Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 2,441,371 | C→T | 7.5% | A170V (GCC→GTC) | topA → | DNA topoisomerase I |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 2,441,371 | 0 | C | T | 7.5% | 192.5 / 4.3 | 67 | A170V (GCC→GTC) | topA | DNA topoisomerase I |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (26/35); new base T (3/2); total (30/37) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.47e-01 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.48e-01 |
GAAGGGGAAGCCATTGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTTGAGCGTGAGCGTGAGATCCG > NC_002947/2441223‑2441515 | gAAGGGGAAGCCATTGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGc < 6:24018/149‑1 (MQ=255) ggggAAGCCATTGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCca < 5:92135/149‑1 (MQ=255) gAAGCCATTGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCcag > 2:58041/1‑147 (MQ=255) cATTGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGgcgc > 8:31749/1‑149 (MQ=255) aTTGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGGCATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGcgcg > 2:128286/1‑149 (MQ=255) ttGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCgcgg < 6:63782/149‑1 (MQ=255) ccTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGt > 1:146843/1‑149 (MQ=255) gCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCACGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTcc < 8:53143/149‑1 (MQ=255) aCCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTc < 4:39424/149‑1 (MQ=255) ccTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTc > 5:297112/1‑148 (MQ=255) cgcgAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGAcc < 7:31517/148‑1 (MQ=255) gAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGt > 5:239593/1‑149 (MQ=255) aGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTg < 3:39884/149‑1 (MQ=255) gCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGt > 5:10918/1‑149 (MQ=255) aTCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCgg > 5:194626/1‑149 (MQ=255) gtgggTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTa < 6:271166/147‑1 (MQ=255) gTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATg < 7:31749/149‑1 (MQ=255) acCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGcc > 8:269754/1‑149 (MQ=255) acCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGcc < 2:146843/149‑1 (MQ=255) aaGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCtgtg > 1:275971/1‑149 (MQ=255) gcgcGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTggg < 6:194626/149‑1 (MQ=255) tggtgTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGcc > 5:29557/1‑146 (MQ=255) ggtgTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGa < 7:269754/149‑1 (MQ=255) gtgtTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGGCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGa < 6:160131/148‑1 (MQ=255) tgtTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACcgc < 3:7033/107‑1 (MQ=255) tgtTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACcgc > 4:7033/1‑107 (MQ=255) ttCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTc < 6:162707/125‑1 (MQ=255) ttCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTc > 5:162707/1‑125 (MQ=255) ttCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGc > 1:26813/1‑149 (MQ=255) aaCGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGcc < 8:50855/75‑1 (MQ=255) aaCGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGcc > 7:50855/1‑75 (MQ=255) aaCGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCg > 8:5283/1‑149 (MQ=255) aaCGAAATTACCAAGAAGGACATTAAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGACCAGCAGCCGCGTCGTTTCCTCGAACGCTTGGTCGGTTACATGGTTTCGCAACTGCTGTGCGCCAAGATTGccct > 7:217917/1‑148 (MQ=255) aTTACCGAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCt < 1:14391/149‑1 (MQ=255) aTTACCAAGAATGCCATTCAGGAATCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGAGCGGCTTTTCCTCGACCGCGTGGTCGTTTAAATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCt < 8:217917/149‑1 (MQ=255) agGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGGCATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTgg < 1:128286/148‑1 (MQ=255) aTTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCgtg > 7:218016/1‑148 (MQ=255) aTTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCgtg > 7:129983/1‑148 (MQ=255) ttCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTa < 6:29557/149‑1 (MQ=255) ttCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTa < 7:5283/149‑1 (MQ=255) gCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGt < 8:132545/149‑1 (MQ=255) gCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGt < 8:128298/149‑1 (MQ=255) cTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTATGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCgt < 4:293777/136‑1 (MQ=255) cTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTATGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCgt > 3:293777/1‑136 (MQ=255) ttCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCt > 6:211772/1‑62 (MQ=255) ttCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCt < 5:211772/62‑1 (MQ=255) gCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCgg < 2:254/146‑1 (MQ=255) aGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCg < 5:181597/133‑1 (MQ=255) aGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCg > 6:181597/1‑133 (MQ=255) gCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGAt > 8:23893/1‑97 (MQ=255) gCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGAt < 7:23893/97‑1 (MQ=255) gCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGACCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCtggtg < 6:239593/149‑1 (MQ=255) tgCTGGGCATTGACCCGGTCGATGTCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGACAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGtt > 7:287920/2‑149 (MQ=255) aGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGtt < 2:26813/149‑1 (MQ=255) gCTGGGCATTGACCCGGTCGATGTCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTTGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCtggtg < 8:24923/145‑1 (MQ=255) gCTGGGCATTGACCCGGTCGATGTCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCtggtg > 7:24923/1‑145 (MQ=255) cTGGGCATTGACCCGGTCGATGTCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGtt > 5:260368/1‑147 (MQ=255) cTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTtga < 8:129983/149‑1 (MQ=255) cTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTATACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTtga < 2:275971/149‑1 (MQ=255) ggACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTtgagc > 7:63040/1‑149 (MQ=255) gACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTtgagcg > 4:308849/1‑149 (MQ=255) gACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTtgagcgtgagc < 6:10918/148‑1 (MQ=255) ccggTCGATGTCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTTGAgcgtgagcgtga < 6:260368/147‑1 (MQ=255) ggTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCg < 2:305846/95‑1 (MQ=255) ggTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCg > 1:305846/1‑95 (MQ=255) aaTGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTTGAGCGTGAGCGTGAGATCcg < 1:58041/149‑1 (MQ=255) tGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTTgagcgtgagcgt > 3:259203/1‑139 (MQ=255) tGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTTgagcgtgagcgt < 4:259203/139‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCtg < 8:217721/120‑1 (MQ=255) gCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCtg > 7:217721/1‑120 (MQ=255) | GAAGGGGAAGCCATTGCCTGGCACCTGCGCGAGGCCATCGGGGGTGACGACACCCGCTACAAGCGCGTGGTGTTCAACGAAATTACCAAGAAGGCCATTCAGGAAGCCTTCTCGCAGCCAGGCGAGCTGGACATCGACCGGGTCAATGCCCAGCAGGCGCGGCGTTTCCTCGACCGCGTGGTCGGTTACATGGTTTCGCCACTGCTGTGGGCCAAGATTGCCCGTGGTCTGTCCGCTGGCCGTGTACAGTCGGTGGCGGTGAAGCTGGTGGTTGAGCGTGAGCGTGAGATCCG > NC_002947/2441223‑2441515 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |