Predicted mutation | |||||||
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evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,446,491 | G→C | 6.3% | Y358* (TAC→TAG) | nicC ← | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,446,491 | 0 | G | C | 6.3% | 204.5 / 3.7 | 63 | Y358* (TAC→TAG) | nicC | 6‑hydroxynicotinate 3‑monooxygenase |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (29/30); new base C (2/2); total (31/32) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.06e-01 |
CCTTGCCGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATGG > NC_002947/4446344‑4446636 | ccTTGCCGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTg > 4:300286/1‑148 (MQ=255) ccATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAg < 8:184859/149‑1 (MQ=255) tAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTCTACAGCCAggaa < 3:45692/149‑3 (MQ=255) aGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGgtgt < 2:318160/149‑1 (MQ=255) cgcAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTg < 4:216566/149‑1 (MQ=255) aGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAg > 6:128613/1‑140 (MQ=255) aGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAg < 5:128613/140‑1 (MQ=255) gTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGtt < 3:300286/149‑1 (MQ=255) gTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGtt < 2:80821/149‑1 (MQ=255) aTGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGa < 3:297514/149‑1 (MQ=255) gCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTg > 4:100255/1‑141 (MQ=255) gCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTg < 3:100255/141‑1 (MQ=255) gCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATa < 2:234292/139‑1 (MQ=255) gCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATa > 1:234292/1‑139 (MQ=255) cATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCCTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCt > 6:109966/1‑149 (MQ=255) aTTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTg > 6:80381/1‑149 (MQ=255) gcgcTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGAt > 2:272468/1‑149 (MQ=255) cTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTCTACAGCCAgga < 7:289046/115‑2 (MQ=255) cTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTCTACAGCCAgga > 8:289046/1‑114 (MQ=255) tGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGccc > 1:300331/1‑149 (MQ=255) aCGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGCATGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCg > 1:241758/1‑149 (MQ=255) ccaGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCg > 3:160186/1‑148 (MQ=255) ccaGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCg < 4:160186/148‑1 (MQ=255) gCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTg > 7:166301/1‑149 (MQ=255) gCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGACCCAGGTCTTGGCGTTCGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTATGCGATTg > 4:206093/1‑149 (MQ=255) acgaAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCt > 2:209971/1‑149 (MQ=255) acgaAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCCTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCt < 5:109966/149‑1 (MQ=255) gaAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGc < 5:288585/128‑1 (MQ=255) gaAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGc > 6:288585/1‑128 (MQ=255) aGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCAt < 5:80381/149‑1 (MQ=255) aGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCAt < 1:209971/149‑1 (MQ=255) ggTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATa > 5:280126/1‑149 (MQ=255) gCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGc > 6:177775/1‑140 (MQ=255) gCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGc < 5:177775/140‑1 (MQ=255) gCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACaa > 4:280873/1‑149 (MQ=255) aTGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAAcgc < 2:241758/148‑1 (MQ=255) tGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGtt > 4:190304/1‑132 (MQ=255) tGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGtt < 3:190304/132‑1 (MQ=255) ccgccTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAAACCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAAc > 2:238758/1‑149 (MQ=255) gccTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTCCGCTTGGCTTCATACAACGCGAACGc > 7:79675/1‑149 (MQ=255) cccGCTTTAAAGCTCC‑TGCCCATAGAGGACGTAGACGTAAACACAGGCTGGATCTTCCTTGCTGTAGAGCCAGGTGATGTCGTTGGATACCGAATGCACCTGCGATGCCATCTCTTTGCGCTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGc > 2:314454/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCg > 5:91625/1‑149 (MQ=255) ccGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGGGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCg > 7:67153/1‑149 (MQ=255) cTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCggtg < 8:166301/149‑1 (MQ=255) tCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCggtggt < 6:286098/148‑1 (MQ=255) aGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACAGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAAc > 8:25318/1‑132 (MQ=255) aGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACAGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAAc < 7:25318/132‑1 (MQ=255) ctgc‑tgCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACa < 4:280966/149‑1 (MQ=255) cccATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGc < 6:229364/85‑1 (MQ=255) cccATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGc > 5:229364/1‑85 (MQ=255) cccATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCgg > 6:199293/1‑149 (MQ=255) cccATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCg < 6:280126/148‑1 (MQ=255) cATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTc > 4:45579/1‑109 (MQ=255) cATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTc < 3:45579/109‑1 (MQ=255) cATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCTGACAGCCCGGtc < 1:314454/149‑1 (MQ=255) gagGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCt > 1:82136/1‑149 (MQ=255) cGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCgg < 2:82136/149‑1 (MQ=255) cAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGGGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCAt < 8:67153/149‑1 (MQ=255) ggCTGGATCTTCCTGGCTGTAGCGCCAGGTGTTGGCGTTGGATCCCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACATCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATgg < 3:206093/149‑1 (MQ=255) caacaccTGGCTCTACAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGt > 5:136460/6‑149 (MQ=255) tCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTACGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACCCGAACGACGTGCGGTGGTCGGACAGACCGGTCTCCTGCAGGCACAGTGTCACCATCGCcgagac > 4:81178/1‑145 (MQ=255) cTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGa < 2:300331/149‑1 (MQ=255) gCTGTTGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATTGCGATTTCACCTGCGATGCGCGCTGTTTGCTGTTGGCTTCATACAACGCGTACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCTGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATg < 3:81178/148‑1 (MQ=255) gCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATgg > 4:11977/1‑149 (MQ=255) | CCTTGCCGCCATAGCGCAGGTAATGCTGGCGGATGCCATTGGCGCTGACGTTACCACCAGCGACGAAGGTGCTCATGCCGCCTCCCCGCTTTCAAGCTGC‑TGCCCATAGAGGTCGTAGCCGTAAACCCAGGCTGGATCTTCCTGGCTGTAGAGCCAGGTGTTGGCGTTGGATACCGATTGCACCTGCGATGCCCGCTCTTTGCGGTTGGCTTCATACAACGCGAACGCCGTGCGGTGGTCGGACAGCCCGGTCTCCTGCAGGCAGCGGGTCAGCATGGCCGCGTCCTCGATGG > NC_002947/4446344‑4446636 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |