Predicted mutation | |||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|
evidence | seq id | position | mutation | freq | annotation | gene | description |
RA | NC_002947 | 4,950,194:1 | +C | 10.7% | coding (150/969 nt) | fliM ← | flagellar biosynthesis switching/energizing protein |
Read alignment evidence... | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | ref | new | freq | score (cons/poly) | reads | annotation | genes | product | ||
* | NC_002947 | 4,950,194 | 1 | . | C | 10.7% | 265.4 / 29.0 | 75 | coding (150/969 nt) | fliM | flagellar biosynthesis switching/energizing protein |
Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (32/35); new base C (4/4); total (36/39) | |||||||||||
Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 | |||||||||||
Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.68e-01 |
GTACAGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGACAGCAGGTCCTGTACGG > NC_002947/4950053‑4950339 | gTACAGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTC‑GCATGCCGAccct < 6:244068/149‑2 (MQ=255) aCAGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATg < 3:300115/140‑1 (MQ=255) aCAGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATg > 4:300115/1‑140 (MQ=255) aGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCAc < 7:235957/149‑1 (MQ=255) aGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTC‑GCATGCCGAccc < 4:209177/144‑1 (MQ=255) aGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTC‑GCATGCCGAccc > 3:209177/1‑144 (MQ=255) gCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACg > 4:197242/1‑149 (MQ=255) aGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTC‑GCATGCCGAccct < 2:71672/141‑2 (MQ=255) aGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTC‑GCATGCCGAccct > 1:71672/1‑140 (MQ=255) tGCACGTATTCGTCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACg < 7:230690/149‑1 (MQ=255) cACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGt > 7:152286/1‑149 (MQ=255) cACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGt > 4:222657/1‑149 (MQ=255) aCGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTc > 3:15773/1‑149 (MQ=255) aCGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTc > 4:67185/1‑149 (MQ=255) gTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCt < 3:222657/149‑1 (MQ=255) aTTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGa > 4:52020/1‑149 (MQ=255) aTTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTAGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGa > 5:29158/1‑149 (MQ=255) ttCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGa < 3:67185/148‑1 (MQ=255) gCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACgg > 4:211691/1‑139 (MQ=255) gCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACgg < 3:211691/139‑1 (MQ=255) gCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTgg > 1:225341/1‑149 (MQ=255) ccGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGt > 4:226514/1‑149 (MQ=255) cagAACTTCATGACCTGCACGCCACCGACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGATGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCCCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGt < 1:250812/147‑1 (MQ=255) gAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCa < 3:197242/149‑1 (MQ=255) aCTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAgg < 3:226514/149‑1 (MQ=255) cTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGa < 4:241280/139‑1 (MQ=255) cTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGa > 3:241280/1‑139 (MQ=255) aTGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCg > 6:46229/1‑147 (MQ=255) tGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACCAGTCAggaccgta < 6:176014/149‑7 (MQ=255) cTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCttt > 5:38945/1‑149 (MQ=255) cTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCATTGATCATTTCCAGGGTC‑GCATGCCGAccct > 3:289149/1‑112 (MQ=255) cTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCATTGATCATTTCCAGGGTC‑GCATGCCGAccct < 4:289149/113‑2 (MQ=255) tGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCtttt > 3:57463/1‑149 (MQ=255) gCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCtttt > 6:3805/1‑148 (MQ=255) cACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCtttt < 5:112289/147‑1 (MQ=255) cACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGa < 2:225341/149‑1 (MQ=255) gCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCt > 4:102076/1‑122 (MQ=255) gCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCt < 3:102076/122‑1 (MQ=255) ccacccacGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGGCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGGCAGGTCGTAGCTTTTGATACt < 3:220287/149‑1 (MQ=255) cacccacGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTg > 5:256324/1‑149 (MQ=255) gCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTc > 7:57265/1‑149 (MQ=255) ccACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCg > 3:51537/1‑149 (MQ=255) agcggagcggCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGc > 5:240944/1‑147 (MQ=255) agcggagcggCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGc < 6:240944/147‑1 (MQ=255) cggagcggCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGCCCCCGCACGAGACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCAAGGCTCGGATGCActc > 5:292143/1‑149 (MQ=255) cggagcggCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTg < 5:228995/131‑1 (MQ=255) cggagcggCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTg > 6:228995/1‑131 (MQ=255) gcagGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCAc > 7:194872/1‑148 (MQ=255) cagGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCa < 2:196728/149‑1 (MQ=255) gAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCcg < 8:57265/148‑1 (MQ=255) aTGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATTCTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCgtcgtc < 4:57463/149‑1 (MQ=255) tGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGtcgtcg < 6:38945/149‑1 (MQ=255) gCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGa > 8:84351/1‑149 (MQ=255) gggTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGc < 7:84351/149‑1 (MQ=255) gCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAggg < 4:15773/149‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAggg > 6:166073/1‑148 (MQ=255) cGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAgg < 8:247993/147‑1 (MQ=255) cGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAgg > 7:247993/1‑147 (MQ=255) ggCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCAt < 5:3805/149‑1 (MQ=255) gAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATg > 8:128440/1‑98 (MQ=255) gAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATg < 7:128440/98‑1 (MQ=255) aGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGAtt < 3:52020/149‑1 (MQ=255) ttGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTg < 4:51537/149‑1 (MQ=255) gATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTgg < 5:46229/148‑1 (MQ=255) gATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTgg > 4:109252/1‑148 (MQ=255) gATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTgg < 6:256324/148‑1 (MQ=255) tCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGa > 5:20373/1‑148 (MQ=255) tCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGa > 1:209210/1‑148 (MQ=255) tCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGAc < 8:194872/149‑1 (MQ=255) tCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGCCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGa > 2:264987/1‑148 (MQ=255) ttCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGAcag > 5:282796/1‑147 (MQ=255) ccATGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCAc < 8:210627/94‑1 (MQ=255) ggggTC‑GCATGCCGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGACAGCAGGTc > 4:63014/2‑149 (MQ=255) 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g‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGACAGCAGGTCCTGTa > 3:89248/1‑143 (MQ=255) | GTACAGCGAGTGCACGTATTCGCCGAACTTCATGACCTGCACGCCACCCACGGCCACGTCAGCGGAGCGGCGCAGCAGGTTGAACATGCTGATACGGGTATAGCGGGCGAAGCGCTCGTTGATCATTTCCAGGGTCGGCATG‑CGACCCCGCACGATACGGTCCTGACTGGTCAGGTCGTAGCTTTTGATACTGCCAGGCTCGGATGCACTCTCGGTCTGCACCAGCCCGTCGTCGACGCCATGCAACAGGGCATCGATTTCATCCTGGGACAGCAGGTCCTGTACGG > NC_002947/4950053‑4950339 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |