Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 3,078,131 | A→G | 10.2% | S379P (TCG→CCG) | PP_2688 ← | hypothetical protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 3,078,131 | 0 | A | G | 10.2% | 180.2 / 8.9 | 68 | S379P (TCG→CCG) | PP_2688 | hypothetical protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (31/30); new base G (3/4); total (34/34) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.92e-01 |
CGAACGGGCGCAGGTCGATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGTTCTTCGCT > NC_002947/3077984‑3078275 | cGAACGGGCGCAGGTCGATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAg < 7:229181/149‑1 (MQ=255) gTCGATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGccc < 1:36331/144‑1 (MQ=255) gTCGATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGccc > 2:36331/1‑144 (MQ=255) gTCGATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGAcc > 8:7750/1‑148 (MQ=255) gTCGATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGAcc > 6:16667/1‑148 (MQ=255) gATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGGGCCCGCCTCGACCaaag < 1:197647/149‑3 (MQ=255) gATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACa > 8:113640/1‑149 (MQ=255) aTGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGa < 4:193570/142‑1 (MQ=255) aTGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGa > 3:193570/1‑142 (MQ=255) tgtgACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGcc > 1:274365/1‑138 (MQ=255) tgtgACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGcc < 2:274365/138‑1 (MQ=255) gATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGccgccg > 6:313947/1‑148 (MQ=255) gCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGGGCCCGCCTCGACCaaag < 8:55909/131‑3 (MQ=255) gCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGGGCCCGCCTCGACCaaag > 7:55909/1‑129 (MQ=255) cGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGccc > 7:254882/1‑149 (MQ=255) gCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCt > 4:172394/1‑149 (MQ=255) gTCGACGAAGGTCGGTCAGGGTGACAGGCAGAGGGGCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGTAAGTCCTCGATCTGGGCGTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCTGAGCCCTgg < 8:260884/148‑1 (MQ=255) tCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTgg < 3:172394/147‑1 (MQ=255) tCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGt > 3:85302/1‑149 (MQ=255) tCGACGAAGGGCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATCGGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGt < 1:101073/149‑1 (MQ=255) cgaAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTcc < 6:140711/149‑1 (MQ=255) aGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTg < 1:157886/149‑1 (MQ=255) ggTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTg < 7:113640/148‑1 (MQ=255) cAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCggg > 7:138020/1‑147 (MQ=255) aGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAg < 4:85302/149‑1 (MQ=255) ggCACCGCGGCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTGGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGGCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAgg < 5:305055/149‑1 (MQ=255) cacaGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCt > 6:199560/1‑118 (MQ=255) acaGCGTCGGTTGAGGGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTgg < 7:7750/149‑1 (MQ=255) cGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACAAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTa > 6:171316/1‑149 (MQ=255) gTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACa < 5:16667/149‑1 (MQ=255) gTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCAGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTg < 8:113573/119‑1 (MQ=255) gTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCAGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTg > 7:113573/1‑119 (MQ=255) aGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCtt > 3:199403/1‑114 (MQ=255) aGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCtt < 4:199403/114‑1 (MQ=255) gCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGa > 2:101105/1‑149 (MQ=255) cGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGa > 3:119338/1‑148 (MQ=255) cGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGa < 8:254882/148‑1 (MQ=255) atatAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGGGCCCGCCTCGACCaaa > 1:270867/1‑77 (MQ=37) atatAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGGGCCCGCCTCGACCaaa < 2:270867/78‑2 (MQ=37) tataGGCGTGCGGGCGGTCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTcc < 2:6203/107‑1 (MQ=255) tataGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTcc > 1:6203/1‑107 (MQ=255) taGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGAt < 5:313947/148‑1 (MQ=255) gTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATccgccg < 7:100815/149‑1 (MQ=255) cgggcgggCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCt > 2:49613/1‑149 (MQ=255) gcgggcTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGc < 1:55159/149‑1 (MQ=255) gcTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCACTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCa > 6:123420/1‑149 (MQ=255) gcgcgcgGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTc > 1:274916/1‑149 (MQ=255) gcgcgGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCgg < 1:49613/149‑1 (MQ=255) cTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAg > 1:262076/1‑133 (MQ=255) cTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAg < 2:262076/133‑1 (MQ=255) cTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTc > 6:141922/1‑136 (MQ=255) cTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTc < 5:141922/136‑1 (MQ=255) aTCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTg < 4:14923/117‑1 (MQ=255) aTCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTg > 3:14923/1‑117 (MQ=255) aTCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGAt > 5:118541/1‑149 (MQ=255) gggCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGAt > 4:35097/1‑102 (MQ=255) gggCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGAt < 3:35097/102‑1 (MQ=255) ggCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTgg < 4:119338/147‑1 (MQ=255) ggCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGtt < 8:138020/149‑1 (MQ=255) atgttGGTCGGGCCCGCCTCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGtt > 1:73526/4‑148 (MQ=255) atgttGGTCGGGCCCGCCTCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGtt < 2:73526/145‑1 (MQ=255) cTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGttct > 4:45999/1‑149 (MQ=255) tttGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGttctt > 1:159624/1‑149 (MQ=255) tttGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGttctt > 1:152023/1‑149 (MQ=255) tGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGttcttc < 1:101105/148‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAg < 2:308045/92‑1 (MQ=255) gTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAg > 1:308045/1‑92 (MQ=255) tCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGTTCTTCGCt > 6:43253/1‑148 (MQ=255) | CGAACGGGCGCAGGTCGATGTGACGCGGTGCGATGCCGCTGTCGACGAAGGTCGGGCAGGTTGACAGGCACAGCGTCGGTTGAGCGATATAGGCGTGCGGGCGGGCTTTGATGCGCGCGCGGAAGTCCTCGATCTGGGCTTTGGTCGAGGCGGGCCCGACCAACATGCCATAGCCGCCGGAGCCCTGGGTTTCCTTGACCACCAGTTCGGGCAGGTGGGCCAGTACATGGGACAGATCCGCCGGCTTGCGGCACTGCCAGGTCGGCACGTTGTTCAGGATTGGTTCTTCGCT > NC_002947/3077984‑3078275 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |