Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,417,286 | C→G | 6.5% | H107Q (CAC→CAG) | PP_2119 → | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,417,286 | 0 | C | G | 6.5% | 192.7 / 3.9 | 62 | H107Q (CAC→CAG) | PP_2119 | ABC transporter permease/ATP‑binding protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (23/35); new base G (2/2); total (25/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.67e-01 |
CCGCTCCGCGCACCAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTG > NC_002947/2417139‑2417434 | ccGCTCCGCGCACCAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAcc < 6:55234/149‑1 (MQ=255) ccGCTCCGCGCACCAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAcc > 4:91585/1‑149 (MQ=255) ccGCTCCGCGCACCAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTACTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAcc > 4:109889/1‑149 (MQ=255) cTCCGCGCACCAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGa < 1:62029/149‑1 (MQ=255) cgcACCAGCTCAATGAGACGTTCTGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGTCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATc < 2:158697/146‑1 (MQ=255) aCCAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTg > 5:147317/1‑149 (MQ=255) ccAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTg > 8:94310/1‑148 (MQ=255) ccgCTCACTCCGAGCTTAGGGCTGTTCCTGATGCTGGGGCTGGCTCTGGGGGTGGGTACCTTCTGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGATCGTTGTGTGGCGGATTTCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAGGTGATCgaaga < 8:199808/144‑5 (MQ=255) cAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAGGTGATCgaagacca > 7:265622/1‑142 (MQ=255) cAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAGGTGATCgaagac < 8:265622/147‑6 (MQ=255) cAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGG‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCAGGTGATCgatga > 7:199808/1‑142 (MQ=255) gCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGc > 2:81169/1‑142 (MQ=255) gCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGc < 1:81169/142‑1 (MQ=255) aaTCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAgg > 2:143401/1‑149 (MQ=255) aaTCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAg < 4:286829/148‑1 (MQ=255) aTCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGt < 6:208119/149‑1 (MQ=255) gACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGttttt > 8:202771/1‑149 (MQ=255) aCCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGtttttt < 3:109889/149‑1 (MQ=255) aCCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGtttttt < 3:91585/149‑1 (MQ=255) cATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTc > 4:203027/1‑148 (MQ=255) gggCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGa < 3:307413/149‑1 (MQ=255) ggCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGAc < 5:235967/149‑1 (MQ=255) ttCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCTGGTTTTTTCGAGGACAACCg > 6:313550/1‑149 (MQ=255) ttCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAAc < 3:207148/147‑1 (MQ=255) tCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCg > 7:24528/1‑148 (MQ=255) gctgctgGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCt > 2:87666/1‑149 (MQ=255) ctggcgctggcgGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATc > 8:25387/1‑147 (MQ=255) ctggcgctggcgGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCa < 7:172047/149‑1 (MQ=255) tggcgctggcgGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGTAGGATTGGCGAGCGTTTTGTGGCCGATAACCTTCTTGCGGTATTCGATCACATGATCGGCCTGCACCAAGGTTTTTTCGAGGAAAACCGCAGATCCGATATCCa > 1:65881/1‑149 (MQ=255) gcgctggcgGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGtc > 4:144954/1‑149 (MQ=255) ggcgGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGc < 7:25387/149‑1 (MQ=255) cgGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTg < 3:255003/149‑1 (MQ=255) ggTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGa < 2:245525/149‑1 (MQ=255) gTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCg < 6:147317/149‑1 (MQ=255) cAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGacac < 1:143401/147‑1 (MQ=255) cAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGacac < 3:144954/147‑1 (MQ=255) aGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGAcacca < 8:24528/148‑1 (MQ=255) tCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCga > 2:225841/1‑108 (MQ=255) tCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCAGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCga < 1:225841/108‑1 (MQ=255) ggTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAg > 3:27156/1‑149 (MQ=255) gtgtCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAg < 2:65881/148‑1 (MQ=255) cGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATc < 4:237494/149‑1 (MQ=255) ggATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGt > 6:153075/1‑149 (MQ=255) ggATTGGCGAGCGTTGTGAGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGt > 6:5453/1‑149 (MQ=255) gATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGt < 5:153075/148‑1 (MQ=255) gATTGGCGAGCGTTGTGGGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGt < 5:5453/148‑1 (MQ=255) ttGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCGGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTc < 8:103600/148‑1 (MQ=255) tGGCTAGCGTTGTTTGGCCGATATCCGTCGTGCTGTCTTCGATCACCTGATAGGGCTGCACCCAGTTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGa < 5:239586/117‑1 (MQ=255) ggCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCAt < 1:87666/148‑1 (MQ=255) ggCGAGCGGTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCAt < 7:202771/148‑1 (MQ=255) gCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCaa > 1:213712/1‑131 (MQ=255) gCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCaa < 2:213712/131‑1 (MQ=255) gAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTTATCGCt > 5:170736/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCt > 8:47422/1‑149 (MQ=255) gAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCt > 5:275527/1‑149 (MQ=255) gtgGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGtt < 3:203027/149‑1 (MQ=255) tgGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTc < 6:275527/149‑1 (MQ=255) gCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCt < 6:169354/149‑1 (MQ=255) cGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAAt < 8:85407/116‑1 (MQ=255) cGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAAt > 7:85407/1‑116 (MQ=255) tCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCTGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAAc < 5:313550/149‑1 (MQ=255) cgtcgtGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGTGGACACCACCTTGCTGCAATCAGt > 4:204257/1‑113 (MQ=255) cgtcgtGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGTGGACACCACCTTGCTGCAATCAGt < 3:204257/113‑1 (MQ=255) tGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTTATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGa < 6:170736/149‑1 (MQ=255) ttCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCAt > 4:263037/1‑149 (MQ=255) ccTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGgtg < 3:263037/149‑1 (MQ=255) | CCGCTCCGCGCACCAGCTCAATCAGACCATCGGGCTGTTCCTGCTGCTGGTGCTGGCGCTGGCGGTGGGTACCTTCAGCCGTTTCTATCTGGTGTCGT‑GGATTGGCGAGCGTTGTGTGGCCGATATCCGTCGTGCGGTCTTCGATCACCTGATCGGCCTGCACCCAGGTTTTTTCGAGGACAACCGCAGCTCCGAGATCCAGTCTCGGCTGACTGCGGACACCACCTTGCTGCAATCAGTGATCGGTTCATCGCTGTCGATGTTCCTGCGCAACGCGCTGATGGTCATTGGCGGTG > NC_002947/2417139‑2417434 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |