| Predicted mutation | |||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|
| evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
| RA | NC_002947 | 352,580 | C→G | 9.6% | A106A (GCC→GCG) | hisF → | imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF |
| Read alignment evidence... | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
| * | NC_002947 | 352,580 | 0 | C | G | 9.6% | 239.3 / 14.7 | 83 | A106A (GCC→GCG) | hisF | imidazole glycerol phosphate synthase subunit HisF |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (38/37); new base G (2/6); total (40/43) | |||||||||||
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.67e-01 | |||||||||||
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 4.10e-01 | |||||||||||
GATGGGCGCGACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGGCGCAAGCCGA > NC_002947/352434‑352725 | gATGGGCGCGACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACcgccgc > 1:31035/1‑149 (MQ=255) ggCGCGACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGgt < 7:113410/148‑1 (MQ=255) cgcgACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGtt < 5:254236/149‑1 (MQ=255) cgACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCGGCGGTGttga < 1:150438/149‑3 (MQ=255) cgACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCGGCGGTGttga < 7:234488/149‑3 (MQ=255) gACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCGGCGGTGttgat < 6:303358/149‑4 (MQ=255) gACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCGGCGGTGttgat < 8:186767/149‑4 (MQ=255) acacCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCGGCGGTGttgatc < 6:32907/149‑5 (MQ=255) acacCACGATGCATACCGTCGAGCGCATGGCGAGCCAGGTGTTGATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCATGACATCCGCAACCTGGTCATC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACGGCGGCGGTGttgatc < 8:234391/149‑5 (MQ=255) accacGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAAcc > 2:264595/1‑148 (MQ=255) ccacGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCa < 7:179673/149‑1 (MQ=255) cacGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGgt < 4:210625/138‑1 (MQ=255) cacGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAAcc > 5:132384/1‑146 (MQ=255) cacGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAA‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGgt > 3:210625/1‑138 (MQ=255) gCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGt < 6:269856/149‑1 (MQ=255) aTACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTc < 1:264595/149‑1 (MQ=255) aCCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCgg > 1:11474/1‑149 (MQ=255) ccGTCGAGCGCATGGCCAGCCTGGTTTTCATCCCTCTGTGTAGCTTGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCgg < 1:105399/149‑1 (MQ=255) gTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGa < 1:68415/149‑1 (MQ=255) cATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAGCCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGCCAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCACACCAGAGTGTGGCGGTGAG‑gcggc‑g > 2:225865/1‑148 (MQ=255) aTGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCAAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGa > 3:115927/1‑149 (MQ=255) gggCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGAGCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGAc < 1:7434/148‑1 (MQ=255) ccagGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCg < 1:265127/149‑1 (MQ=255) agGTGTTCTTGCGGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGt < 2:136850/149‑1 (MQ=255) agGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGt < 2:153425/149‑1 (MQ=255) agGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGt < 5:286386/149‑1 (MQ=255) gtgtTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGgt < 2:116271/104‑1 (MQ=255) gtgtTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGgt > 1:116271/1‑104 (MQ=255) tgtTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGGGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCGCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCg < 1:63943/149‑1 (MQ=255) aTCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGt < 5:194284/148‑1 (MQ=255) aTCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTg > 1:228919/1‑149 (MQ=255) cGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATc < 6:132384/149‑1 (MQ=255) cGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATc < 4:48481/149‑1 (MQ=255) tG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGAAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGtt > 6:167204/1‑149 (MQ=255) aCGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCACC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCTCCGCGGGGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGt > 7:263043/1‑149 (MQ=255) aCGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAGAGCGGC‑GCACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGtt < 1:38512/148‑1 (MQ=255) aCGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCTTCGtt < 5:168545/147‑1 (MQ=255) gTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGt > 4:61254/1‑136 (MQ=255) gTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGt < 3:61254/136‑1 (MQ=255) gTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCg > 3:183870/1‑148 (MQ=255) gCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGc > 3:61570/1‑148 (MQ=255) gTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGAGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGcc > 4:152957/1‑147 (MQ=255) gTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGAGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGcc > 2:199083/1‑147 (MQ=255) gACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAACGGCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGtt > 1:198179/1‑128 (MQ=255) gACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGtt < 2:198179/127‑1 (MQ=255) ccGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGATTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAgtg < 1:225865/149‑1 (MQ=255) cGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAgtgt > 5:290306/1‑149 (MQ=255) tGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTcc < 5:167204/149‑1 (MQ=255) cAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTTCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCgg < 4:157414/149‑1 (MQ=255) ggACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCCGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGc > 7:99765/1‑149 (MQ=255) tCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGt < 2:228919/149‑1 (MQ=255) cGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGtt < 8:172/111‑1 (MQ=255) cGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGtt > 7:172/1‑111 (MQ=255) gCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGaa < 1:10341/149‑1 (MQ=255) aaCCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAgc > 5:266908/1‑149 (MQ=255) cAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCt > 3:202914/1‑149 (MQ=255) aaC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTg < 6:123545/149‑1 (MQ=255) aaC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTg > 5:123545/1‑149 (MQ=255) aaC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGATTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCgcgcag > 2:82713/1‑147 (MQ=255) cGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTgg > 8:171407/1‑145 (MQ=255) tGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGAttt < 2:31035/149‑1 (MQ=255) tGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGAGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGAttt < 3:152957/149‑1 (MQ=255) ccGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGAtttt < 6:266908/148‑1 (MQ=255) cGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTtca < 2:11474/149‑1 (MQ=255) gACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTtcac > 7:256713/1‑149 (MQ=255) gACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTtcac > 3:251950/1‑149 (MQ=255) aCAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTAAACACAGAGTTAGTCGGTGAG‑GCGGA‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTCTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGAGCTGGGACAGTTtcact > 6:90767/1‑149 (MQ=255) tctcGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTtca < 8:255098/141‑1 (MQ=255) tctcGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTtca > 7:255098/1‑141 (MQ=255) tctcGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCAcggc > 1:281385/1‑149 (MQ=255) ctcGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGACGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCAcggcg > 1:40688/1‑149 (MQ=255) ggttgaaCACCGCGGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGCGGGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCAcggcgg > 1:78888/6‑149 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCTTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTTTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCAcggcgg < 4:115927/147‑1 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGga < 1:318195/129‑1 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGga > 2:318195/1‑129 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACggcgggc > 7:21429/1‑149 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACggcgggc > 2:195684/1‑149 (MQ=255) gATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTCCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAACCGACGCTCTgg > 2:316493/1‑127 (MQ=255) ttgaaCACCGCGGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACggcgggcg > 6:172327/4‑149 (MQ=255) aTCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACggcgggcg > 1:177075/1‑149 (MQ=255) aaCACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGgcgc > 1:84421/1‑147 (MQ=255) aaCACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGgcgc > 5:303223/1‑147 (MQ=255) cacCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGGCGCAAGc < 1:195684/149‑1 (MQ=255) cacCGCCGCGGTGTTCAACACAGAGTTTGTCGGTGAG‑TAATA‑TAAAACTTTCGATTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGACGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGGCGCAAGc > 8:19074/1‑149 (MQ=255) ccgccgCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGGCGCAAGCCg > 6:89317/1‑149 (MQ=255) cgccgcGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGGCGCAAGCCGa > 2:74622/1‑149 (MQ=255) | GATGGGCGCGACACCACGCTGCATACCGTCGAGCGCATGGCCAGCCAGGTGTTCATCCCGCTG‑ACGGTTGGTGGTGGCGTGCGGACCGTGCAGGACATCCGCAACCTGCTCAAC‑GCCGGTGCCGACAAGGTCTCGATCAACACCGCCGCGGTGTTCAACCCAGAGTTTGTCGGTGAG‑GCGGC‑GGACCGTTTCGGTTCGCAGTGCATCGTTGTCGCCATCGATGCCAAGAAAGTGTCCGGGCCAGGTGAAGCGCCGCGCTGGGAGATTTTCACTCACGGCGGGCGCAAGCCGA > NC_002947/352434‑352725 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |