| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 3,848,334 | C→G | 7.5% | A33A (GCC→GCG) | PP_3397 → | hypothetical protein |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 3,848,334 | 0 | C | G | 7.5% | 214.6 / 6.9 | 67 | A33A (GCC→GCG) | PP_3397 | hypothetical protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (32/30); new base G (2/3); total (34/33) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.73e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.41e-01 | |||||||||||
GTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGGCGCACCCGGGG > NC_002947/3848186‑3848482 | gTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGcgcc > 4:95801/1‑149 (MQ=255) cAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGtt < 6:255622/149‑1 (MQ=255) gcgcCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTcg < 4:39553/149‑1 (MQ=255) gcCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTcgcc < 2:265806/149‑1 (MQ=255) ggtggtAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCG‑GCGAACGCGGCGCTg < 7:55522/149‑1 (MQ=255) aCTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTc < 6:322661/141‑1 (MQ=255) aCTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTc > 5:322661/1‑141 (MQ=255) gAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCAGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTGTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTACGCCGCGCTGTCTCATGTCGATCCg > 1:34803/1‑149 (MQ=255) aaGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCgg < 5:126451/149‑1 (MQ=255) gctggtgcCATGAACAGACAAAGACTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGt > 8:54162/1‑131 (MQ=255) gctggtgcCATGAACAGACAAAGACTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGt < 7:54162/131‑1 (MQ=255) gcCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCG‑GCGAACGCGGCGCTggtaa > 5:265656/1‑117 (MQ=255) gcCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCG‑GCGAACGCGGCGCTggtaa < 6:265656/121‑5 (MQ=255) ccATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGCTCCGGGGCCCTACACCTTCGc > 6:187695/1‑148 (MQ=255) aTGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCG‑GCGAACGCGGCGCTgg > 7:111502/1‑114 (MQ=255) aTGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCG‑GCGAACGCGGCGCTgg < 8:111502/115‑2 (MQ=255) aTGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCca > 5:184123/1‑148 (MQ=255) gAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTg > 1:175388/1‑116 (MQ=255) gAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTg < 2:175388/116‑1 (MQ=255) aGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTgg < 5:41431/149‑1 (MQ=255) aCAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTCGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCCCAGACTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGACACAGGTGGc > 4:81491/1‑148 (MQ=255) cAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTa > 7:145174/1‑149 (MQ=255) aaaGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTgg < 3:261062/145‑1 (MQ=255) aaaGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTgg > 4:261062/1‑145 (MQ=255) aaaGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTAt > 8:90228/1‑149 (MQ=255) acgCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCCTGCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATc < 1:18848/114‑1 (MQ=255) aGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATc > 2:18848/1‑115 (MQ=255) cAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGAtgt > 7:6345/1‑149 (MQ=255) aGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGAtgt < 7:90228/148‑1 (MQ=255) ttCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTa > 1:106530/1‑148 (MQ=255) aaGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGACGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCAGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTTGGTATCCGATGTGGTACAAg > 8:297154/1‑149 (MQ=255) agcaTGAACACTTGGACGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCCGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGcc > 8:96479/1‑148 (MQ=255) gcaTGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTc < 8:145174/149‑1 (MQ=255) caTGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATg < 8:75136/86‑1 (MQ=255) caTGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATg > 7:75136/1‑86 (MQ=255) aTGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGa > 5:289117/1‑149 (MQ=255) gAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATc < 4:28643/122‑1 (MQ=255) gAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATc > 3:28643/1‑122 (MQ=255) gAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGAc > 7:150455/1‑148 (MQ=255) tCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGa > 2:60943/1‑149 (MQ=255) ccGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCCGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCtgt < 7:96479/149‑1 (MQ=255) gTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGc < 3:81491/149‑1 (MQ=255) gcTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGACTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGt > 2:214707/1‑149 (MQ=255) ggCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGt < 8:150455/148‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGt < 8:6345/148‑1 (MQ=255) ggCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTg > 2:180399/1‑149 (MQ=255) gccgccGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGACTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTg < 1:214707/148‑1 (MQ=255) ccgccgGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGc > 8:169469/1‑148 (MQ=255) gTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCtgt < 8:43448/129‑1 (MQ=255) gTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCtgt > 7:43448/1‑129 (MQ=255) tctctcTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTTTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCAc < 7:297154/148‑1 (MQ=255) tctctTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCg > 4:253686/1‑149 (MQ=255) tctTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTg > 8:108412/1‑149 (MQ=255) ttACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCTATCCGGGGCCCTACACCTTCGCca < 1:48248/66‑1 (MQ=255) ttACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCca > 2:48248/1‑66 (MQ=255) ttACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGcca < 5:292631/135‑1 (MQ=255) ttACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTg < 7:169469/147‑1 (MQ=255) ttACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTAGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGcca > 6:292631/1‑135 (MQ=255) aCCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTg < 6:47686/70‑1 (MQ=255) aCCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTg > 5:47686/1‑70 (MQ=255) aCCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTgc < 3:95801/146‑1 (MQ=255) aCCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTgc < 2:106530/146‑1 (MQ=255) ttACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCTCGGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAgg < 1:60943/149‑1 (MQ=255) ttACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGgc < 3:253686/149‑1 (MQ=255) gcgcC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCTGGCGCAcgg < 6:289117/149‑3 (MQ=255) gcgcC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGGCGCAccc > 5:149264/1‑149 (MQ=255) gcgcC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGGCGCAccc > 2:50073/1‑149 (MQ=255) gcgcC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGGCGCAccc > 2:263824/1‑149 (MQ=255) cc‑gcGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGGCGCACCCggg < 1:180399/149‑1 (MQ=255) c‑gcgTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGGCGCACCCgggg > 2:15657/1‑149 (MQ=255) | GTCACCAGCGCCAACGGTGGTAGCGACTCCGAAGACGTGGTGCTGGTGCCATGAACAGACAAAGGCTCAGCCTTCAAGGAGGCAGCATGAACACTTGGTCGCGCCGTGCGCTGTTGGCCGCCGGTTTCTCTCTTACCGTTACCAGCGCC‑GCGTTCGCCGCGCTGTCTGATGTCGATCCGGGGCCCTACACCTTCGCCACAGGTGGCTATCCGATGTGGTACAAGGACAGCCTCGACCAATCCCT‑GGAGCTGTGCCAGTCGCGTGCCACCAGCACCCGTGCGCCAGGCGCACCCGGGG > NC_002947/3848186‑3848482 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |