTGCCACCAGCCCCAAGATATACGCAAGTAGGTATAAGCAATCCAGGCGGGTCTGTCg > 2:136692/1‑149 (MQ=255) gTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCAc > 5:164013/1‑147 (MQ=255) tataGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGGGGGGCTGTCg > 7:233014/1‑143 (MQ=255) tataGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCg < 8:233014/143‑1 (MQ=255) gACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGt < 1:36247/149‑1 (MQ=255) gACTAATGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGACCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACg < 1:136692/148‑1 (MQ=255) actactGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCCGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGtt > 7:40793/1‑149 (MQ=255) ctGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTACCAGCCGGCTGGCCACCAGCCCGAGGCTTTCCGCCAGTAGCACGAAGCCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGATGATc > 3:88285/1‑149 (MQ=255) gCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCggg < 6:214035/149‑1 (MQ=255) gCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGAATCGAGGCGGGGCTga > 8:56951/1‑128 (MQ=255) cTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCgggg > 4:102519/1‑149 (MQ=255) aaaTTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGt > 4:72996/1‑148 (MQ=255) aaTTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGt < 6:164013/147‑1 (MQ=255) aGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCTGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTc < 8:40793/149‑1 (MQ=255) ctgctgCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCgg < 4:196752/149‑1 (MQ=255) ctgctgCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACATTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCgg < 7:241123/149‑1 (MQ=255) ccGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGAcc > 3:67399/1‑149 (MQ=255) gcgAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCtt < 3:72996/149‑1 (MQ=255) ggTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCAt < 3:7195/88‑1 (MQ=255) ggTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCAt > 4:7195/1‑88 (MQ=255) cTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgggg < 4:194572/94‑1 (MQ=255) cTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgggg > 3:194572/1‑94 (MQ=255) cTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCg > 1:218339/1‑116 (MQ=255) cTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCg < 2:218339/116‑1 (MQ=255) cTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCAtt < 4:8476/148‑1 (MQ=255) cTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTg > 8:183012/1‑149 (MQ=255) ttCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgg > 1:232678/1‑91 (MQ=255) ttCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCgg < 2:232678/91‑1 (MQ=255) tCATGTCCGAGTTCCAGCTCGGCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGGGGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCCGACGTTGCGCGGGGTGACCGGTTCGGGAAAGACCGTCAGCATTGc > 8:171697/1‑148 (MQ=255) cATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGc < 7:183012/147‑1 (MQ=255) gTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACg > 6:189530/1‑149 (MQ=255) tCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGt > 7:211011/1‑149 (MQ=255) tCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGt > 8:50327/1‑149 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAGCGTc > 7:7635/1‑148 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAGCGTCa > 7:3166/1‑149 (MQ=255) cGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCa < 3:272187/149‑1 (MQ=255) aGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATc < 2:7302/149‑1 (MQ=255) aGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCAGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCGCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATc > 6:284397/1‑149 (MQ=255) tCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCggg < 7:40170/95‑1 (MQ=255) tCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCggg > 8:40170/1‑95 (MQ=255) acGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTcg > 1:289623/1‑115 (MQ=255) acGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTcc < 2:289623/116‑2 (MQ=255) acGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGcc > 3:253577/1‑149 (MQ=255) cGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGccc < 5:284397/149‑1 (MQ=255) ttCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGcc > 5:99741/1‑145 (MQ=255) ttCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGcc < 6:99741/145‑1 (MQ=255) cAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCt > 1:187167/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGGTg > 7:263699/1‑149 (MQ=255) gCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGACGGCTTCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCAATGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGGTGCt < 7:171697/149‑1 (MQ=255) cTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGGTGCTg < 3:102519/149‑1 (MQ=255) gCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGGTGCTGgcg > 1:291323/1‑149 (MQ=255) | CACCGTTGCAGGCGCCCACACCTGTGCCTTGAAAGCGCCCCCGAACGGGCGCATTTGGGTATAGACTACTGGCTAAATTTACAGCTGCTGCACCGCGAGGTCCTTCATGTCCGAGTTCCAGCTCGTCACACGTTTCCAGCCGGCTGGCGACCAGCCCGAGGCTATCCGCCAGTTGGTCGAAGGCATCGAGGCGGGGCTGTCGCACCAGACGTTGCTCGGGGTGACCGGTTCGGGCAAGACCTTCAGCATTGCCAACGTCATCCAGCAGGTGCAGCGCCCGACGCTGGTGCTGGCG > NC_002947/2234784‑2235078 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |