Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,280,705 | C→T | 5.9% | V615V (GTC→GTT) | fadH → | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,280,705 | 0 | C | T | 5.9% | 204.5 / 2.0 | 70 | V615V (GTC→GTT) | fadH | 2,4‑dienoyl‑CoA reductase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (33/31); new base T (2/2); total (36/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.67e-01 |
GGATCAAGGCCGAGCCGCATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCG > NC_002947/2280557‑2280852 | ggATCAAGGCCGAGCCGCATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTc < 7:108009/149‑1 (MQ=255) tCAAGGCCGAGCCGCATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAg > 8:33929/1‑149 (MQ=255) cGAGCCGCATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTgg < 8:264399/149‑1 (MQ=255) aGCCGCATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGt < 5:9324/149‑1 (MQ=255) gCCGCATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTa > 6:126686/1‑149 (MQ=255) cATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATcga < 2:232999/149‑1 (MQ=255) cTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGAt > 1:166322/1‑149 (MQ=255) tCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCt > 1:219703/1‑135 (MQ=255) tCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCt < 2:219703/135‑1 (MQ=255) tCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATg > 1:143961/1‑149 (MQ=255) gCAGGTGTACCTGCTGCAGCGCAAGAAAGCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGCGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGc < 8:113369/149‑1 (MQ=255) gtgtACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACAt < 2:166322/149‑1 (MQ=255) gtACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTc < 2:32666/149‑1 (MQ=255) tACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTc < 6:135744/148‑1 (MQ=255) ccTGTTGCAGCGCAAGAAATCCTAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCTCCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgt < 1:311680/148‑1 (MQ=255) ccTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgtg > 8:283128/1‑149 (MQ=255) ccTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCCGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgtg > 8:62518/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgtgt > 1:30320/1‑149 (MQ=255) cTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgt > 6:108346/1‑147 (MQ=255) cTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgt < 5:108346/147‑1 (MQ=255) tGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGACCATACGtgtg > 8:276243/1‑149 (MQ=255) gTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGtgtg > 6:301474/1‑148 (MQ=255) ttGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGa < 7:283128/149‑1 (MQ=255) ttGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGa < 7:62518/149‑1 (MQ=255) aGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAg > 8:4030/1‑149 (MQ=255) aTCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgt < 1:235203/130‑1 (MQ=255) aTCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgt > 2:235203/1‑130 (MQ=255) ccAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCTGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAg > 7:73424/1‑149 (MQ=255) aaGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGt < 7:276243/149‑1 (MQ=255) gggCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTgg > 8:89702/1‑149 (MQ=255) gACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCTGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGt < 8:73424/149‑1 (MQ=255) aCGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTg < 2:30320/149‑1 (MQ=255) cGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTgg < 5:301474/149‑1 (MQ=255) ggCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGa > 6:93830/1‑148 (MQ=255) gCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACgtg < 8:162066/149‑1 (MQ=255) cAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACgtgg > 6:86435/1‑149 (MQ=255) aaGANGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGcc > 5:13817/1‑122 (MQ=255) aaGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGcc < 6:13817/122‑1 (MQ=255) aaGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCATGTGCTGGCGGTGGATAACgtggt < 7:89702/149‑1 (MQ=255) acgacCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGAt > 8:179445/1‑149 (MQ=255) acgacCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGAt < 2:143961/149‑1 (MQ=255) acgacCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGAt < 1:303642/149‑1 (MQ=255) gacCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCt > 4:179543/1‑149 (MQ=255) cGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCtgtg < 5:86435/149‑1 (MQ=255) gCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGcc < 7:179445/149‑1 (MQ=255) gATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCggg > 7:246285/1‑148 (MQ=255) gATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCgg < 5:126686/147‑1 (MQ=255) aTTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCa < 7:241152/149‑1 (MQ=255) accgcaccgGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGc > 6:53049/1‑144 (MQ=255) accgcaccgGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGc > 1:109979/1‑144 (MQ=255) accgcaccgGGTTGAAGAACAACGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGTATCACGTGGTGATCTGTGCCGGGc > 4:25141/1‑144 (MQ=255) aagaaCAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgt < 6:209381/72‑1 (MQ=255) aagaaCAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCgt > 5:209381/1‑72 (MQ=255) agaaCAAGCGGGTGCAGCTGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTTTGGACGTCGGCGAGCCACAGGTGCTGGAGGTGGATAACGAGGTGATCTGTGCCGTGCAAGATCCGCTGCGCGAGATg > 2:99147/1‑149 (MQ=255) gaaCAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTGGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTg > 4:264135/1‑148 (MQ=255) aCAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGGATCGACGATGCCGGCCTGCACATACGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAg > 7:122530/1‑149 (MQ=255) aaGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAgg > 6:228493/1‑148 (MQ=255) gggggTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAg > 5:63020/1‑149 (MQ=255) tacccAGATACTCGACACTGTTGAGCATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAATGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGc > 6:107472/5‑149 (MQ=255) ggTTCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGc < 3:25141/149‑1 (MQ=255) cAGATGCGCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCCGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCtggt < 6:87647/149‑1 (MQ=255) aGATGCTCAACAGTGTGGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCtggtg < 3:264135/149‑1 (MQ=255) acTCGACACTGTTGAGCATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTggcgg > 3:78283/2‑149 (MQ=255) gacacTGTTGAGCATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAATGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTggcggtg < 5:107472/146‑3 (MQ=255) gacacTGTTGAGCATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGcggcgg < 4:78283/147‑1 (MQ=255) atcAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGgcggcg < 7:139453/145‑1 (MQ=255) aaCAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCggg > 8:18259/1‑149 (MQ=255) aaCAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCggg > 5:95372/1‑149 (MQ=255) aaCAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGAGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGgcggcg > 8:139453/1‑147 (MQ=255) tCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCg < 6:63020/149‑1 (MQ=255) tCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCg > 4:309988/1‑149 (MQ=255) | GGATCAAGGCCGAGCCGCATGCTCCGGCGCGGCAGGTGTACCTGTTGCAGCGCAAGAAATCCAAGGTGGGCGACGGGCTCGGCAAGACGACCGGCTGGATTCACCGCACCGGGTTGAAGAACAAGGGGGTGCAGATGCTCAACAGTGTCGAGTATCTGGGTATCGACGATGCCGGCCTGCACATTCGTGTGGACGGCGGCGAGCCCCAGGTGCTGGCGGTGGATAACGTGGTGATCTGTGCCGGGCAAGATCCGCTGCGCGAGCTGCAGGAAGGGCTGGTGGCGGCGGGGCAGTCG > NC_002947/2280557‑2280852 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |