Predicted mutation | ||||||
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evidence | seq id | position | mutation | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 6,013,885 | T→C | intergenic (+90/+20) | xpt → / ← PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
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seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 6,013,885 | 0 | T | C | 100.0% | 96.1 / NA | 29 | intergenic (+90/+20) | xpt/PP_5266 | xanthine phosphoribosyltransferase/acetyl‑CoA hydrolase family protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (18/11); total (18/11) |
AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCG > NC_002947/6013740‑6014020 | aaTCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCAAGCCCCCGCCCAAAGGTGGAGGAAAGGTCTCGCACCGGTTGGCGGAACGGTGGGAGCCG‑GCCTGCCCGc > 7:249381/1‑148 (MQ=255) aaGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCCAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACTCCCGCTCACACAGTTGAAGCACATGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCTTTCCCGCGAATGGACGCAACCCTTTTATCTGGtt < 2:320059/148‑1 (MQ=255) aGCTTCATCTAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACCGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGTAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGc < 2:202622/148‑1 (MQ=255) cATCCAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGGACCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaa < 1:282725/147‑1 (MQ=38) aaTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCCCAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCGGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCGTTTATCTGGTTGCCGCCCGCCCCGCcaacaacca > 8:349458/1‑145 (MQ=37) aaTAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCcaacaacaa < 7:349458/147‑1 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGaagcag < 8:94249/81‑5 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGaagcag > 7:94249/1‑77 (MQ=255) gggCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGc > 2:108964/1‑149 (MQ=255) aCGCCCGCTCCCACATGTGCAGCACAGGGCTCGAACGCGGTGCCGTACCTGGGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCGGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCt < 8:249381/149‑1 (MQ=39) cccGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCg > 6:283899/1‑149 (MQ=255) tCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCCACACCAGGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGc > 3:41330/1‑149 (MQ=255) acaGGTACGGCACAGCGTTCGAGACCTGTGCTGCACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGcccc > 1:223799/1‑148 (MQ=21) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcg > 7:146635/1‑107 (MQ=255) gTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAgcg < 8:146635/107‑1 (MQ=255) cagcaCAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCAt > 4:323003/1‑149 (MQ=255) 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cTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTc < 1:108964/149‑1 (MQ=255) tgCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCAt < 8:195856/148‑1 (MQ=255) ccGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATAcc > 3:239663/1‑149 (MQ=255) tgtgGGAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCgg > 5:199205/1‑149 (MQ=255) gAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg < 3:47233/149‑1 (MQ=255) gAGCGG‑GCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCACg > 7:50292/1‑149 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg > 7:115138/1‑143 (MQ=255) gCGTGCCCGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCg < 8:115138/143‑1 (MQ=255) | AATCGCTGGCCCGGGTGAAGTCGCTGGAAGGTGGTGTGGTCAGCTTCATCGAATAAACGCGACACCTGCTTCGCGGGCACGCCCGCTCCCACAGGTGCAGCACAGGTCTCGAACGCTGTGCCGTACCTGTGGGAGCGG‑GCGTGCCTGCGAATGGCCGCAACCCTTTTATCTGGTTGCCGCCAGCCCCGCCAACAACAAGCGCTGGTAAAGTTCTTCTTTAAGCCCCTGCGGCTGCCCCAACTGCATCCGCCCCAGGTGGCTTTCATACCCCTCCGGCCCCG > NC_002947/6013740‑6014020 |
Alignment Legend |
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Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |