Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,422,357 | G→A | 8.9% | L215L (CTG→CTA) | moeA → | molybdenum::molybdopterin ligase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,422,357 | 0 | G | A | 8.9% | 125.9 / 2.4 | 45 | L215L (CTG→CTA) | moeA | molybdenum::molybdopterin ligase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (20/21); new base A (2/2); total (22/23) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
GCGGCGACCTTGGGGCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTCCACCGGAGGCGTCTCGGTGGGC > NC_002947/2422223‑2422498 | gcggcgACCTTGGGGCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTgg < 2:156541/147‑1 (MQ=255) ggcgACCTTGGGGCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGCTCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGGCAGCTgggggc > 8:94193/1‑145 (MQ=255) ggcgACCTTGGGGCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGctgctg < 4:12935/136‑1 (MQ=255) ggcgACCTTGGGGCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGctgctg > 3:12935/1‑136 (MQ=255) gggCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTggg < 7:30842/149‑1 (MQ=255) gggCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTg > 5:281019/1‑147 (MQ=255) gggCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTg < 6:281019/147‑1 (MQ=255) aTGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGc < 4:154929/149‑1 (MQ=255) cGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCg > 6:104511/1‑145 (MQ=255) cGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCg < 5:104511/145‑1 (MQ=255) cTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGt > 3:74056/1‑149 (MQ=255) ggTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGc < 7:94193/149‑1 (MQ=255) tGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGAc < 4:74056/149‑1 (MQ=255) cGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTg < 5:244575/149‑1 (MQ=255) ggTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTggg > 8:185952/1‑108 (MQ=255) ggTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTggg < 7:185952/108‑1 (MQ=255) gTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCgg < 3:124992/128‑1 (MQ=255) gTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCgg > 4:124992/1‑128 (MQ=255) gTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCa > 1:35405/1‑149 (MQ=255) ccACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTACTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCAACCTGCCAGAGGACCTGGACCGCACt > 3:247481/1‑149 (MQ=255) gCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCgcc > 3:142310/1‑149 (MQ=255) acgaACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCgcctgc > 7:112854/1‑149 (MQ=255) gccgcgCCAGGACTGCCGCCCGGGCCTGGGCAGATCTTCACCCGCCATCTCAGGCTACGGGGCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGTCATCCTGCCAGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCt < 4:247481/142‑1 (MQ=255) gAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAAc < 6:177754/148‑1 (MQ=255) gCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTgg < 4:116422/149‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTgg > 2:102745/1‑148 (MQ=255) ccAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTgg < 1:102745/148‑1 (MQ=255) ccAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGCTCAGCAGCTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTCAACTggg > 2:532/1‑149 (MQ=255) aGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTg > 3:192720/1‑149 (MQ=255) aGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTg > 7:6384/1‑149 (MQ=255) tGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTACGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCg > 4:248857/1‑147 (MQ=255) gCTCGGGCCTGGGCAGTTCTACAACAGCAATCGCTGGCTGCTGGTCAGGTGGTTGCAGCGGCTGGGTTTCGATGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGTTGACCTGGCCCGCACTCGCGCGTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGAcc < 1:532/149‑1 (MQ=255) gCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGAcc > 7:14305/1‑149 (MQ=255) ggggCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGGCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGt < 3:79705/148‑1 (MQ=255) ggCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTACTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGcc > 5:164865/1‑98 (MQ=255) ggCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTACTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGcc < 6:164865/98‑1 (MQ=255) aTCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTg > 5:267083/1‑141 (MQ=255) aTCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTg < 6:267083/141‑1 (MQ=255) cTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTTGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTCCACCGGa < 4:192720/148‑1 (MQ=255) caacaGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTCCACCGGa < 8:6384/145‑1 (MQ=255) caacaGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTACGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTCCACCgg < 3:248857/144‑1 (MQ=255) aacaGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTgg < 4:267615/115‑1 (MQ=255) aacaGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTgg > 3:267615/1‑115 (MQ=255) caGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGAc > 2:291962/1‑124 (MQ=255) caGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGAc < 1:291962/124‑1 (MQ=255) aGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGCCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTCATTCTGTCCACCGGAGGCGtctc > 5:77915/1‑149 (MQ=255) aGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTCCACCGGAGGCGTCTCGGTGGGc > 5:207949/1‑147 (MQ=255) tgctgGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTc > 6:1846/1‑121 (MQ=255) tgctgGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTc < 5:1846/121‑1 (MQ=255) | GCGGCGACCTTGGGGCATGGCCGTCTGGACGTGGTGCGCAAGGTAAAAGTGGCGGTGCTGTCCACCGGCGACGAACTGGTCGAGCCAGGCCTGCCGCTCGGGCCTGGGCAGATCTACAACAGCAATCGCAGGCTGCTGGTCAGCTGGTTGCAGCGGCTGGGTTGCGAAGTGGTCGATGCCGGCATCCTGCCGGATGACCTGGCCCGCACTCGCGCCTGCCTGGCTGAACTGGGTGGCGTAGACCTGATTCTGTCCACCGGAGGCGTCTCGGTGGGC > NC_002947/2422223‑2422498 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |