| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 284,587 | T→A | 6.5% | intergenic (+34/+29) | betT‑II → / ← atsK | choline/carnitine/betaine transporter/alpha‑ketoglutarate‑dependent sulfonate dioxygenase |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 284,587 | 0 | T | A | 6.5% | 198.3 / 3.3 | 74 | intergenic (+34/+29) | betT‑II/atsK | choline/carnitine/betaine transporter/alpha‑ketoglutarate‑dependent sulfonate dioxygenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (35/33); new base A (3/2); total (38/36) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.20e-01 | |||||||||||
CTGAGCGAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATT > NC_002947/284440‑284729 | cTGAGCGAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTg > 4:160018/1‑149 (MQ=255) gAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCcgc > 7:221190/1‑148 (MQ=255) aaGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGT‑CTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGaa < 2:280498/149‑1 (MQ=255) aGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGaa < 1:139148/149‑1 (MQ=255) ggCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAa‑g < 5:309486/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAa‑ga < 3:160018/149‑1 (MQ=255) gCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAa‑ga < 7:150983/149‑1 (MQ=255) cAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCAGCGAA‑GAGGc > 5:76637/1‑147 (MQ=255) aTGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGaa > 7:78645/1‑135 (MQ=255) aTGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGaa < 8:78645/135‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCACCGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAgg < 5:317507/145‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAgg < 3:300912/145‑1 (MQ=255) aCCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAgg > 6:317507/1‑145 (MQ=255) aCCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAgg > 4:300912/1‑145 (MQ=255) tggtggGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTAGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGc > 5:199950/1‑149 (MQ=255) cTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAgg > 8:64574/1‑135 (MQ=255) cTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAgg < 7:64574/135‑1 (MQ=255) cTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTAGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAg > 3:5248/1‑149 (MQ=255) gCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGATCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTGGCGGGCTTGCCCGCGAA‑TAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCa < 4:98496/149‑1 (MQ=255) cAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCAt > 7:99477/1‑149 (MQ=255) gATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGa > 2:69225/1‑149 (MQ=255) atcatcAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGACCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGAAACCGAGAGAAAGGTGCATCCCCAAGGAt > 8:175308/1‑149 (MQ=255) caACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAACCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAATGAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑c < 1:69225/149‑1 (MQ=255) cATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGt < 5:144050/149‑1 (MQ=255) ccTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCa > 6:148176/1‑149 (MQ=255) tCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCAt > 8:172520/1‑148 (MQ=255) tCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCCCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCAt > 1:300797/1‑148 (MQ=255) gACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCa < 8:99477/148‑1 (MQ=255) gCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCGTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcg < 1:203373/149‑1 (MQ=255) cGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcgg < 7:172520/149‑1 (MQ=255) gCACAGCCATTACCTCCACCGGGTCCGCTGACAACGCGCCCCTGTCCTGCCGTCTGCGGGGGCTGCCCCGCTAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcggtc < 6:199950/149‑1 (MQ=255) caTGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCACGCTCTCCTGTCCTGGCCACTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTtcggtcgg > 5:290947/1‑148 (MQ=255) aTGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTcggtcggt > 1:170632/1‑148 (MQ=255) aTGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTa < 8:221190/149‑1 (MQ=255) gCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTa < 4:80046/90‑1 (MQ=255) gCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTa > 3:80046/1‑90 (MQ=255) cAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTaa < 1:124779/147‑1 (MQ=255) cACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTATTACCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑CACAGGCAACCCCTAGAAAGGTGCCTCCCCAAGGATGGT‑CGCCCCGTGCAACACCCGCCGGTTAGGTCGGTAAACATACACCg > 6:11005/1‑148 (MQ=255) cTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCaa > 8:79489/1‑148 (MQ=255) tGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACccgccg < 7:100947/121‑1 (MQ=255) tGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACccgccg > 8:100947/1‑121 (MQ=255) ggTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAAt > 5:203263/1‑149 (MQ=255) gTCCTCTGACCAAGCTCTCCTTTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGTCCGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAAt < 1:237805/149‑1 (MQ=255) cGCTGACCACGATATCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GTGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTg < 6:203263/149‑1 (MQ=255) cGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGt < 7:219716/103‑1 (MQ=255) cGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGt > 8:219716/1‑103 (MQ=255) cGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTg > 4:86170/1‑149 (MQ=255) cGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTg < 3:86170/149‑1 (MQ=255) cGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCGAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTg > 2:176185/1‑149 (MQ=255) cGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCAGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTg < 7:175308/149‑1 (MQ=255) ctcCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGa > 8:286859/1‑78 (MQ=255) ctcCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGa < 7:286859/78‑1 (MQ=255) tcctgtcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGtt < 5:11005/147‑1 (MQ=255) ctgtcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTgg > 1:206607/1‑134 (MQ=255) ctgtcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTgg < 2:206607/134‑1 (MQ=255) ctgtcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTGCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTcc > 5:271567/1‑149 (MQ=255) tcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCAcc < 2:257271/119‑1 (MQ=255) tcctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTccc < 6:290947/147‑1 (MQ=255) cctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAg > 8:126366/1‑148 (MQ=255) ctgGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGaa < 7:79489/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGcc < 6:76637/149‑1 (MQ=255) ccTCTTCGCGGGCAAGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GCCCGGCAACCGCTAGAAAGGTGCCTCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCCCCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGcc > 7:188703/1‑149 (MQ=255) ctctTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGACCGCCa > 3:193297/1‑149 (MQ=255) ctctTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCa > 2:179794/1‑149 (MQ=255) tctTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTggg > 2:57352/1‑124 (MQ=255) tctTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTggg < 1:57352/124‑1 (MQ=255) tctTCGCGGGCAAGCCCGCGAA‑GAGGCCAGGACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCa > 7:156450/1‑149 (MQ=255) ttCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCAc < 2:170632/147‑1 (MQ=255) ttCGCGGGCAAGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGt > 7:296068/1‑149 (MQ=255) gcgGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GATAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTaa > 5:308306/1‑97 (MQ=255) gcgGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GATAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTaa < 6:308306/97‑1 (MQ=255) gcgGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAAc < 3:144080/139‑1 (MQ=255) gcgGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAAc > 4:144080/1‑139 (MQ=255) cgGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCAtt > 4:305014/1‑149 (MQ=255) | CTGAGCGAAGGCAGCCAGAACTATGACCTGGTGGGCTACAGCAAGGAGCAGATCATCAACGACATCCTCGACCAGTACGAGCGGCACATGCAGTACCTGCACCTGGTCCGCTGACCAAGCTCTCCTGTCCTGGCCTCTTCGCGGGCTTGCCCGCGAA‑GAGGCCA‑GACAGGCAACCGCTAGAAAGGTGCATCCCCAAGGATGGT‑CGCCCGGTGCATCACCCGCCGGTTCGGTCGGTAATCATCCACCGCAAAATGCTGGGTCACGCGGTTGTCCCAGAACGCCACGTCATT > NC_002947/284440‑284729 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |